ძირითადი განსხვავება 1D და 2D გელის ელექტროფორეზს შორის არის თვისებები, რომლებიც გამოიყენება გელის ელექტროფორეზზე ცილების გამოყოფისთვის. 1D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს მხოლოდ მოლეკულური წონის მიხედვით, ხოლო 2D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს მისი იზოელექტრული წერტილისა და მოლეკულური წონის მიხედვით.
პროტეინის გამოყოფა გელის ელექტროფორეზით არის მნიშვნელოვანი ტექნიკა ცილების დასახასიათებლად. პროტეინებს აქვთ განსხვავებული თვისებები; ამიტომ, გამოყოფა უფრო რთულია დნმ-ის გამოყოფასთან შედარებით აგაროზის გელის ელექტროფორეზით.
რა არის 1D გელის ელექტროფორეზი?
1D გელის ელექტროფორეზი, ასევე ცნობილი როგორც ერთგანზომილებიანი გელის ელექტროფორეზი, არის ცილების გამოყოფის მეთოდი, რომელიც დაფუძნებულია მოლეკულურ წონაზე.ცილების გამოყოფა ძირითადად ხდება პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის გამოყენებით. გელის ელექტროფორეზის კონცეფციაზე დაყრდნობით, მოლეკულები გამოიყოფა მათი მოლეკულური წონისა და მუხტის თვისებით.
ამიტომ, ცილების ერთგვაროვანი მუხტის მისაცემად, ნატრიუმის დოდეცილსულფატით (SDS) მკურნალობა კეთდება გელის ელექტროფორეზის წინ. SDS ახდენს ცილების დენატურაციას და უზრუნველყოფს ერთგვაროვან უარყოფით მუხტს ცილაზე; როდესაც ელექტრული ველის გამოყენება ხდება, ცილები მიგრირებენ დადებით ტერმინალში მათი მოლეკულური წონის მიხედვით. ამრიგად, გამოყოფისას განიხილება მხოლოდ ერთი ქონება. სწორედ ამიტომ ამ მეთოდს უწოდებენ 1D გელის ელექტროფორეზის.
სურათი 01: 1D გელის ელექტროფორეზი
1D გელის ელექტროფორეზის დროს ცილები გამოიყოფა მათი მოლეკულური წონის მიხედვით. ამასთან დაკავშირებით, დაბალი წონის მოლეკულები უფრო სწრაფად მიგრირებენ გელში, ვიდრე მაღალი მოლეკულური წონის ცილებს. ამრიგად, მაღალი წონის ცილები რჩება ჭაბურღილებთან ახლოს.
რა არის 2D გელის ელექტროფორეზი?
2D გელის ელექტროფორეზი ან ორგანზომილებიანი გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს ორი თვისების საფუძველზე. ორი თვისებაა ცილის იზოელექტრული წერტილი და მოლეკულური წონა. ცილის გამოყოფის ეს მეთოდი ზრდის ცილის გამოყოფის გარჩევადობას. ცილის იზოელექტრული წერტილი დამოკიდებულია pH-ზე, რომლის დროსაც ცილა ნეიტრალურია.
სურათი 02: 2D გელის ელექტროფორეზი
ამგვარად, 2D გელის ელექტროფორეზის დროს, ცილას ეძლევა უფლება იმუშაოს ფიქსირებულ pH გრადიენტზე პირველ განზომილებაში. მეორე განზომილებაში, ცილები გამოყოფილია ვერტიკალური ან ჰორიზონტალური პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის გამოყენებით. ამრიგად, ცილები გამოიყოფა მეორე განზომილებაში მათი მოლეკულური წონის მიხედვით.
გარდა ამისა, გელის ელექტროფორეზის ეს მეთოდი ზრდის ცილების გამოყოფის გარჩევადობას. ამიტომ, გამოყოფილი ცილები უფრო სუფთაა. თუმცა, ტექნიკის ღირებულება გაცილებით მაღალია, ვიდრე ერთგანზომილებიანი გელის ელექტროფორეზი.
რა მსგავსებაა 1D და 2D გელის ელექტროფორეზს შორის?
- ორივე ტექნიკა გამოყოფს ცილებს.
- აქედან გამომდინარე, ისინი მნიშვნელოვანია ცილების დახასიათებაში.
რა განსხვავებაა 1D და 2D გელის ელექტროფორეზს შორის?
1D და 2D გელის ელექტროფორეზის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ 1D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს მხოლოდ მოლეკულური წონის მიხედვით, ხოლო 2D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს, როგორც იზოელექტრული წერტილის, ასევე მოლეკულური წონის მიხედვით. 1D და 2D გელის ელექტროფორეზის ამ ძირითადი განსხვავების გამო, ცილების გამოყოფის გარჩევადობა და ორი ტექნიკის ღირებულება ასევე განსხვავდება.2D გელის ელექტროფორეზი აჩვენებს მაღალ გარჩევადობას, ვიდრე 1D გელის ელექტროფორეზი. თუმცა, 2D გელის ელექტროფორეზი უფრო ძვირია, ვიდრე 1D გელის ელექტროფორეზი.
ქვემოთ ინფოგრაფიკა აჯამებს განსხვავებას 1D და 2D გელის ელექტროფორეზს შორის.
შეჯამება – 1D vs 2D გელის ელექტროფორეზი
ცილების გამოყოფა ბევრ ფაქტორზეა დამოკიდებული. 1D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს მხოლოდ მოლეკულური წონის მიხედვით. თუმცა, ორგანზომილებიანი ან 2D გელის ელექტროფორეზი ზრდის ცილის გამოყოფის გარჩევადობას. გარდა ამისა, 2D გელის ელექტროფორეზი გამოყოფს ცილებს იზოელექტრული წერტილისა და მოლეკულური წონის მიხედვით. აქედან გამომდინარე, ეს მონაცემები მნიშვნელოვანია ცილების ქვედა დინების დამუშავებისთვის და პროტეომიკის სფეროში.ამრიგად, ეს არის განსხვავების შეჯამება 1D და 2D გელის ელექტროფორეზის შორის.
