აგაროზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ აგაროზის გელის ელექტროფორეზი იყენებს ჰორიზონტალურად ჩამოსხმულ აგაროზის გელებს დნმ-ის შედარებით დიდი ფრაგმენტების გამოსაყოფად, ხოლო პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი იყენებს ვერტიკალურად ჩამოსხმულ პოლიაკრილამიდის გელებს უფრო მოკლე ნუკლეინის მჟავის ფრაგმენტების გამოსაყოფად..
ელექტროფორეზი არის ტექნიკის ტიპი, რომელიც იყენებს ელექტრულ ველს, რომელიც გამოიყენება გელის მატრიცის გასწვრივ ბიომოლეკულების გამოსაყოფად, როგორიცაა დნმ, რნმ და ცილები. ბიომოლეკულების ეს გამოყოფა, როგორიცაა დნმ, რნმ და ცილები ელექტროფორეზის საშუალებით, ეფუძნება მუხტსა და ზომას.ნიმუშები იტვირთება გელის ჭაბურღილებში. მოგვიანებით, ელექტრული ველი გამოიყენება გელის გასწვრივ. ველი იწვევს უარყოფითად დამუხტული მოლეკულების გადაადგილებას დადებითი ელექტროდისკენ. გელის მატრიცა მოქმედებს როგორც მოლეკულური საცერი, რომლის მეშვეობითაც უმცირესი მოლეკულები გადიან ან სწრაფად მოძრაობენ, ხოლო უფრო დიდი მოლეკულები ნელა მოძრაობენ. ეს იძლევა მოლეკულების გამიჯვნას მუხტისა და ზომის მიხედვით. მაშასადამე, აგაროზა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი არის გელის ელექტროფორეზის ორი ტიპი, რომელიც ძირითადად ეხმარება მოლეკულების განცალკევებას მათი ზომისა და მუხტის მიხედვით.
რა არის აგაროზის გელის ელექტროფორეზი?
აგაროზის გელის ელექტროფორეზი არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს აგაროზის გელებს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად, როგორიცაა დნმ და რნმ. ეს არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ნუკლეინის მჟავების განცალკევებისთვის, ძირითადად, ზომის მიხედვით. მთავარი ნაერთი, რომელსაც ეწოდება აგაროზა, რომელიც გამოიყენება ამ ტექნიკაში, არის პოლისაქარიდი. ის ზღვის მცენარეებიდან მოდის. აგაროზა შეიძლება გაიხსნას მდუღარე ბუფერში და შემდეგ დაასხით უჯრაში, რომელიც ინახება ჰორიზონტალურად.უჯრაში ის მყარდება, როცა გაცივდება და ქმნის ფილს. აგაროზას გელებს ასხამენ სავარცხლით, რათა მოხდეს ჭები, რომლებშიც ნუკლეინის მჟავები, როგორიცაა დნმ ან რნმ ჩაიტვირთება გელის გამაგრების შემდეგ.
სურათი 01: აგაროზის გელის ელექტროფორეზი
გელი მოგვიანებით ჩაეფლო შესაბამის ბუფერში და დენი ვრცელდება გელის გასწვრივ. დნმ-ს აქვს ერთიანი უარყოფითი მუხტი, რომელიც დამოუკიდებელია მოლეკულის თანმიმდევრული შემადგენლობისგან. ამიტომ, დნმ-ის მოლეკულები გადავა კათოდიდან (-) ანოდისკენ (+). მიგრაციის სიჩქარე პირდაპირ არის დამოკიდებული მოლეკულის ზომაზე. უდიდეს მაკრომოლეკულებს უჭირთ გელის მეშვეობით ნავიგაცია. მეორეს მხრივ, პატარა მაკრომოლეკულები სწრაფად და საკმაოდ მარტივად სრიალებს გელის მეშვეობით.
რა არის პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი?
პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი (PAGE) არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს პოლიაკრილამიდის გელებს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად. ეს არის ტექნიკა, რომელიც ფართოდ გამოიყენება ბიოლოგიური მაკრომოლეკულების, ჩვეულებრივ ცილების და ნუკლეინის მჟავების განცალკევებისთვის, მათი ელექტროფორეზული მობილურობის მიხედვით. აკრილონიტრილის ჰიდრატაცია იწვევს აკრილამიდის მოლეკულების წარმოქმნას ნიტრილის ჰიდრატაზას მიერ. აკრილამიდი წყალში ხსნადია და თავისუფალი რადიკალების ინიციატორების დამატებისას აკრილამიდი პოლიმერიზდება, რის შედეგადაც წარმოიქმნება პოლიაკრილამიდის გელის. ჩვეულებრივ, აკრილამიდის გაზრდილი კონცენტრაცია იწვევს გელში პორების ზომის შემცირებას. პოლიაკრილამიდის გელები ასხამენ ვერტიკალურად, განსხვავებით აგაროზის გელებისაგან.
სურათი 02: პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი
პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის დროს მოლეკულები შეიძლება იმუშაონ თავიანთ მშობლიურ მდგომარეობაში, შეინარჩუნონ მოლეკულების უმაღლესი რიგის სტრუქტურა. ამ მეთოდს ეწოდება მშობლიური PAGE. ალტერნატიულად, ქიმიური დენატურანტი ასევე შეიძლება დაემატოს უმაღლესი რიგის სტრუქტურის მოსაშორებლად და მოლეკულის გადაქცევას არასტრუქტურირებულ მოლეკულად, რომლის მობილურობა დამოკიდებულია მხოლოდ მის სიგრძეზე. ამ ტიპს ეწოდება SDS-PAGE.
რა მსგავსებაა აგაროზასა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზს შორის?
- აგაროზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი არის გელის ელექტროფორეზის ორი ტიპი.
- ფაქტობრივად, ისინი მოლეკულური ბიოლოგიური ტექნიკაა.
- ორივე ტექნიკა გამოიყენება ბიოლოგიური მაკრომოლეკულების გამოსავლენად, როგორიცაა დნმ და ცილები.
- ამ ტექნიკას ასრულებენ გამოცდილი ტექნიკოსები ან მკვლევარები.
- ორივე ტექნიკაში მაკრომოლეკულების გამოყოფა ეფუძნება მუხტსა და ზომას.
- ორივე ტექნიკა იძლევა ნუკლეინის მჟავების გამოყოფას, როგორიცაა დნმ და რნმ.
რა განსხვავებაა აგაროზასა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზს შორის?
აგაროზის გელის ელექტროფორეზი არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს ჰორიზონტალურად ჩამოსხმულ აგაროზის გელებს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად, ხოლო პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს ვერტიკალურად ჩამოსხმულ პოლიაკრილამიდის გელებს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად. ეს არის მთავარი განსხვავება აგაროზასა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზს შორის. გარდა ამისა, აგაროზის გელის ელექტროფორეზი გამოიყენება დნმ-ისა და რნმ-ის განცალკევებისთვის, ხოლო პოლიაკრილამიდური გელის ელექტროფორეზი გამოიყენება ნუკლეინის მჟავების, როგორიცაა დნმ, რნმ ან ცილების განცალკევებისთვის.
შემდეგი ცხრილი აჯამებს განსხვავებას აგაროზასა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზს შორის.
რეზიუმე - აგაროზა vs პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი
აგაროზა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი არის გელის ელექტროფორეზის ორი ტიპი, რომელიც გამოიყენება მოლეკულურ ბიოლოგიურ ლაბორატორიებში.აგაროზის გელის ელექტროფორეზი იყენებს აგაროზის გელს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად. აგაროზა ზოგადად არ არის ტოქსიკური ადამიანისთვის, ხოლო პოლიაკრილამიდი ტოქსიკურია ადამიანისთვის. უფრო მეტიც, აგაროზის გელის ელექტროფორეზი აჩვენებს დაბალ გარჩევადობას, ხოლო პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი უფრო მეტ გარჩევადობას აჩვენებს. პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი იყენებს პოლიაკრილამიდის გელს ბიომოლეკულების გამოსაყოფად. ეს აჯამებს განსხვავებას აგაროზასა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის შორის
