ძირითადი განსხვავება – Exome vs Transcriptome
გენი შეიცავს მასში კოდირებულ და არაკოდირებულ რეგიონებს. კოდირებადი თანმიმდევრობები ცნობილია როგორც ეგზონები, ხოლო არაკოდიციური თანმიმდევრობები ცნობილია როგორც ინტრონები. გენის ეგზონების ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა წარმოადგენს გენის გენეტიკურ კოდს კონკრეტული ცილის სინთეზისთვის. აქედან გამომდინარე, ეგზონები რჩება mRNA მოლეკულაში. გენომის მთლიანი ეგზონის რეგიონი ცნობილია როგორც ეგზომი და ის გენომის მნიშვნელოვანი ნაწილია. გენების გენეტიკური კოდი გარდაიქმნება mRNA მოლეკულის გენეტიკურ კოდში, რომელიც საჭიროა ცილის წარმოებისთვის. მთლიანი mRNA მოლეკულები, რომლებიც ტრანსკრიბირებულია უჯრედში ან უჯრედის პოპულაციაში, ცნობილია როგორც ტრანსკრიპტომი.ეგზომსა და ტრანსკრიპტომს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ ეგზომი წარმოადგენს გენომის ეგზონის რეგიონების თანმიმდევრობებს, ხოლო ტრანსკრიპტომი წარმოადგენს უჯრედის ან ქსოვილის მთლიან მრნმ-ს მოცემულ დროს.
რა არის Exome?
გენები შედგება ეგზონების, ინტრონებისა და მარეგულირებელი თანმიმდევრობებისაგან. ეგზონები არის გენის რეგიონები, რომლებიც ტრანსკრიფციის დროს გადაიწერება mRNA თანმიმდევრობაში. ინტრონები და სხვა არაკოდირების რეგიონები ამოღებულია ტრანსკრიფციის დროს. ეგზონების ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა განსაზღვრავს გენის გენეტიკურ კოდს, რომელიც ასინთეზებს მის მიერ კოდირებულ სპეციფიკურ პროტეინს. ცილის mRNA-ში რჩება მხოლოდ ეგზონები. გენომში ეგზონების კოლექცია ცნობილია როგორც ორგანიზმის ეგზომი. ის წარმოადგენს გენომის ნაწილს, რომელიც გამოხატულია გენებში. ადამიანებში ეგზომი გენომის 1%-ს შეადგენს. ეს არის ადამიანის გენომის პროტეინის კოდირების ნაწილი.
სურათი 01: Exome
რა არის ტრანსკრიპტომი?
ტრანსკრიპტომი არის ყველა ცილის კოდირებადი და არაკოდიციური ტრანსკრიპტის (რნმ) ერთობლიობა მოცემულ ქსოვილში. ტრანსკრიპტომი წარმოადგენს მთლიანი mRNA მოლეკულების კრებულს, რომლებიც გამოხატულია გენების მიერ უჯრედში ან ქსოვილში. უჯრედის ტრანსკრიპტომი შეიძლება შეიცვალოს სხვა ტიპის უჯრედის ტრანსკრიპტომით. ტრანსკრიპტომი ასევე დინამიურია - ის იცვლება დროთა განმავლობაში როგორც შიდა, ისე გარეგანი სტიმულის საპასუხოდ. ტრანსკრიპტომი შეიძლება შეიცვალოს იმავე ქსოვილში ან იმავე ტიპის უჯრედშიც კი რამდენიმე წუთის შემდეგ.
ტრანსკრიპტომი განსხვავდება ორგანიზმის ეგზომისგან. ტრანსკრიპტომი მოიცავს მხოლოდ გამოხატულ ეგზომის თანმიმდევრობებს. მიუხედავად იმისა, რომ უჯრედის ეგზომი იგივე რჩება, ტრანსკრიპტომი განსხვავდება უჯრედებს შორის, რადგან გენის გამოხატულება არ არის ერთნაირი ყველა უჯრედისთვის ან ქსოვილისთვის. მხოლოდ არსებითი გენები არის გამოხატული სხვადასხვა უჯრედებსა და ქსოვილებში.გენის გამოხატვა არის ქსოვილის ან უჯრედის ტიპის სპეციფიკური პროცესი. იგი რეგულირდება სხვადასხვა ფაქტორებით, მათ შორის გარემო ფაქტორებით. ამიტომ, ტრანსკრიპტომი შეიძლება განსხვავდებოდეს გარე გარემო პირობების მიხედვით.
ტრანსკრიპტომი გამოიყენება როგორც წინამორბედი პროტეომიკის კვლევებისთვის. ყველა ცილა მიღებულია mRNA თანმიმდევრობიდან. თარგმანის მოდიფიკაციამ შეიძლება გამოიწვიოს ცილების ცვლილებები. თუმცა, ტრანსკრიპტომი იძლევა მნიშვნელოვან საბაზისო ინფორმაციას პროტეომიური კვლევებისთვის.
სურათი 02: ემბრიონის ღეროვანი უჯრედების ტრანსკრიპტომი
რა განსხვავებაა Exome-სა და Transcriptome-ს შორის?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome არის გენების ცილის კოდირების რეგიონის კოლექცია. | ტრანსკრიპტომი არის ყველა ტრანსკრიფირებული რნმ-ის კოლექცია mRNA-ს ჩათვლით. |
| ნიმუში | |
| Exome შესწავლილია დნმ-ის ნიმუშის გამოყენებით. | ტრანსკრიპტომი შესწავლილია რნმ-ის ნიმუშის გამოყენებით. |
| შესწავლის მეთოდი | |
| მთელი ეგზომის თანმიმდევრობა არის ეგზომის შესწავლის მეთოდი. | რნმ-ის თანმიმდევრობა არის ტრანსკრიპტომის შესწავლის მეთოდი. |
შეჯამება – Exome vs Transcriptome
ეგზონები არის გენების კოდირების თანმიმდევრობა და განსაზღვრავს ცილების mRNA თანმიმდევრობებს. ამ კოდირების თანმიმდევრობების (ექსონების) კოლექცია ცნობილია როგორც ორგანიზმის ეგზომი. გენები გადაიწერება mRNA მოლეკულებში ცილების დამზადებამდე. უჯრედის ან ქსოვილის მთლიანი mRNA მოლეკულები ნებისმიერ დროს ცნობილია როგორც ტრანსკრიპტომი.ტრანსკრიპტომი წარმოადგენს გენებს, რომლებიც აქტიურად გამოხატულია mRNA-ში ნებისმიერ დროს. ტრანსკრიპტომი არის უჯრედისა და ქსოვილის სპეციფიკური და გავლენას ახდენს გარემო პირობებზე. ეს არის განსხვავება ეგზომსა და ტრანსკრიპტომს შორის.
