საქაროზას გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაციას შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ საქაროზას გრადიენტის ულტრაცენტრფუგაციაში გამოიყენება უწყვეტი საქაროზას გრადიენტი, ხოლო საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაციაში გამოიყენება საქაროზას უწყვეტი გრადიენტი.
საქაროზას გრადიენტი და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია არის ორი მსგავსი ტიპის ტექნიკა, რომლებიც გამოიყენება მაკრომოლეკულების სპეციფიკური ტიპების გამოსაყოფად. ორივე ტექნიკაში გამოიყენება საქაროზის სიმკვრივის გრადიენტი. მაგრამ საქაროზას გრადიენტის ულტრაცენტრფუგაციისას გამოიყენება უწყვეტი სიმკვრივის გრადიენტი, ხოლო საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაციისას გამოიყენება უწყვეტი სიმკვრივის გრადიენტი.
რა არის საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია?
საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია არის ტექნიკა, რომელიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას მაკრომოლეკულების, როგორიცაა დნმ, რნმ და ცილები ფრაქციაციისთვის. ამ ტექნიკაში რამდენიმე ეტაპია. ეს არის საქაროზის გრადიენტური მომზადება, ცენტრიფუგაცია, გამოყოფა და ელუცია. გრადიენტის მომზადება ამ ტექნიკის მთავარი ეტაპია. ამ ტექნიკით, ნიმუში, რომელიც შეიცავს სხვადასხვა ზომის მაკრომოლეკულებს, ფენდება საქაროზას გრადიენტის სვეტის ზედაპირზე. ცენტრიფუგებისას, სხვადასხვა ზომის მაკრომოლეკულები იშლება საქაროზას გრადიენტის სვეტში სხვადასხვა სიჩქარით. დანალექი დამოკიდებულია რამდენიმე ფაქტორზე, მათ შორის ცენტრიფუგაციის ძალაზე, ზომის ფორმასა და მაკრომოლეკულების სიმკვრივეზე, გრადიენტის სიმკვრივესა და სიბლანტეზე. ცენტრიფუგაციის დასასრულს მაკრომოლეკულები სიმკვრივით გამოიყოფა სივრცით. უფრო დიდი მაკრომოლეკულები (მაღალი სიმკვრივის მაკრომოლეკულები) ილექება ფსკერისკენ. უფრო მსუბუქი (დაბალი სიმკვრივის მაკრომოლეკულები) რჩება გრადიენტის ზედა ნაწილში.ამიტომ, მოლეკულები ერთმანეთისგან განცალკევებულია, როგორც სხვადასხვა ზოლები. შემდეგ ზოლები უნდა გამოიყოს და უნდა მოხდეს სპეციფიკური მაკრომოლეკულის გაწმენდა საქაროზისგან.
სურათი 01: საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია
აპლიკაციის მხრივ, ეს მეთოდი ფართოდ გამოიყენება დნმ-ის მოლეკულების ფრაქციებისთვის. საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია ჩვეულებრივ გამოიყენება ცილის კომპლექსის ზომისა და შემადგენლობის დასახასიათებლად. უფრო მეტიც, ეს ტექნიკა გამოიყენება mRNA-ს ნაწილობრივი გაწმენდისთვის.
რა არის საქაროზა ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია?
საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია არის კიდევ ერთი ტექნიკა, რომელიც საშუალებას აძლევს მაკრომოლეკულების დანაწილებას. საქაროზას სიმკვრივის გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაციისგან განსხვავებით, საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია იყენებს უწყვეტი სიმკვრივის გრადიენტს.საქაროზას კონცენტრაცია იზრდება ზემოდან ქვემოდან დისკრეტული ნაბიჯებით. ამ ტექნიკით განცალკევება მიიღწევა გამწმენდი ექსტრაქტის მცირე მოცულობის საქაროზის ხსნარის თავზე ცენტრიფუგის მილში, ე.წ. ეს იძლევა უკეთეს გამოყოფას მაღალსიჩქარიანი ცენტრიფუგაციის დროს. როდესაც მოლეკულები გამოიყოფა ზოლის სახით საქაროზას ბალიშს შორის, თეთრი ზოლი შეიძლება შეგროვდეს და გაიწმინდოს. გარდა ამისა, მინარევები შეიძლება მოიხსნას საქაროზას ბალიშის მეთოდით. საქაროზას ბალიშის მეთოდი იძლევა მილის 60-70% სინჯის შევსებას. აქედან გამომდინარე, საქაროზას ბალიშის მეთოდი იძლევა ნიმუშის უფრო დიდი მოცულობის დამუშავების საშუალებას.
რა მსგავსებაა საქაროზას გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაციას შორის?
- საქაროზას გრადიენტი და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაცია არის ორი ტექნიკა, რომლებიც გამოიყენება მაკრომოლეკულების ნარევის გამოსაყოფად.
- ორივე მეთოდში გამოიყენება საქაროზას გრადიენტი.
- ცენტრიფუგაცია არის ნაბიჯი ორივე მეთოდში.
- მოლეკულები ილექება როგორც ზოლი ან ზონა თითოეულ მეთოდში.
რა განსხვავებაა საქაროზას გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაციას შორის?
საქაროზის გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს უწყვეტ საქაროზას გრადიენტს ცენტრიფუგის მილში, ხოლო საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს საქაროზას უწყვეტ გრადიენტს. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება საქაროზის გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაციას შორის.
უფრო მეტიც, საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია იძლევა ნიმუშის უფრო დიდი მოცულობის დამუშავებას, ხოლო საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია იძლევა ნიმუშის შედარებით დაბალი მოცულობის დამუშავებას.
ქვემოთ ინფოგრაფიკაში მოცემულია მეტი განსხვავება საქაროზის გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაციას შორის.
რეზიუმე – საქაროზის გრადიენტი საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაციის წინააღმდეგ
საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრიფუგაცია გამოყოფს მაკრომოლეკულებს უწყვეტი საქაროზის გრადიენტის გამოყენებით. ამის საპირისპიროდ, საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრიფუგაცია იყენებს უწყვეტი საქაროზის გრადიენტს, რათა გამოყოს კონკრეტული ტიპის ნაწილაკები ნარევში. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება საქაროზის გრადიენტსა და საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაციას შორის. საქაროზას ბალიშის მეთოდი საშუალებას იძლევა მორფოლოგიურად ხელუხლებელი ნაწილაკების შეგროვება, რადგან ის არ იწვევს მექანიკურ სტრესს, განსხვავებით საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრიფუგაციისგან, რომელიც ანადგურებს მოლეკულებს მილის ძირამდე. უფრო მეტიც, საქაროზას ბალიშის ულტრაცენტრფუგაცია იძლევა ნიმუშის უფრო დიდი მოცულობის დამუშავებას, ვიდრე საქაროზას გრადიენტური ულტრაცენტრფუგაცია.
