მაკავშირებელსა და ადაპტერს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ ლინკერს არ აქვს შეკრული ბოლოები, ხოლო ადაპტერს აქვს ერთი შეკრული ბოლო.
დნმ-ის ლიგირება არის დნმ-ის ორი მოლეკულის ერთმანეთთან შეერთების პროცესი, ფოსფოდიესტერული ბმების წარმოქმნით. ფერმენტი, რომელსაც ეწოდება დნმ ლიგაზა, ახდენს ამ რეაქციის კატალიზებას. ეს არის ერთ-ერთი კრიტიკული ნაბიჯი თანამედროვე მოლეკულურ ბიოლოგიურ სფეროებში, როგორიცაა რეკომბინანტული დნმ ტექნოლოგია და დნმ-ის კლონირება. ლიგირების ეფექტურობა დამოკიდებულია დნმ-ის მოლეკულების ბოლოებზე. არსებობს დნმ-ის ბოლოების ორი ტიპი, როგორც წებოვანი ბოლოები და ბლაგვი ბოლოები. ლიგაციის ეფექტურობა მაღალია წებოვანი ბოლოებით, ვიდრე ბლაგვი ბოლოებით. თუ სამიზნე დნმ-ის მოლეკულებს აქვთ ბლაგვი ბოლოები, სასარგებლო იქნება მოლეკულები, რომელსაც ეწოდება ადაპტერები ან დამაკავშირებელი.ადაპტერები და ლინკერები არის ქიმიურად სინთეზირებული ოლიგონუკლეოტიდის მოლეკულები, რომლებიც ხელს უწყობენ დნმ-ის ლიგირებას. მათ აქვთ შიდა შეზღუდვის ადგილებიც. ადაპტერს აქვს ერთი წებოვანი ბოლო და ერთი ბლაგვი ბოლო, ხოლო ლინკერს აქვს ორი ბლაგვი ბოლო.
რა არის ლინკერი?
Linker არის ქიმიურად სინთეზირებული ოლიგონუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც ორჯაჭვიანია. ლინკერს აქვს ორი ბლაგვი ბოლო. ლინკერი გამოიყენება დნმ-ის მოლეკულების დასაკავშირებლად, რომლებსაც ბლაგვი ბოლოები აქვთ ვექტორებთან. ის შეიცავს ერთ ან მეტ შიდა შეზღუდვის საიტს. ეს შეზღუდვის ადგილები მუშაობს როგორც შეზღუდვის ფერმენტების ამოცნობის ადგილები.
სურათი 01: ლინკერი
ლიგაციის შემდეგ დნმ კვლავ იზღუდება შემაკავებელი ფერმენტებით შეკრული ბოლოების წარმოქმნით. EcoRI-ლინკერები და sal-I ლინკერები ხშირად გამოიყენება ლინკერები.
რა არის ადაპტორი?
ადაპტერი არის ორჯაჭვიანი ოლიგონუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც გამოიყენება დნმ-ის ორი მოლეკულის ერთმანეთთან დასაკავშირებლად. ეს არის მოკლე თანმიმდევრობა ერთი ბლაგვი ბოლოთი და ერთი წებოვანი ან შეკრული ბოლოთი. მაშასადამე, იგი შედგება ერთ ბოლოში ერთჯაჭვიანი კუდისგან, რაც აძლიერებს დნმ-ის ლიგაციის ეფექტურობას.
სურათი 02: დნმ-ის ლიგირება ადაპტორით
უფრო მეტიც, ადაპტერს აქვს შიდა შეზღუდვის საიტები. ამიტომ, ლიგაციის შემდეგ, დნმ შეიძლება შეიზღუდოს შესაბამისი შემაკავებელი ფერმენტებით, რათა შეიქმნას ახალი ამობურცული ტერმინალი. გადამყვანების ერთი მინუსი არის ის, რომ ორ ადაპტერს შეუძლია შექმნას დიმერები ბაზის დაწყვილების გზით. ამის თავიდან აცილება შესაძლებელია მათი ფერმენტით ტუტე ფოსფატაზას დამუშავებით.
რა მსგავსებაა ლინკერსა და ადაპტორს შორის?
- ორივე ლინკერი და ადაპტერი არის ორჯაჭვიანი მოკლე ოლიგონუკლეოტიდური თანმიმდევრობა.
- მათ აქვთ შიდა შეზღუდვის საიტები.
- უფრო მეტიც, ისინი ქიმიურად სინთეზირებული დნმ-ის მოლეკულებია და წარმოადგენენ სინთეზურ მოლეკულებს.
- მათ შეუძლიათ დააკავშირონ ორი დნმ-ის მოლეკულა.
- მაკავშირებელთა და ადაპტერების ლიგაციის შემდეგ, დნმ კვლავ იზღუდება შემაკავებელი ფერმენტებით, რათა წარმოიქმნას წებოვანი ბოლოები.
რა განსხვავებაა ლინკერსა და ადაპტორს შორის?
ალინკერი არის ქიმიურად სინთეზირებული მოკლე ოლიგონუკლეოტიდური დუპლექსი ორი ბლაგვი ბოლოთი. ადაპტერი არის ქიმიურად სინთეზირებული მოკლე ოლიგონუკლეოტიდური დუპლექსი ერთი წებოვანი ბოლოთი და ერთი ბლაგვი ბოლოთი. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება მაკავშირებელსა და ადაპტერს შორის. უფრო მეტიც, ადაპტერებს შეუძლიათ შექმნან დიმერები, ხოლო ლინკერები არ ქმნიან დიმერებს. ასე რომ, ეს არის კიდევ ერთი მნიშვნელოვანი განსხვავება ლინკერსა და ადაპტერს შორის.
ქვემოთ მოცემულია განსხვავებების შეჯამება ლინკერსა და ადაპტერს შორის ცხრილის სახით.
შეჯამება – ლინკერი ადაპტორის წინააღმდეგ
ლინკერი და ადაპტერი არის ქიმიურად სინთეზირებული ოლიგონუკლეოტიდის ორი ტიპი, რომლებიც სასარგებლოა ბლაგვი ბოლო დნმ-ის ლიგირებაში. ლინკერს აქვს ორი ბლაგვი ბოლო, ხოლო ადაპტერს აქვს ერთი ბლაგვი ბოლო და ერთი შეკრული ბოლო. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება მაკავშირებელსა და ადაპტერს შორის. ისინი ორჯაჭვიანი მოლეკულებია, რომლებსაც აქვთ შიდა შეზღუდვის ადგილები. ისინი ფართოდ გამოიყენება დნმ-ის რეკომბინანტულ ტექნოლოგიასა და დნმ-ის კლონირებაში.
