სხვაობა Phusion-სა და Taq Polymerase-ს შორის

2024 ავტორი: Alex Aldridge | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-17 13:43

ძირითადი განსხვავება - Phusion vs Taq პოლიმერაზა

დნმ პოლიმერაზები ფართოდ გამოიყენება ფერმენტები მოლეკულური ბიოლოგიის ტექნიკაში და ასევე ბუნებრივად გვხვდება ყველა ორგანიზმში, რომელიც განიცდის დნმ-ის რეპლიკაციას. ეს არის ძირითადი პოლიმერიზაციის ფერმენტები, რომლებიც მონაწილეობენ რეპლიკაციის დროს. დნმ პოლიმერაზას შეუძლია დაამატოს ნუკლეოტიდები დნმ-ის ჯაჭვის თავისუფალ 3' ბოლოში, რითაც იწვევს ახალი ჯაჭვის გაფართოებას. ამჟამად, მოლეკულური ბიოლოგიის განვითარებით დაავადების დიაგნოსტიკაში და სამრეწველო აპლიკაციებში, მნიშვნელოვანია სხვადასხვა სასარგებლო თვისებების მქონე პოლიმერაზების წარმოება. ეს ზრდის მეთოდის სიზუსტეს და ხდის მას უფრო სწრაფ ტექნიკას. Phusion და Taq პოლიმერაზა არის ორი კომერციულად წარმოებული თერმოსტაბილური პოლიმერაზული ფერმენტი, რომლებიც გამოიყენება სპეციალურ მოლეკულურ პროგრამებში. Phusion არის Pyrococcus furiosus-ისგან გამოყოფილი დნმ-პოლიმერაზა და ძირითადად გამოიყენება კლონირების ექსპერიმენტებში ერთგულების გაზრდის მიზნით. Taq დნმ პოლიმერაზა არის სტანდარტული დნმ პოლიმერაზა, რომელიც გამოიყენება პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციაში (PCR) და ის იზოლირებულია თერმოსტაბილური ბაქტერიისგან; თერმუს აკვატიკუსი. ორ ფერმენტს შორის მთავარი განსხვავებაა წყარო მიკროორგანიზმი. ფუზიონი იზოლირებულია ექსტრემოფილისგან, Pyrococcus furiosus, ხოლო Taq პოლიმერაზა იზოლირებულია თერმოფილისგან, Thermus aquaticus.

რა არის Phusion?

Phusion დნმ პოლიმერაზა არის ახალი პოლიმერაზა, რომელიც წარმოიქმნება Pyrococcus furiosus-ის ფერმენტის იზოლირებით, რომელიც არის ექსტრემოფილური არქეა. ეს მიკრობები ბინადრობენ უკიდურესად მაღალ ტემპერატურულ პირობებში, რითაც პოლიმერაზას უაღრესად სითბოს მდგრად პოლიმერაზას აქცევს. ფუზიონის პოლიმერაზა გამოიყენება ჩვეულებრივი თერმოსტაბილურ პოლიმერაზასთან შედარებით უკიდურესი ერთგულების მისაღებად; Taq პოლიმერაზა.ფუზიონ პოლიმერაზას შეუძლია გააძლიეროს გრძელი შაბლონები 7,5 კბ-მდე გენომიური დნმ. Phusion პოლიმერაზას პოლიმერიზაციის ოპტიმალური სიმძლავრე არის 72^{0 C. ფუზიონი ასევე გამოიყენება პროდუქტების კლონირებაში თანმიმდევრობის, ექსპრესიის ანალიზისა და მუტაციის ანალიზისთვის.}

Phusion დნმ პოლიმერაზას აქვს 3' - 5' ეგზონუკლეაზური აქტივობა. ეს საშუალებას იძლევა სინთეზის შემდეგ ახლად სინთეზირებული სტრიქონის კორექტირება. აქედან გამომდინარე, ნუკლეოტიდის შეუსაბამობები ადვილად გამოსწორდება. ამრიგად, მას აქვს შეცდომის ნაკლები მაჩვენებელი. Phusion პოლიმერაზას საერთო უპირატესობებია;

ექსტრემალური ერთგულება
მაღალი სიჩქარე და შემცირებული გაფართოების დრო
მძლავრი რეაქციები და მოითხოვს მინიმალურ ოპტიმიზაციას
მაღალი მოსავლიანობა

განსხვავება Phusion და Taq პოლიმერაზას შორის

სურათი 01: ფუზიონი

Phusion პოლიმერაზას მთავარი მინუსი არის ის, რომ ის ინჰიბირდება დეზოქსიურიდინ ტრიფოსფატის (dUTP) თანდასწრებით. როდესაც dUTP-ები გროვდება რეაქციულ ნარევში, მას შეუძლია დათრგუნოს ფუზიონის პოლიმერაზას მოქმედება. ამის თავიდან აცილება ხდება რეაქციის ნარევის dUTPase-ით დამუშავებით ფერმენტის დამატებამდე. ამჟამად, Phusion პოლიმერაზას dUTP რეზისტენტული ვარიანტი, რომელიც ცნობილია როგორც Pfu Turbo, გამოიყენება Phusion პოლიმერაზას ნაცვლად, როგორც ამ პრობლემის სამკურნალო საშუალება.

რა არის Taq პოლიმერაზა?

Taq დნმ პოლიმერაზას გამოგონებამ მოახდინა რევოლუცია მოლეკულური ბიოლოგიის სფეროში. მან გადაჭრა დნმ-ის გაძლიერების მთავარი პრობლემა. Taq დნმ პოლიმერაზა არის სითბოს სტაბილური პოლიმერაზული ფერმენტი, რომელიც ამოღებულია და იზოლირებულია თერმოფილური ბაქტერიისგან, Thermus aquaticus. ამ ფერმენტების აღმოჩენა იწვევს PCR-ის განვითარებას. ამ ფერმენტმა დაუშვა პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის გამოყენება დნმ-ის გაძლიერებაში, ჩვეულებრივი შრომატევადი კლონირების ტექნიკის ნაცვლად. PCR ახლა გამოიყენება მოლეკულურ დიაგნოსტიკაში, სოფლის მეურნეობისა და სამრეწველო სფეროებში, ტექნიკას დაემატა მრავალი ახალი ვარიაციით.

ძირითადი განსხვავება Phusion და Taq პოლიმერაზას შორის

სურათი 02: Taq პოლიმერაზა

Taq დნმ პოლიმერაზა ფუნქციონირებს ტემპერატურის ოპტიმალურ დიაპაზონში 72⁰C - 80^{0C შორის. Taq დნმ პოლიმერაზა მოითხოვს კოფაქტორს; მაგნიუმი მისი ფუნქციისთვის. Taq პოლიმერაზას არ აქვს 3'-5' კორექტირების უნარი, შესაბამისად, Taq დნმ პოლიმერაზას შეცდომის მაჩვენებელი მაღალია დნმ-ის უფრო ახალ ტიპებთან შედარებით, როგორიცაა Phusion პოლიმერაზა და ა.შ. მაგრამ Taq დნმ პოლიმერაზას პოპულარობა რჩება. იგივე მეცნიერების სამყაროში ფერმენტის მოხერხებულობისა და მოქნილობის გამო.}

რა მსგავსებაა Phusion და Taq პოლიმერაზას შორის?

Phusion და Taq პოლიმერაზას ფერმენტები არის პოლიმერიზაციის ფერმენტები, რომლებსაც შეუძლიათ ნუკლეოტიდების დამატება დნმ-ის ჯაჭვის 3' თავისუფალ ბოლოში.
როგორც Phusion, ისე Taq პოლიმერაზას სჭირდება პრაიმერის თანმიმდევრობა პოლიმერიზაციის დასაწყებად.
Phusion და Taq პოლიმერაზები სითბოს სტაბილურია.
Phusion და Taq პოლიმერაზები გამოიყენება PCR მექანიზმებში დნმ-ის გასაძლიერებლად.
როდესაც პოლიმერაზას უმატებენ რეაქციულ ნარევს, როგორც Phusion, ასევე Taq პოლიმერაზები ემატება ბოლოს ფერმენტის ეფექტურობის უზრუნველსაყოფად.
როგორც Phusion, ასევე Taq პოლიმერაზები კომერციულად სინთეზირებულია მოლეკულური ბიოლოგიის ექსპერიმენტული მიზნებისთვის.
როგორც Phusion, ასევე Taq პოლიმერაზას სჭირდება კოფაქტორი თავისი ფუნქციის შესასრულებლად.

რა განსხვავებაა Phusion და Taq პოლიმერაზას შორის?

Phusion vs Taq პოლიმერაზა
Phusion არის Pyrococcus furiosus-ისგან გამოყოფილი დნმ პოლიმერაზა და ძირითადად გამოიყენება კლონირების ექსპერიმენტებში ერთგულების გასაზრდელად.	Taq დნმ პოლიმერაზა არის სტანდარტული დნმ პოლიმერაზა, რომელიც გამოიყენება პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციაში (PCR) და ის იზოლირებულია თერმოსტაბილური ბაქტერიისგან, Thermus aquaticus..
წყარო ორგანიზმი
ფუზიონი ამოღებულია ექსტრემოფილური არქეადან - Pyrococcus furiosus.	ეს ლიტერატურული ნაწარმოებები ვრცელდება კოლონიზაციის პერიოდიდან დეკოლონიზაციის პერიოდამდე.
წაკითხვის უნარი
3' – 5' მტკიცებულების კითხვის უნარი არის Phusion-ში.	3' – 5' მტკიცებულების წაკითხვის უნარი არ არის Taq პოლიმერაზაში.
ერთგულება
მაღალი ერთგულება არის Phusion-თან.	Taq პოლიმერაზა აჩვენებს დაბალ ერთგულებას.
გაძლიერება
Phusion-ს შეუძლია დნმ-ის გრძელი ფრაგმენტების გაძლიერება.	Taq პოლიმერაზას შეუძლია გააძლიეროს ბევრად უფრო მოკლე დნმ-ის ფრაგმენტები.
dUTP მოწამვლა
ფუზიის მოქმედება ინჰიბირებულია დაგროვების კოეფიციენტით.	Taq პოლიმერაზა არ ინჰიბირდება dUPT-ით.

შეჯამება – Phusion vs Taq პოლიმერაზა

Phusion და Taq დნმ პოლიმერაზა არის ორი სითბოს სტაბილური პოლიმერაზა, რომლებიც გამოიყენება PCR ტექნიკაში. Phusion არის პოლიმერაზა, რომელიც იზოლირებულია ექსტრემოფილისგან, Pyrococcus furiosus, ხოლო Taq იზოლირებულია თერმოსტაბილური ბაქტერიისგან Thermus aquaticus. Taq დნმ პოლიმერაზას აღმოჩენა იწვევს PCR გამოგონებას. Phusion-ს ბევრი უპირატესობა აქვს Taq-თან შედარებით, რამაც Phusion გახადა უკეთესი ვარიანტი მაღალი ერთგულების დნმ-ის წარმოებისთვის. თუმცა, Taq პოლიმერაზა კვლავ გამოიყენება, როგორც სტანდარტული პოლიმერაზას ფერმენტი PCR-ში. ეს არის განსხვავება Phusion და Taq პოლიმერაზას შორის.