პრაიმერი და პრომოტორს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ პრაიმერი არის კომერციულად სინთეზირებული დნმ-ის მოკლე თანმიმდევრობა, რომელიც გამოიყენება PCR-ში სამიზნე დნმ-ის თანმიმდევრობის გასაძლიერებლად, ხოლო პრომოტორი არის დნმ-ის სპეციფიკური თანმიმდევრობა, რომელიც უზრუნველყოფს რნმ-ის უსაფრთხო თავდაპირველ შეკავშირების ადგილს. პოლიმერაზა და ტრანსკრიფციის ფაქტორები ტრანსკრიფციის დასაწყებად.
პრაიმერი და პრომოტორი არის დნმ-ის ორი ტიპის თანმიმდევრობა. პრაიმერი არის დნმ-ის მცირე ფრაგმენტი, რომელიც საჭიროა პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციისთვის (PCR). მას აქვს მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობები, რომლებიც ავსებენ დნმ-ის ჯაჭვის ფლანგური ბოლოს. არსებობს ორი ტიპის პრაიმერი და ისინი მუშაობენ როგორც საწყისი წერტილები დნმ-ის ახალი ჯაჭვების სინთეზისთვის.ამის საპირისპიროდ, პრომოტორი არის დნმ-ის სპეციფიკური თანმიმდევრობა, რომელიც მდებარეობს გენის ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილზე. ის უშუალოდ ურთიერთქმედებს ტრანსკრიფციის მექანიზმის კომპონენტებთან, როგორიცაა რნმ პოლიმერაზა და ტრანსკრიფციის ფაქტორები, რათა გააკონტროლოს დნმ-ის ტრანსკრიფცია. ამიტომ, რნმ პოლიმერაზა და სხვა ტრანსკრიფციული ფაქტორები უკავშირდება პრომოტორულ თანმიმდევრობას და იწყებს ტრანსკრიფციას.
რა არის პრაიმერი?
პრაიმერები არის დნმ-ის მოკლე თანმიმდევრობა, რომელიც შექმნილია სამიზნე დნმ-ის თანმიმდევრობების გასაძლიერებლად. სტრუქტურულად, მათ აქვთ მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობები, რომლებიც ავსებენ დნმ-ის ორმაგი ჯაჭვების ფლანგური ბოლოებს. ისინი, როგორც წესი, დაახლოებით 20 ნუკლეოტიდის სიგრძეა. PCR-ის დროს, Taq პოლიმერაზა ახდენს ნუკლეოტიდების დამატებას არსებულ ნუკლეოტიდურ თანმიმდევრობაში. აქედან გამომდინარე, პრაიმერები ემსახურება როგორც საწყისი წერტილები ახალი ძაფების სინთეზისთვის. Taq პოლიმერაზა მუშაობს მხოლოდ 5'-დან 3' მიმართულებით. აქედან გამომდინარე, დნმ-ის სინთეზი ასევე ხდება იმავე 5'-დან 3' მიმართულებით. ვინაიდან დნმ ორჯაჭვიანია, PCR-ში საჭიროა ორი ტიპის პრაიმერი.ისინი ცნობილია როგორც წინა პრაიმერი და საპირისპირო პრაიმერი, რომელიც ეფუძნება დნმ-ის სინთეზის დროს პრაიმერის დრეკადობის მიმართულებას.
სურათი 01: პრაიმერები
წინა პრაიმერი ანელებს ანტიმგრძნობიარე დნმ-ის ჯაჭვს და იწყებს გენის + ჯაჭვის სინთეზს 5'-დან 3'-მდე მიმართულებით. მას აქვს მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც ავსებს ანტიმგრძნობიარე ჯაჭვის მე-3 ფლანგი ბოლოს. საპირისპირო პრაიმერი ანელებს სენსორულ ძაფს და იწყებს კოდირების ჯაჭვის დამატებითი ჯაჭვის სინთეზს, რომელიც არის - გენის ჯაჭვი 5'-დან 3' მიმართულებით. ამრიგად, საპირისპირო პრაიმერი შექმნილია კოდირების ძაფის მე-3 დასასრულის დამატებით. როგორც საპირისპირო, ასევე წინა პრაიმერი მნიშვნელოვანია დნმ-ის კონკრეტული რეგიონების მილიონობით მილიარდამდე ასლის წარმოებისთვის, რომელიც არის მიზანმიმართული ან დაინტერესებული.
რა არის პრომოუტერი?
პრომოტორი არის დნმ-ის თანმიმდევრობა, რომელიც მდებარეობს გენის ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილის ზემოთ ან მე-5' ბოლოს. ის უზრუნველყოფს რნმ პოლიმერაზას და გარკვეული მარეგულირებელი ელემენტების შემაკავშირებელ ადგილს, რათა დაიწყოს გენის ტრანსკრიფცია. ეს არის მარეგულირებელი თანმიმდევრობა, რომელიც საჭიროა გენის ჩართვის ან გამორთვისთვის. პრომოტორში არის სპეციფიკური ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა. მას შეიძლება ჰქონდეს 100-1000 ბაზის წყვილი. პრომოუტერი აჩვენებს ტრანსკრიფციის მიმართულებას. უფრო მეტიც, ის მიუთითებს გრძნობის მიმართულებაზე, რომელიც უნდა გადაიწეროს.
სურათი 02: გენის პრომოუტერი
არსებობს პრომოტორული ელემენტების სამი ტიპი, როგორიცაა ძირითადი პრომოტორი, პროქსიმალური პრომოტორი და დისტალური პრომოტორი. ძირითადი პრომოტორი არის პრომოტორის მინიმალური ნაწილი, რომელიც საჭიროა ტრანსკრიფციის დასაწყებად.იგი მდებარეობს საწყისი კოდონის ყველაზე პროქსიმალურად. TATA ყუთი არის კონსერვირებული რეგიონი, რომელიც გვხვდება მრავალი ევკარიოტული ბირთვის პრომოტორებში. ის გვხვდება 25-დან 35 ბაზის წყვილამდე ტრანსკრიფციის საწყისი ადგილის ზემოთ. პროქსიმალური პრომოტორი უფრო მაღლა დგას ბირთვის პრომოუტერისკენ. ზოგადად, ის მდებარეობს 250 ბაზის წყვილზე საწყისი კოდონის ზემოთ და შეიცავს პირველადი მარეგულირებელ ელემენტებს. დისტალური პრომოტორი გვხვდება პროქსიმალური პრომოტორის ზემოთ და შეიცავს დამატებით მარეგულირებელ ელემენტებს. ბაქტერიულ პრომოტორებს აქვთ ორი მოკლე მიმდევრობის ელემენტი თავიანთ პრომოტორებში. TATAAT არის კონსენსუსის თანმიმდევრობა, რომელიც მდებარეობს ბაქტერიული პრომოტორის -10-ზე, ხოლო TTGACA არის კონსენსუსის თანმიმდევრობა -35-ზე. ისინი ცნობილია როგორც -10 ელემენტი და -35 ელემენტი.
რა მსგავსებაა პრაიმერსა და პრომოტერს შორის?
- პრაიმერი და პრომოტორი არის დნმ-ის ორი ტიპის თანმიმდევრობა.
- ისინი შედგება ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობებისაგან.
- როგორც პრაიმერი და პრომოტორი მნიშვნელოვანია გენის ექსპრესიისთვის.
რა განსხვავებაა პრაიმერსა და პრომოტერს შორის?
პრაიმერი არის მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც შექმნილია სამიზნე დნმ-ის ამპლიფიკაციისთვის. ამის საპირისპიროდ, პრომოტორი არის სპეციფიკური მარეგულირებელი დნმ-ის თანმიმდევრობა, რომელიც ნაპოვნია გენის ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილზე. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება პრაიმერსა და პრომოტორს შორის. პრაიმერები დაახლოებით 20 ბაზის წყვილია, ხოლო პრომოუტერს შეიძლება ჰქონდეს 100-1000 ბაზის წყვილი. ფუნქციურად, პრაიმერები ემსახურება როგორც საწყისი თანმიმდევრობა ახალი ჯაჭვის სინთეზისთვის, ხოლო პრომოტორები აკონტროლებენ გენის ტრანსკრიფციას რნმ პოლიმერაზასა და სხვა ტრანსკრიფციის ფაქტორებისთვის დამაკავშირებელი ადგილების მიწოდებით.
უფრო მეტიც, პრომოტორი განისაზღვრება, როგორც ტრანსკრიპციის მიმართულება და მიუთითებს გენის გრძნობის ძაფზე. სტრუქტურულად, პრაიმერი არის მოკლე, ერთჯაჭვიანი დნმ-ის თანმიმდევრობა, ხოლო პრომოტორი არის გრძელი ორჯაჭვიანი დნმ-ის თანმიმდევრობა.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა ასახავს უფრო მეტ შედარებას, რომელიც დაკავშირებულია პრაიმერსა და პრომოტორს შორის განსხვავებასთან.
რეზიუმე – პრაიმერი პრომოტერის წინააღმდეგ
პრაიმერები არის მოკლე ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობები, რომლებიც ავსებენ სამიზნე დნმ-ის ორჯაჭვიანი ფლანგური ბოლოებს. PCR-ში გამოიყენება ორი ტიპის პრაიმერი. ისინი ემსახურებიან როგორც საწყისი თანმიმდევრობას ახალი ძაფების სინთეზისთვის. პრაიმერები კომერციულად შექმნილია და ისინი ტემპერატურის სტაბილური თანმიმდევრობაა. მეორეს მხრივ, პრომოტორი არის გენის მარეგულირებელი თანმიმდევრობა, რომელიც მდებარეობს ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილის ზემოთ. პრომოტორები აკონტროლებენ გენების ტრანსკრიფციას. ისინი უზრუნველყოფენ რნმ პოლიმერაზას და ტრანსკრიფციის ფაქტორების შეკავშირების ადგილებს ტრანსკრიფციის დასაწყებად. ამრიგად, ეს არის პრაიმერისა და პრომოტორს შორის განსხვავების შეჯამება.
