ძირითადი განსხვავება – YAC vs BAC ვექტორები
ვექტორები გამოიყენება მოლეკულურ კლონირებაში. ვექტორი შეიძლება განისაზღვროს, როგორც დნმ-ის მოლეკულა, რომელიც იქცევა როგორც სატრანსპორტო საშუალება უცხო გენეტიკური მასალის სხვა უჯრედში გადასატანად. ვექტორი, რომელიც შეიცავს უცხო დნმ-ს, ცნობილია როგორც რეკომბინანტული დნმ და მას უნდა ჰქონდეს მასპინძელ ორგანიზმში მისი რეპლიკაციისა და გამოხატვის შესაძლებლობა. საფუარის ხელოვნური ქრომოსომა (YAC) და ბაქტერიული ხელოვნური ქრომოსომა (BAC) არის კლონირებაში ჩართული ვექტორების ორი ტიპი. YAC-სა და BAC-ს შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ YAC არის ხელოვნურად აგებული ვექტორული სისტემა, რომელიც იყენებს საფუარის ქრომოსომის სპეციფიკურ რეგიონს საფუარის უჯრედებში გენეტიკური მასალების დიდი სეგმენტების ჩასართავად, ხოლო BAC არის ხელოვნურად აგებული ვექტორული სისტემა E-ს სპეციფიკური რეგიონის გამოყენებით.coli ქრომოსომა E. coli უჯრედებში დნმ-ის დიდი სეგმენტების შესატანად.
რა არის YAC ვექტორები?
YAC (საფუარის ხელოვნური ქრომოსომა) არის ხელოვნურად აგებული ქრომოსომა, რომელსაც აქვს უნარი გადაიტანოს უცხო დნმ-ის დიდი სეგმენტი და გაიმრავლოს საფუარის უჯრედებში. მას აქვს ცენტრომერები, ტელომერები, ასევე ავტონომიურად განმეორებადი თანმიმდევრობები, რომლებიც აუცილებელია რეპლიკაციისა და სტაბილურობისთვის. YAC ასევე უნდა ჰქონდეს შერჩევითი მარკერი ან მარკერები და შეზღუდვის ადგილები, რათა ის გახდეს ეფექტური კლონირების ვექტორი. დიდი თანმიმდევრობა, რომელიც მერყეობს 1000 კბ-დან 2000 კბ-მდე, შეიძლება შევიდეს YAC-ში და გადავიდეს საფუარში. YAC-ის ტრანსფორმაციის ეფექტურობა ძალიან დაბალია.
სურათი 01: YAC ვექტორი
რა არის BAC ვექტორები?
ბაქტერიული ხელოვნური ქრომოსომა (BAC) არის ხელოვნურად აგებული ქრომოსომა მოლეკულური კლონირებისთვის.მას აქვს E. coli F პლაზმიდის სპეციფიკური უბნები და არის წრიული და სუპერ დახვეული. BAC შექმნილია დნმ-ის ფრაგმენტების ბაქტერიების, განსაკუთრებით E. coli-ს კლონირებისთვის. მას შეუძლია ატაროს დნმ-ის ფრაგმენტები, რომელთა ზომებია 300 კბ-მდე. YAC-თან შედარებით, BAC კლონირების ჩანართები უფრო მცირე ზომისაა. BAC-ები შეიქმნა 1992 წელს და ის კვლავ პოპულარულია სტაბილურობისა და კონსტრუქციის სიმარტივის გამო. BAC ასევე სასარგებლოა ვაქცინების შემუშავებაში.
სურათი 02: BAC ვექტორი მოლეკულურ კლონირებაში
რა განსხვავებაა YAC და BAC ვექტორებს შორის?
YAC vs BAC ვექტორები |
|
| YAC არის გენეტიკურად შემუშავებული ქრომოსომა, რომელიც იყენებს საფუარის დნმ-ს კლონირების მიზნით. | BAC არის გენეტიკურად შემუშავებული დნმ-ის მოლეკულა, რომელიც იყენებს E. coli დნმ-ს კლონირების მიზნით. |
| სქესი | |
| YAC შეიქმნა გენომიური დნმ-ის დიდი ფრაგმენტების საფუარად კლონირებისთვის. | BACs შეიქმნა დიდი გენომის ფრაგმენტების კლონირებისთვის Escherichia coli-ში. |
| სიგრძის ჩასმა | |
| YAC შეიძლება შეიცავდეს მეგაბაზის ზომის გენომურ ჩანართებს. (1000 კბ – 2000 კბ). | BAC-ებს შეუძლიათ ატარონ 200-300 კბ ან ნაკლები ჩანართები. |
| მშენებლობა | |
| YAC დნმ ძნელია ხელუხლებელი გაწმენდა და მოითხოვს მაღალ კონცენტრაციას YAC ვექტორული სისტემის შესაქმნელად. | BAC ადვილად გასაწმენდია ხელუხლებლად და ადვილად აშენდება. |
| ქიმერიზმი | |
| YAC ხშირად ქიმერულია. | BAC იშვიათად არის ქიმერული. |
| სტაბილურობა | |
| YAC არასტაბილურია. | BAC სტაბილურია. |
| მოდიფიკაციები | |
| საფუარის რეკომბინაცია ძალიან შესაძლებელია და ყოველთვის აქტიური რჩება. აქედან გამომდინარე, მას შეუძლია წარმოქმნას წაშლა და სხვა გადაწყობა YAC-ში. | E. coli-ს რეკომბინაცია აღკვეთილია და ჩართულია საჭიროების შემთხვევაში. ამრიგად, ის ამცირებს BAC-ებში არასასურველ გადანაწილებებს. |
| მოვლა | |
| რეკომბინანტული YAC-ების მანიპულირება ჩვეულებრივ მოითხოვს YAC-ის გადატანას E. coli-ში შემდგომი მანიპულირებისთვის. შესაბამისად, ეს შრომატევადი პროცესია. | BAC მოდიფიკაცია ხდება უშუალოდ E. coli-ში. ასე რომ, არ არის საჭირო დნმ-ის გადაცემა. შესაბამისად, პროცესი არ არის შრომატევადი. |
შეჯამება – YAC vs BAC ვექტორები
YAC გახდა აუცილებელი კვლევის ინსტრუმენტი კლონირების პროცესებში, დნმ-ის დიდი ფრაგმენტების მასპინძელ ორგანიზმში კლონირების უნარის გამო. თუმცა, YAC-ებს აქვთ რამდენიმე უარყოფითი მხარე, როგორც ვექტორები, როგორიცაა სამშენებლო სირთულეები, ქიმერიზმი, არასტაბილურობა და ა.შ. ამიტომ ამ პრობლემების დასაძლევად მეცნიერებმა შეიმუშავეს BAC ვექტორები. BAC აგებულია E. coli ქრომოსომის სპეციფიკური რეგიონების გამოყენებით. ეს არის სტაბილური ვექტორი და ადვილად აშენდება. თუმცა, დნმ-ის სიგრძე, რომელსაც BAC შეუძლია გაუმკლავდეს, 20-ჯერ ნაკლებია, ვიდრე YAC-ის. ეს არის განსხვავება YAC და BAC ვექტორულ სისტემებს შორის. დღესდღეობით, BAC უფრო სასურველია ვიდრე YAC ლაბორატორიებში.
