მთავარი განსხვავება მოლეკულურ დამაგრებასა და ქულებს შორის არის ის, რომ დოკინგი არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ორ მოლეკულას შორის დამაკავშირებელი კავშირის დასადგენად, ხოლო ქულები არის კონკრეტული პოზის შეფასების პროცესი ხელსაყრელი ინტერმოლეკულური ურთიერთქმედების რაოდენობის დათვლით.
ტერმინები მოლეკულური დოკინგი და სკორინგი გამოიყენება მოლეკულური მოდელირების სფეროში. მოლეკულური მოდელირება არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება მოცემულ ნივთიერებაში სხვადასხვა მოლეკულების შესაძლო განლაგების დასადგენად. ეს ტექნიკა მნიშვნელოვანია ახალი სტაბილური ნაერთების შესაქმნელად.
რა არის მოლეკულური დოკი?
მოლეკულური დოკინგი არის კანდიდატი ლიგანდის მიერ რეცეპტორთან შეკავშირების გამოთვლითი სიმულაცია.ეს მეთოდი პროგნოზირებს ერთი მოლეკულის სასურველ ორიენტაციას მეორე მოლეკულაზე, როდესაც ერთმანეთთან არის დაკავშირებული სტაბილური კომპლექსის შესაქმნელად. ამ ტექნიკით მიღებული შედეგები შეიძლება გამოყენებულ იქნას ორ მოლეკულას შორის ასოციაციის ან შეკავშირების სიძლიერის პროგნოზირებისთვის. აქ ასევე მნიშვნელოვანია მოლეკულური ქულების ფუნქცია.
სურათი 01: მარტივი დიაგრამა, რომელიც აჩვენებს მოლეკულური ურთიერთქმედების პროცესს ბიოლოგიურ სისტემებში
ზოგადად, ეს ტექნიკა ითვალისწინებს ბიოლოგიურად შესაბამის მოლეკულებს, როგორიცაა ცილები, პეპტიდები, ნუკლეინის მჟავები, ნახშირწყლები და ლიპიდები. ეს მოლეკულები ძალიან მნიშვნელოვანია და ისინი მნიშვნელოვან როლს ასრულებენ ჩვენს ორგანიზმში სიგნალის გადაცემის მექანიზმებში. აქედან გამომდინარე, ორი მოლეკულის ორიენტაცია, რომლებიც აპირებენ დაკავშირებას სიგნალის გადაცემის პროცესისთვის, გავლენას ახდენს აქ წარმოებული სიგნალის ტიპზე. Ეს ნიშნავს; მოლეკულური დამაგრება მნიშვნელოვანია ბიოლოგიურ სისტემებში სიგნალის გადაცემის დროს წარმოქმნილი სიგნალის სიძლიერის და ტიპის დასადგენად.
უფრო მეტიც, მოლეკულური დოკის ტექნიკა მნიშვნელოვანია სტრუქტურაზე დაფუძნებული მედიკამენტების შემუშავებისას. ეს გამოწვეულია მცირე მოლეკულების, როგორიცაა ლიგანდების, შესაფერის ადგილთან შეკავშირების კონფორმაციის პროგნოზირებადობით.
რა არის მოლეკულური ქულები?
მოლეკულური ქულები არის მათემატიკური ფუნქციის ტიპი, რომელიც სასარგებლოა მოლეკულური დოკის პროგრესის შესაფასებლად. გამოთვლითი ქიმიის სფეროში, ქულების ფუნქციები გამოიყენება ორ მოლეკულას შორის დამაკავშირებელი კავშირის პროგნოზირებისთვის დოკინგის პროცესის შემდეგ. მაგალითად, თუ ჩვენ გვაქვს ნაწილაკების წამლის მცირე მოლეკულა და არსებობს ბიოლოგიური სამიზნე, როგორიცაა ცილა, შეგვიძლია შევაფასოთ პრეპარატის აფინურობა შეკავშირების ადგილის მიმართ. უფრო მეტიც, მოლეკულური ქულები შეიძლება გამოყენებულ იქნას ორ ცილას შორის ან ცილასა და დნმ-ის მოლეკულებს შორის ინტერმოლეკულური ურთიერთქმედების პროგნოზირებისთვის.
სურათი 02: ქულების ფუნქცია მოკლედ
მოლეკულური სკორინგის ძირითადი გამოყენება წამლების დიზაინის პროცესებშია - მაგალითად, ვირტუალური სკრინინგი, დე ნოვო დიზაინი, ტყვიის ოპტიმიზაცია და ა.შ.
რა განსხვავებაა მოლეკულურ დამაგრებასა და ქულებს შორის?
მოლეკულური დამაგრება და ქულები მნიშვნელოვანია მოლეკულურ მოდელირებაში. მთავარი განსხვავება მოლეკულურ დამაგრებასა და ქულებს შორის არის ის, რომ დოკინგი არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ორ მოლეკულას შორის დამაკავშირებელი კავშირის დასადგენად, ხოლო ქულები არის კონკრეტული პოზის შეფასების პროცესი ხელსაყრელი ინტერმოლეკულური ურთიერთქმედების რაოდენობის დათვლით.
შემდეგი ინფოგრაფიკა აჯამებს განსხვავებას მოლეკულურ დამაგრებასა და ქულებს შორის.
შეჯამება – მოლეკულური დამაგრება ქულების წინააღმდეგ
მოლეკულური დამაგრება და ქულები მნიშვნელოვანია მოლეკულურ მოდელირებაში. მთავარი განსხვავება მოლეკულურ დამაგრებასა და ქულებს შორის არის ის, რომ დოკინგი არის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ორ მოლეკულას შორის დამაკავშირებელი კავშირის დასადგენად, ხოლო ქულები არის კონკრეტული პოზის შეფასების პროცესი ხელსაყრელი ინტერმოლეკულური ურთიერთქმედების რაოდენობის დათვლით.
