PARP1-სა და PARP2-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ მცენარეთა და ცხოველთა PARP1 ატარებს Zn-თითის დნმ-ის შემაკავშირებელ მოტივებს, ხოლო მცენარეთა PARP2 ატარებს N-ტერმინალურ SAP დნმ-ის შემაკავშირებელ მოტივებს.
პოლი ADP რიბოზა პოლიმერაზა (PARP) არის ცილების ოჯახი, რომლებიც წარმოადგენენ ბირთვულ ფერმენტებს. PARP-ის ოჯახში 17 სხვადასხვა ტიპის PARP ფერმენტია. PARP1 და PARP2 არის ორი ფერმენტი, რომელიც აუცილებელია დნმ-ის ნორმალური აღდგენისთვის.
რა არის PARP?
PARP (პოლი ADP რიბოზა პოლიმერაზა) არის ცილების ოჯახი, რომელიც ემსახურება მრავალ უჯრედულ პროცესს, როგორიცაა დნმ-ის შეკეთება, გენომიური სტაბილურობა და დაპროგრამებული უჯრედის სიკვდილი. ისინი ახდენენ პროცესს, რომელსაც ეწოდება ADP-რიბოზილირება. ADP-რიბოზილაცია გულისხმობს ADP-რიბოზას ერთეულების დამატებას ნიკოტინამიდ ადენინ დინუკლეოტიდიდან (NAD) სამიზნე სუბსტრატებზე დნმ-ის ჯაჭვის რღვევის აღდგენის მიზნით.
PARP ფერმენტები დნმ-ის დამაკავშირებელი პროტეინებია. ისინი აქტიურდებიან დნმ-ის მოლეკულებში არსებული ნიკებით. მას შემდეგ, რაც ისინი დნმ-ის რღვევებს უკავშირდება, ისინი ჰიდროლიზებენ NAD+ ნიკოტინამიდში და ხელს უწყობენ ADP-რიბოზის პოლიმერიზაციას. ამიტომ, PARP ბირთვული ფერმენტები მონაწილეობენ დნმ-ის შეკეთებაში. უფრო მეტიც, პოლი-ADP-რიბოზილაცია მუშაობს როგორც პოსტტრანსლაციური მოდიფიკაცია, რომელიც მნიშვნელოვან როლს ასრულებს რეპლიკაციაში, ტრანსკრიპციულ რეგულაციაში, ტელომერების შენარჩუნებასა და ცილების დეგრადაციაში. PARP ფერმენტები ასევე მონაწილეობენ გენომის სტაბილურობის შენარჩუნებაში, ქრომატინის სტრუქტურის რეგულირებაში, უჯრედების პროლიფერაციაში და აპოპტოზში.
რა არის PARP1?
PARP1 არის PARP ცილების ოჯახის წარმომადგენელი. ეს არის პირველი და ყველაზე კარგად დამახასიათებელი ცილა ამ ოჯახში. ის მოქმედებს როგორც პირველი რეაგირება, რომელიც აღმოაჩენს დნმ-ის დაზიანებას და შემდეგ ხელს უწყობს აღდგენის მექანიზმის არჩევას.გარდა ამისა, PARP1 არეგულირებს ერთჯაჭვიანი დნმ-ის დაზიანების შეკეთებას.
სურათი 01: PARP1
ერთჯაჭვიანი დნმ-ის რღვევის აღდგენის გარდა, PARP1 არეგულირებს რეპლიკაციის ჩანგლის პროგრესირებას და გადატვირთვას. გარდა ამისა, ის ხელს უწყობს ალტერნატიულ არაჰომოლოგიურ დასასრულის შეერთებას.
რა არის PARP2?
PARP2 არის PARP ცილების ოჯახის კიდევ ერთი წევრი ცილა. ის მჭიდროდაა დაკავშირებული PARP1 ფერმენტთან. გენი PARP2 კოდირებს PARP2 პროტეინს ადამიანებში. PARP2-ს აქვს კატალიზური დომენი, მაგრამ არ გააჩნია N ტერმინალური დნმ-ის დამაკავშირებელი დომენი. PARP ინჰიბიტორს კიბოს საწინააღმდეგო პრეპარატებს შეუძლიათ დათრგუნონ PARP2, PARP1-ის მსგავსად.
სურათი 02: PARP2
მცენარეებში, განსაკუთრებით Arabidopsis thaliana-ში, PARP2 მნიშვნელოვან როლს ასრულებს დნმ-ის დაზიანებაზე და ბაქტერიულ პათოგენეზზე დამცავ პასუხებში, ვიდრე PARP1.
რა მსგავსებაა PARP1-სა და PARP2-ს შორის?
- PARP1 და PARP2 არის ორი ტიპის ბირთვული ფერმენტი.
- ისინი იყენებენ NAD+-ს, როგორც მათ სუბსტრატს პოლი ADP რიბოზილირების კატალიზებისთვის.
- ორივე გააქტიურებულია დნმ-ის ერთჯაჭვიანი რღვევით.
- ძუძუმწოვარი PARP1 და PARP2 განლაგებულია ბირთვში.
- ორივე PARP1 და PARP2 ურთიერთქმედებენ ქრომატინთან.
- ისინი აღადგენს დნმ-ის დაზიანებას.
- ზოგიერთი PARP ინჰიბიტორი კიბოს საწინააღმდეგო პრეპარატი, რომელიც მიმართულია PARP1-ზე, ასევე აინჰიბირებს PARP2-ს.
რა განსხვავებაა PARP1-სა და PARP2-ს შორის?
PARP1 არის PARP ცილების ოჯახის წევრი, რომელსაც აქვს კატალიზური დომენი და N-ტერმინალური დნმ-ის დამაკავშირებელი დომენი, ხოლო PARP2 არის PARP ოჯახის წევრი, რომელსაც არ გააჩნია N-ტერმინალური დნმ-ის დამაკავშირებელი დომენი. PARP1-სა და PARP2-ს შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ მცენარეთა და ცხოველთა PARP1 ატარებს Zn-თითის დნმ-ის შემაკავშირებელ მოტივებს, ხოლო მცენარე PARP2 ატარებს N-ტერმინალურ SAP დნმ-ის შემაკავშირებელ მოტივებს.
შემდეგი ინფოგრაფიკა აჯამებს განსხვავებას PARP1-სა და PARP2-ს შორის.
რეზიუმე – PARP1 vs PARP2
PARPs არის ბირთვული ფერმენტები, რომლებიც გრძნობენ დნმ-ის დაზიანებას და აღადგენენ მათ. PARP1 და PARP2 არის ორი მათგანი, რომლებიც მჭიდრო კავშირშია. ორივე ფერმენტს აქვს კატალიზური დომენი. მაგრამ PARP2-ს არ გააჩნია N-ტერმინალური დნმ-ის დამაკავშირებელი დომენი, რომელიც იმყოფება PARP1-ში. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება PARP1-სა და PARP2-ს შორის. ორივე ტიპის ფერმენტი თავის სუბსტრატად იყენებს NAD+.
