ძირითადი განსხვავება – VNTR vs STR
დნმ-ის კვლევებს უდიდესი სარგებლობა აქვს ფილოგენეტიკური ურთიერთობების გაგებაში და განსაზღვრაში, გენეტიკური დაავადებების დიაგნოსტირებასა და ორგანიზმის გენომის რუქების შედგენაში. დნმ-ის ანალიზთან დაკავშირებული რამდენიმე ტექნიკა გამოიყენება კონკრეტული გენის ან დნმ-ის თანმიმდევრობის იდენტიფიკაციისთვის უცნობი დნმ-ის აუზში. ისინი ცნობილია როგორც გენეტიკური მარკერები. გენეტიკური მარკერები გამოიყენება მოლეკულურ ბიოლოგიაში ინდივიდებსა და სახეობებს შორის გენეტიკური ვარიაციის დასადგენად. ცვლადი რიცხვის ტანდემის გამეორება (VNTR) და მოკლე ტანდემური გამეორება (STR) არის გენეტიკური მარკერების ორი ტიპი, რომლებიც აჩვენებენ პოლიმორფიზმს ინდივიდებს შორის. ორივე ტიპი არის არაკოდირებადი განმეორებადი დნმ, რომელიც ტანდემური განმეორებაა.ისინი განლაგებულია ქრომოსომებში თავიდან კუდის სახით. VNTR არის გენომის ნაწილი, სადაც მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა რამდენჯერმე მეორდება. STR არის დნმ-ის კიდევ ერთი განყოფილება გენომის შიგნით, რომელიც ორგანიზებულია განმეორებით ერთეულებად, რომლებიც შედგება ორიდან ცამეტ ნუკლეოტიდისგან ასჯერ. VNTR-სა და STR-ს შორის მთავარი განსხვავებაა ნუკლეოტიდების რაოდენობა განმეორებითი თანმიმდევრობით. VNTR-ის განმეორებითი ერთეული შედგება 10-დან 100-მდე ნუკლეოტიდისგან, ხოლო STR-ის განმეორებითი ერთეული შედგება 2-დან 13-მდე ნუკლეოტიდისგან. VNTR და STR ფართოდ გამოიყენება სასამართლო კვლევებში.
რა არის VNTR?
ტანდემი გამეორება არის დნმ-ის მოკლე თანმიმდევრობა, რომელიც მეორდება თავიდან კუდამდე კონკრეტულ ქრომოსომულ ლოკუსზე. არ არსებობს სხვა თანმიმდევრობა ან ნუკლეოტიდი ტანდემის განმეორებით. გენომში არსებობს რამდენიმე სახის ტანდემის გამეორება. VNTR არის ტანდემის გამეორების ტიპი მათ შორის, რომელსაც აქვს განმეორებადი ერთეული, რომელიც შედგება 10-დან 100 ნუკლეოტიდამდე. VNTR არის მინისატელიტის ტიპი. ეს ტანდემი გამეორებები გვხვდება ბევრ ქრომოსომაში.ისინი განლაგებულია ადამიანის გენომში და განლაგებულია უპირატესად ქრომოსომების სუბტელომერულ რეგიონებში.
VNTR აჩვენებენ ტანდემურ განმეორებით პოლიმორფიზმს ინდივიდებს შორის. VNTR-ის სიგრძე ქრომოსომის კონკრეტულ ადგილას ძალზე ცვალებადია ინდივიდებს შორის დნმ-ის განყოფილებაში ორგანიზებული განმეორებადი ერთეულების რაოდენობის ცვალებადობის გამო. ამრიგად, VNTR შეიძლება გამოყენებულ იქნას როგორც ძლიერი ინსტრუმენტი ინდივიდების იდენტიფიკაციისთვის და VNTR ანალიზი გამოიყენება ბევრ სფეროში, მათ შორის გენეტიკაში, ბიოლოგიის კვლევაში, სასამართლო ექსპერტიზაში და დნმ-ის თითის ბეჭდვაში. VNTR იყო პირველი გენეტიკური მარკერები, რომლებიც გამოიყენეს ძვლის ტვინის ტრანსპლანტაციის რაოდენობრივად შესაფასებლად. VNTR ასევე იყო პირველი პოლიმორფული მარკერები, რომლებიც გამოიყენებოდა სასამართლო ექსპერტიზაში დნმ-ის პროფილირებაში.
სურათი 01: VNTR-ების ვარიაცია ექვს ინდივიდში
VNTR ანალიზი ხორციელდება შეზღუდვის ფრაგმენტის სიგრძის პოლიმორფიზმის საშუალებით, რასაც მოჰყვება სამხრეთის ჰიბრიდიზაცია. აქედან გამომდინარე, მას სჭირდება შედარებით დიდი დნმ-ის ნიმუში. VNTR პროფილის ინტერპრეტაცია ასევე პრობლემურია. ამ შეზღუდვების გამო, VNTR-ის გამოყენება სასამართლო გენეტიკაში შეზღუდულია და ის შეიცვალა STR ანალიზით.
რა არის STR?
STR არის უაღრესად განმეორებადი დნმ-ის განყოფილება, რომელიც შედგება ორიდან ცამეტი ნუკლეოტიდის განმეორებადი ერთეულისგან, რომლებიც მოწყობილია ტანდემური წესით. STR არის VNTR-ის მსგავსი. მაგრამ ის განსხვავდება VNTR-დან ნუკლეოტიდების რიცხვიდან განმეორებით თანმიმდევრობით და გამეორებების რაოდენობით. STR არის მიკროსატელიტის ტიპი.
STR ანალიზი ჩართულია განმეორებადი ერთეულების ზუსტი რაოდენობის გაზომვაში. STR ძალიან ცვალებადია ინდივიდებს შორის, VNT-ების მსგავსი. STR პროფილები განსხვავდება ადამიანიდან ადამიანზე. ამიტომ, STR ანალიზი გამოიყენება მოლეკულურ ბიოლოგიაში ორი ან მეტი ნიმუშის დნმ-ის სპეციფიკური ადგილების შესადარებლად. აქედან გამომდინარე, STR განიხილება, როგორც ძლიერი გენეტიკური მარკერები მოლეკულურ ბიოლოგიაში.ის წარმოადგენს შესანიშნავ ინსტრუმენტს ინდივიდების იდენტიფიკაციისთვის მათი მაღალი ხარისხის პოლიმორფიზმისა და შედარებით მოკლე სიგრძის გამო.
დღესდღეობით, STRs არის ყველაზე ხშირად გამოყენებული გენეტიკური პოლიმორფიზმის გაანალიზებული ინსტრუმენტი სასამართლო გენეტიკაში. სასამართლო ექსპერტიზის უმეტესობა მოიცავს STR პოლიმორფულ ანალიზს. STR ლოკუსი გავრცელებულია გენომში. არსებობს ათასობით STR, რომელიც მდებარეობს ქრომოსომებში, რომლებიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას სასამართლო ანალიზში. STR ანალიზი არ მოიცავს შეზღუდვის სიგრძის პოლიმორფიზმს, როგორიცაა VNTR ანალიზი. STR ანალიზი არ წყვეტს დნმ-ს რესტრიქციული ფერმენტებით. სპეციფიური ზონდები გამოიყენება დნმ-ზე სასურველი უბნების დასამაგრებლად და PCR ტექნიკის გამოყენებით, განისაზღვრება STR-ის სიგრძე.
სურათი 02: STR ვარიაცია ნიმუშებს შორის
რა მსგავსებაა VNTR-სა და STR-ს შორის?
- VNTR და STR არის არაკოდირების დნმ.
- ორივე ტანდემი გამეორებაა.
- ორივე ავლენს პოლიმორფიზმს ინდივიდებს შორის დნმ-ის მონაკვეთის სიგრძის სხვაობის გამო.
- ორივე გამოიყენება როგორც ძლიერი გენეტიკური მარკერი დნმ-ის თითის ანაბეჭდისა და სასამართლო კვლევების დროს.
რა განსხვავებაა VNTR-სა და STR-ს შორის?
VNTR vs STR |
|
| VNTR არის არაკოდირებადი განმეორებადი დნმ, რომელსაც აქვს მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც მეორდება თანმიმდევრულად. | STR არის უაღრესად განმეორებადი დნმ-ის განყოფილება, რომელიც შედგება ორიდან ცამეტი ნუკლეოტიდის განმეორებადი ერთეულისგან, რომლებიც მოწყობილია ტანდემური წესით. |
| ზომა | |
| VNTR უფრო დიდია ვიდრე STR. | STR უფრო მცირეა ვიდრე VNTR. |
| ნუკლეოტიდების რაოდენობა განმეორებით მიმდევრობაში | |
| VNTR-ის განმეორებითი ერთეული შედგება 10-დან 100 ნუკლეოტიდისგან. | STR-ის განმეორებითი ერთეული შედგება 2-დან 13-მდე ნუკლეოტიდისგან. |
რეზიუმე – VNTR vs STR
VNTR და STR არის ორი ძლიერი გენეტიკური მარკერი, რომელიც გამოიყენება მოლეკულურ ბიოლოგიაში, განსაკუთრებით სასამართლო გენეტიკის სფეროში. VNTR არის მინისატელიტის ტიპი, ხოლო STR არის მიკროსატელიტი. VNTR და STR არის არაკოდიციური, ძალიან განმეორებადი დნმ. ისინი ტანდემური გამეორებაა. VNTR და STR-ის ზოგადი სტრუქტურა იგივეა. თუმცა, ნუკლეოტიდების რაოდენობა განმეორებით თანმიმდევრობაში და სიგრძე განსხვავებულია. VNTR-ს აქვს განმეორებადი თანმიმდევრობა, რომელიც შედგება 10-დან 100 ნუკლეოტიდისგან. STR-ს აქვს განმეორებადი თანმიმდევრობა, რომელიც შედგება 2-დან 13 ნუკლეოტიდიდან. ეს არის განსხვავება VNTR-სა და STR-ს შორის.
ჩამოტვირთეთ VNTR-ის PDF ვერსია STR-ის წინააღმდეგ
შეგიძლიათ ჩამოტვირთოთ ამ სტატიის PDF ვერსია და გამოიყენოთ იგი ოფლაინ მიზნებისთვის ციტირების შენიშვნების მიხედვით. გთხოვთ ჩამოტვირთოთ PDF ვერსია აქ სხვაობა VNTR-სა და STR-ს შორის.
