საკვანძო განსხვავება კანდიდატ გენსა და GWAS-ს შორის არის ის, რომ კანდიდატის გენის მიდგომა იკვლევს გენეტიკურ ცვალებადობას წინასწარ განსაზღვრული ინტერესის გენების მცირე რაოდენობაში, ხოლო GWAS იკვლევს მთელ გენომს საერთო გენეტიკური ვარიაციისთვის კონკრეტული დაავადების მდგომარეობის მიღმა.
კანდიდატური გენის მიდგომა და გენომის მასშტაბური ასოციაციის კვლევები (GWAS) არის ორი მეთოდი, რომლებიც მნიშვნელოვანია დაავადებებისადმი გენეტიკური მიდრეკილების გამოსავლენად. კანდიდატი გენის მიდგომა ემყარება გენების წინასწარ განსაზღვრულ მცირე რაოდენობას, ხოლო GWAS ემყარება მთელი გენომის ტესტირებას. აქედან გამომდინარე, კანდიდატი გენის მიდგომა მოითხოვს წინასწარ ცოდნას გენების შესახებ, რომლებიც დაკავშირებულია დაავადებასთან, GWAS-ისგან განსხვავებით.
რა არის კანდიდატის გენი?
კანდიდატური გენის მიდგომა არის ერთ-ერთი ტექნიკა, რომელიც იკვლევს კავშირს გენეტიკურ ვარიაციებს შორის წინასწარ განსაზღვრულ ინტერესის გენებში და ფენოტიპებსა თუ დაავადების მდგომარეობებს შორის. ამ მიდგომით, აუცილებელია წინასწარი ცოდნა გენის ბიოლოგიური ფუნქციური ზემოქმედების შესახებ მოცემულ თვისებაზე ან დაავადებაზე. ამ ცოდნის საფუძველზე შეირჩევა გენების მცირე რაოდენობა და გაანალიზებულია გენეტიკური ვარიაციისთვის.
სურათი 01: კანდიდატის გენის მიდგომა
გენების შერჩევა ხდება ამ მიდგომში მოცემული დაავადებისადმი ბიოლოგიური, ფიზიოლოგიური და ფუნქციური შესაბამისობის საფუძველზე. ეს მიდგომა ხშირად შექმნილია როგორც შემთხვევის კონტროლის კვლევა.
რა არის GWAS?
GWAS ნიშნავს გენომის ფართო ასოციაციის შესწავლას.ის ასევე ეხება მთელი გენომის ასოციაციის კვლევებს. ეს კვლევები ძირითადად ფოკუსირებულია დაკვირვებაზე. ისინი აანალიზებენ სხვადასხვა ინდივიდის გენეტიკურ ვარიანტებს, რომლებიც ჩვეულებრივ ასოცირდება კონკრეტულ მახასიათებელთან. მთელი გენომი მნიშვნელოვანია GWAS ანალიზისთვის.
GWAS არის მნიშვნელოვანი ინსტრუმენტი ერთი ნუკლეოტიდური პოლიმორფიზმის ანალიზში, რომლებიც დაკავშირებულია სხვადასხვა დაავადების პირობებთან. ეს არის სხვადასხვა ერთი ნუკლეოტიდური პოლიმორფიზმის შედარებითი კვლევა ფართო პოპულაციაში. GWAS-ის კვლევის ნიმუში ძალიან მაღალია; შესაბამისად, ის ასევე იღებს ჯვარედინი კოჰორტის კვლევის ფორმატს.
სურათი 02: GWAS
პირველი GWAS კვლევა ჩატარდა მიოკარდიუმის ინფარქტის შესახებ და აანალიზებდა მიოკარდიუმის ინფარქტის გენებს. ამჟამად GWAS მნიშვნელოვან როლს ასრულებს უცნობი ეტიოლოგიის რთული დაავადებების გენეტიკური ფონის განსაზღვრაში.
რა მსგავსებაა კანდიდატის გენსა და GWAS-ს შორის?
- ორივე კანდიდატი გენის მიდგომა და GWAS არის ტექნიკა, რომელიც აანალიზებს გენეტიკურ კავშირს დაავადების გენოტიპსა და ფენოტიპს შორის.
- ორივე მიდგომა გვეხმარება დაავადებისადმი მიდრეკილების გენეტიკური საფუძვლის გაგებაში.
რა განსხვავებაა კანდიდატის გენსა და GWAS-ს შორის?
კანდიდატური გენის მიდგომა ეფუძნება კანდიდატ გენებს ან წინასწარ განსაზღვრულ გენებს, ხოლო GWAS ემყარება მთელ გენომს. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება კანდიდატ გენსა და GWAS-ს შორის. ასევე, კანდიდატის გენის მიდგომაში, გენების შერჩევა აუცილებელია, ხოლო GWAS არ არის საჭირო.
უფრო მეტიც, კანდიდატი გენის მიდგომა მოითხოვს წინასწარ ცოდნას დაავადების შესაბამისი გენების შესახებ, მაშინ როდესაც ეს არ არის აუცილებელი GWAS-ისთვის.
ქვემოთ ინფოგრაფიკაში მოცემულია უფრო დეტალური შედარება კანდიდატ გენსა და GWAS-ს შორის განსხვავებასთან დაკავშირებით.
შეჯამება – კანდიდატის გენი GWAS-ის წინააღმდეგ
კანდიდატური გენი და GWAS არის ორი გენის ასოციაციის კვლევა. კანდიდატი გენის მიდგომა ყურადღებას ამახვილებს დაავადებასთან ასოცირებულ გენეტიკურ ვარიაციაზე წინასწარ განსაზღვრული გენების მცირე რაოდენობით. ამის საპირისპიროდ, GWAS იკვლევს დაავადებასთან დაკავშირებულ გენეტიკურ ცვალებადობას მთელ გენომში. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება კანდიდატ გენსა და GWAS-ს შორის. ორივე მეთოდი მნიშვნელოვანია დაავადებისადმი მიდრეკილების გენეტიკური საფუძვლის გასაგებად.
