მთავარი განსხვავება მიზანმიმართულ და არამიზნობრივ პროტეომიკას შორის არის ის, რომ მიზნობრივი პროტეომიკა მიზნად ისახავს კონკრეტული ცილის სიმრავლის გაზომვას, ხოლო არამიზნობრივი პროტეომიკა არ მიზნად ისახავს კონკრეტულ პროტეინს.
პროტეომიკა არის ცილების, მათი სტრუქტურებისა და ფუნქციების ფართომასშტაბიანი შესწავლა. ის სწავლობს მთელ ცილოვან კომპლემენტს უჯრედში, ქსოვილში ან ორგანიზმში კონკრეტულ პირობებში. არსებობს ორი სახის პროტეომიკა, როგორც მიზნობრივი პროტეომიკა და არამიზნობრივი პროტეომიკა.
რა არის მიზნობრივი პროტეომიკა?
როგორც მისი სახელი მიუთითებს, მიზნობრივი პროტეომიკა მიზნად ისახავს სპეციფიკურ პროტეინს ან პეპტიდს ცილების კომპლექსურ ნარევში ანალიზისთვის.შემდეგ ის აანალიზებს წინასწარ შერჩეული სპეციფიკური ცილის არსებობას და რაოდენობას. ეს მეთოდი შესაძლებელია მხოლოდ ერთი ნიმუშისთვის ან რამდენიმე ნიმუშისთვის. ეს მეთოდი შესაფერისია ცილების კონკრეტული ჯგუფისთვისაც კი. ეს იწვევს უფრო ზუსტ, რაოდენობრივ და მგრძნობიარე მონაცემებს. უფრო მეტიც, მასობრივი სპექტრომეტრია, მიზანმიმართულ პროტეომიკებთან ერთად, უფრო ზუსტ სანდო გაზომვებს იძლევა. ეს მეთოდი იყენებს სამმაგი ოთხპოლუსიანი მასის სპექტრომეტრს (QQQ) მისი ანალიზისთვის.
სურათი 01: პროტეომიკა
მიზანმიმართული პროტეომიკა არის შესაფერისი მეთოდი, თუ გსურთ გადაამოწმოთ, არის თუ არა დარტყმული სამიზნე, ან როდესაც გსურთ განსაზღვროთ კონკრეტული ცილა/პეპტიდი სისხლის შრატში, ცერებრალური სითხეში ან უჯრედის ლიზატში და ა.შ. გამოიყენეთ იგი, თუ გსურთ შეამოწმოთ არის თუ არა კონკრეტული ცილა განსხვავებულად გამოხატული ნიმუშებში თუ დროის კურსის ექსპერიმენტის დროს.
რა არის არამიზნობრივი პროტეომიკა?
მიზანმიმართული პროტეომიკა, როგორც სახელწოდებაშია აღნიშნული, არ მიზნად ისახავს კონკრეტულ პროტეინს ან პეპტიდს მისი ანალიზისთვის. Discovery proteomics არის არამიზნობრივი პროტეომიკის სხვა სახელი. სინამდვილეში, ეს უფრო "გლობალური" ანალიზია. ზოგადად, არამიზნობრივი პროტეომიკის შესრულება არის პასუხის გაცემა კითხვაზე "რა ცილა ან ცილებია ამ ნიმუშში ან მრავალ ნიმუშში?". ეს მეთოდი არ არის მგრძნობიარე, როგორც მიზნობრივი პროტეომიკა. მაგრამ მას შეუძლია მრავალი ცილის იდენტიფიცირება და გაზომვა, ახალი ცილების ჩათვლით. არამიზნობრივ პროტეომიკას შეუძლია წარმოქმნას როგორც რაოდენობრივი, ასევე ხარისხობრივი გაზომვები.
რა მსგავსებაა მიზანმიმართულ და არამიზნობრივ პროტეომიკას შორის?
- როგორც მიზანმიმართული, ისე არამიზნობრივი პროტეომიკა ზომავს ცილებს ნიმუშებში.
- ისინი მნიშვნელოვანია პროტეომის ანალიზში.
- ეს მეთოდები იყენებს მასის სპექტრომეტრიას.
რა განსხვავებაა მიზანმიმართულ და არამიზნობრივ პროტეომიკას შორის?
პირველ რიგში, მიზნობრივი პროტეომიკა არის კონკრეტული ცილის ან პეპტიდის არსებობისა და რაოდენობის განსაზღვრა ცილების კომპლექსურ ნარევში. ამის საპირისპიროდ, არამიზნობრივი პროტეომიკა არის ნიმუშში ან ნიმუშებში არსებული ცილების რაოდენობრივი და ხარისხობრივი შესწავლა კონკრეტული პროტეინის დამიზნების გარეშე. მიზნობრივი პროტეომიკა ხორციელდება წინასწარ შერჩეული ან მიზანმიმართული ცილებით, ხოლო არამიზნობრივი პროტეომიკა ტარდება ამ ნიმუშში ცილების ტიპების გასარკვევად. უფრო მეტიც, მიზნობრივი პროტეომიკა უფრო მგრძნობიარეა, ვიდრე არამიზნობრივი პროტეომიკა.
რეზიუმე – მიზნობრივი წინააღმდეგ არამიზნობრივი პროტეომიკა
შესაჯამებლად, მიზანმიმართული და არამიზნობრივი პროტეომიკა არის ცილის კვლევების ორი ტიპი. როგორც მათი სახელები გვთავაზობს, მიზანმიმართული პროტეომიკა მიზნად ისახავს კონკრეტულ პროტეინს, ხოლო არამიზნობრივი პროტეომიკა არ მიზნად ისახავს კონკრეტულ პროტეინს.ეს არის განსხვავება მიზანმიმართულ და არამიზნობრივ პროტეომიკას შორის.
