ძირითადი განსხვავება – პროტეომიკა ტრანსკრიპტომიკასთან
ომის ტექნოლოგია არის მიმდინარე ტენდენცია, სადაც ორგანიზმის სხვადასხვა ბიომოლეკულები განიხილება როგორც მთლიანი კოლექცია მისი თვისებებისა და ფუნქციების მიხედვით. Omic ტექნოლოგიას აქვს აპლიკაციების ფართო სპექტრი. ბიოლოგიური ნიმუშის სხვადასხვა ომიკა მოიცავს გენომიკას, პროტეომიკას, ტრანსკრიპტომიკას და მეტაბოლომიკას. პროტეომიკა გულისხმობს ცოცხალი ორგანიზმის ყველა ცილის სრულ შესწავლას. იგი განისაზღვრება, როგორც ორგანიზმში გამოხატული ყველა ცილის ერთობლიობა, მისი სტრუქტურული და ფუნქციური თვისებები. ამრიგად, ცილების სრული ნაკრები ქმნის პროტეომს.ტრანსკრიპტომიკა არის ცოცხალ ორგანიზმში არსებული ყველა მესენჯერი რნმ (mRNA) მოლეკულის სრული შესწავლა. ამრიგად, ტრანსკრიპტომიკა ეხება გენებს, რომლებიც აქტიურად არის გამოხატული ცოცხალ ორგანიზმში. mRNA-ს მთლიანი ნაკრები ცოცხალ ორგანიზმში მოიხსენიება როგორც ტრანსკრიპტომი. მთავარი განსხვავება პროტეომიკასა და ტრანსკრიპტომიკას შორის ემყარება ბიომოლეკულის ტიპს. პროტეომიკაში შესწავლილია გამოხატული ცილების მთლიანი ნაკრები ცოცხალ ორგანიზმში, ხოლო ტრანსკრიპტომიკაში შესწავლილია ცოცხალი ორგანიზმის მთლიანი mRNA.
რა არის პროტეომიქსი?
ტერმინი პროტეომიკა დაარსდა 1995 წელს და თავდაპირველად განისაზღვრა, როგორც მთლიანი ცილოვანი დანამატი უჯრედში, ქსოვილში ან ორგანიზმში. პროტეომიურ კვლევებში წინსვლის შემდეგ, ის შეიცვალა, რომ ჩაითვალოს ქოლგა ტერმინად, რომელშიც მრავალი სასწავლო სფერო იყო შეტანილი. ამჟამად, პროტეომიკის თემაზე შესწავლილია სტრუქტურა, ორიენტაცია, ფუნქციები, მისი ურთიერთქმედება, მისი მოდიფიკაციები, მისი გამოყენება და ცილების მნიშვნელობა.ამიტომ, ამჟამად ბევრი კვლევა ტარდება პროტეომიკის სფეროში.
პირველი პროტეომიური კვლევები ჩატარდა Escherichia coli-ში ცილის შემცველობის დასადგენად. მთლიანი ცილის შემცველობის რუქა გაკეთდა ორგანზომილებიანი (2D) გელების გამოყენებით. წარმატების შემდეგ, მეცნიერები გადავიდნენ ცხოველებში ცილის მთლიანი შემცველობის დახასიათებაზე, როგორიცაა ზღვის გოჭები და თაგვები. ამჟამად, ადამიანის ცილის რუქა კეთდება 2D გელის ელექტროფორეზის გამოყენებით.
პროტეომიკის აპლიკაციები
პროტეომიკის შესწავლას ბევრი უპირატესობა აქვს, რადგან ცილები აქტივობის უმეტესი ნაწილის მმართველი მოლეკულებია ცილების კატალიზატორის თვისების გამო. ამრიგად, მთლიანი ცილების შესწავლას შეუძლია უზრუნველყოს ინფორმაცია ორგანიზმის ჯანმრთელობის მდგომარეობის შესახებ. ზოგიერთი აპლიკაციაა;
- გენომის ანოტაცია: ორგანიზმში ცილის შემცველობის შესწავლით შეიძლება განისაზღვროს აქტიურ ცილის ნაერთზე პასუხისმგებელი ზუსტი გენომები. ამ სცენარში ყველა გენომიკის შედეგები, ტრანსკრიპტომიკა და პროტეომიკა მნიშვნელოვანია.
- დაავადების იდენტიფიკაცია / დიაგნოსტიკა: პროტეომიქსი გამოიყენება დაავადების მდგომარეობის იდენტიფიკაციისას, ჯანსაღი და დაავადებული ადამიანების შედარებით
- პროტეინის ექსპრესიის შესასრულებლად შესწავლილი ექსპერიმენტის დროს.
- პროტეინის მოდიფიკაციები და ურთიერთქმედების კვლევები: ცილების გამოსაყენებლად in vitro ან და in vivo პირობებში, გადაწყვიტეთ ამ მოპოვებული ცილების შენახვის პირობები და შეისწავლოთ ცილის ქცევა in vitro, in vivo და in. - სილიკო მეთოდები.
სურათი 01: პროტეომიკა
პროტეომიკაში ჩართულია სხვადასხვა ტექნიკა
- მთლიანი ცილის ექსტრაქცია და ცილების გამოყოფა 2D გელის ელექტროფორეზის გამოყენებით. ცილების გამოყოფა ასევე შესაძლებელია მაღალი ხარისხის თხევადი ქრომატოგრაფიის (HPLC) გამოყენებით.
- მოპოვებული ცილების თანმიმდევრობა ისეთი მეთოდების გამოყენებით, როგორიცაა ედმუნდის თანმიმდევრობის მეთოდი ან მასსპექტრომეტრია.
- მიმდევრობების იდენტიფიცირების შემდეგ, ცილის შემცველობის სტრუქტურული და ფუნქციური თვისებები გაანალიზებულია კომპიუტერზე დაფუძნებული პროგრამული უზრუნველყოფისა და ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოების გამოყენებით.
რა არის ტრანსკრიპტომიკა?
ტრანსკრიპტომის ტერმინი ცოტა ხნის წინ შეიქმნა. ტრანსკრიპტომიკა არის ორგანიზმის მთლიანი mRNA შინაარსის შესწავლა. მთლიანი mRNA არის გამოხატული დნმ ცოცხალ ორგანიზმში ან უჯრედში. mRNA-ს სრულ კოლექციას მოიხსენიებენ, როგორც ტრანსკრიპტომს.
ტრანსკრიპტომის ანალიზისკენ მიმართული ნაბიჯები მოიცავს,
- რნმ-ის ექსტრაქცია, mRNA-ს გამოყოფა სვეტის გელის ქრომატოგრაფიის გამოყენებით პოლი DT მარცვლებით.
- მრნმ-ის თანმიმდევრობა შესრულებულია.
მიკროსივების ტექნოლოგია ორგანიზმის ტრანსკრიპტომის იდენტიფიცირების ერთ-ერთი გავრცელებული გზაა. მიკროსარეის ტექნიკა მოიცავს ზონდის ფირფიტას ტრანსკრიპტომის დამატებითი ძაფებით. ჰიბრიდიზაციისას ორგანიზმში ან უჯრედებში არსებული mRNA შეიძლება დახასიათდეს.
სურათი 02: ტრანსკრიპტომიური ტექნიკა
ტრანსკრიპტომიკა ახლა ფართოდ გამოიყენება სამედიცინო სფეროში. დაავადების დიაგნოსტიკა და დაავადების პროფილირება არის ძირითადი სფეროები, რომლებშიც გამოიყენება ტრანსკრიპტომიკა. ორგანიზმის ტრანსკრიპტომის ანალიზით შესაძლებელია უცხო მრნმ-ის იდენტიფიცირება და ინფექციების არსებობის შემთხვევაში მისი იდენტიფიცირება. არაკოდიციური რნმ-ის გამოყოფა შესაძლებელია ტრანსკრიპტომიური ტექნოლოგიების გამოყენებით. ასევე შესაძლებელია გენების ექსპრესიის მონიტორინგი სხვადასხვა გარემო სტრესის ქვეშ.
რა მსგავსებაა პროტეომიკასა და ტრანსკრიპტომიკას შორის?
- ორივე არის omic ტექნოლოგიის კონცეფციის ნაწილი.
- ორივე გამოიყენება დაავადების დიაგნოსტიკაში და ორგანიზმის დაავადების დახასიათებაში.
- ორივე საკვლევი სფერო მოიცავდა ბიომოლეკულის ექსტრაქციას, ბიომოლეკულის გამოყოფას და თანმიმდევრობის ეტაპებს.
რა განსხვავებაა პროტეომიკასა და ტრანსკრიპტომიკას შორის?
პროტემიქსი vs ტრანსკრიპტომიკა |
|
| პროტეომიკა მოიცავს ცოცხალ ორგანიზმში არსებული ყველა ცილის სრულ შესწავლას. | ტრანსკრიპტომიკა არის ცოცხალ ორგანიზმში არსებული ყველა მესენჯერი რნმ (mRNA) მოლეკულის სრული შესწავლა. |
| შესწავლილი ბიომოლეკულის ტიპი | |
| პროტეინები შესწავლილია პროტეომიკაში. | mRNA შესწავლილია ტრანსკრიპტომიკაში. |
| შესწავლილი ფაქტორები | |
| პროტეომიკაში შესწავლილია ცილების სტრუქტურა, ფუნქცია, ურთიერთქმედება, ცვლილებები და გამოყენება. | მიმდევრობის სტრუქტურა, ურთიერთქმედება გარემოსთან და mRNA-ს გამოყენება შესწავლილია ტრანსკრიპტომიკაში. |
შეჯამება – პროტეომიკა vs ტრანსკრიპტომიკა
Omics მნიშვნელოვან როლს ასრულებს სიცოცხლის მეცნიერებების სფეროში. პროტეომიკა ეხება პროტეომის შესწავლას, რომელიც აყალიბებს ცილების სრულ კრებულს უჯრედში ან ორგანიზმში. ტრანსკრიპტომიკა ეხება ტრანსკრიპტომის შესწავლას, რომელიც არის გამოხატული დნმ-ის სრული ნაკრები, რომელიც არის mRNA-ს სახით. საკვლევი ორი სფერო, პროტეომიკა და ტრანსკრიპტომიკა, მიღებული იქნა გენომიკის დანერგვის შემდეგ და ამჟამად ფართოდ გამოიყენება სამედიცინო დიაგნოსტიკაში და ორგანიზმების დახასიათებასა და სკრინინგში. ეს არის განსხვავება პროტეომიკასა და ტრანსკრიპტომიკას შორის.
ჩამოტვირთეთ Proteomics vs Transcriptomics-ის PDF
შეგიძლიათ ჩამოტვირთოთ ამ სტატიის PDF ვერსია და გამოიყენოთ იგი ოფლაინ მიზნებისთვის ციტირების შენიშვნის მიხედვით. გთხოვთ ჩამოტვირთოთ PDF ვერსია აქ: განსხვავება პროტეომიკასა და ტრანსკრიპტომიკას შორის
