NGS და WGS-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ შემდეგი თაობის თანმიმდევრობა (NGS) არის მასიურად პარალელური მეორე თაობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც არის მაღალი გამტარუნარიანობა, დაბალი ღირებულება და სწრაფი, ხოლო მთლიანი გენომის თანმიმდევრობა (WGS) არის უჯრედის მთლიანი გენომიური დნმ-ის ანალიზების ყოვლისმომცველი მეთოდი ერთჯერადად, თანმიმდევრობის ტექნიკის გამოყენებით, როგორიცაა Sanger sequencing, თოფის მიდგომა ან მაღალი გამტარუნარიანობის NGS თანმიმდევრობა.
ბოლო რამდენიმე ათწლეულში, ადამიანებისა და სხვა ცხოველების გენომის გაგება მასიურად გაიზარდა სწრაფი თანმიმდევრობის ტექნიკისა და ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოების აღმოჩენის გამო. ჩვეულებრივი თანმიმდევრობის ტექნიკებს, როგორიცაა Sanger-ის თანმიმდევრობა, ჰქონდა თავისი შეზღუდვები, რაც მოითხოვდა ახალი სწრაფი თანმიმდევრობის მეთოდების შემუშავებას, როგორიცაა შემდეგი თაობის თანმიმდევრობა (NGS) და ნანოფორების თანმიმდევრობა.მთლიანი გენომის თანმიმდევრობის (WGS) ტექნიკა არის უახლესი მიდგომა, რომელიც უკვე გამოიყენება ბევრ გენომიურ კვლევით პროექტში, როგორიცაა Genomic England, დიდი ბრიტანეთის 100,000 გენომიური პროექტი. ასე რომ, NGS და WGS არის ორი თანმიმდევრობის მეთოდი, რომლებიც ამჟამად ჩართულია ბევრ გენომურ პროექტში.
რა არის NGS?
NGS (შემდეგი თაობის თანმიმდევრობა) არის მასიურად პარალელური მეორე თაობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც არის მაღალი გამტარუნარიანობა, დაბალი ღირებულება და სწრაფი. არ არსებობს ზუსტი განმარტება შემდეგი თაობის თანმიმდევრობისთვის. მაგრამ ჩვენ შეგვიძლია ნათლად განვასხვავოთ იგი ჩვეულებრივი კაპილარებზე დაფუძნებული თანმიმდევრობის ტექნიკისგან. შემდეგი თაობის თანმიმდევრობა საშუალებას იძლევა დნმ-ის მოლეკულის თანმიმდევრობა 1 მილიონ ბაზის წყვილზე მეტი საერთო ზომით ერთ ექსპერიმენტში. ის გთავაზობთ უპრეცედენტო სიჩქარეს და მაღალი გამტარუნარიანობის ვარიანტებს, როგორიცაა ერთდროულად მრავალი ინდივიდის დნმ-ის თანმიმდევრობის დადგენის საშუალებას. ეს მიიღწევა ინდივიდუალური თანმიმდევრობის რეაქციების მოცულობის მინიატურიზაციის გზით. გარდა ამისა, ეს ასევე ზღუდავს ინსტრუმენტების ზომას და ამცირებს რეაგენტების ღირებულებას ერთ რეაქციაზე.
სურათი 01: NGS პლატფორმები
NGS არის მოკლედ წაკითხული თანმიმდევრობის მეთოდი, რომელმაც უკვე მოახდინა რევოლუცია ბიოლოგიური კვლევის სფეროში. გარდა ამისა, NGS გამოიყენება სხვადასხვა სფეროში, როგორიცაა de novo გენომის თანმიმდევრობა, მთლიანი გენომის თანმიმდევრობა, ტრანსკრიპტომის ანალიზი, მცირე რნმ და მიკრო რნმ თანმიმდევრობა, მიზანმიმართული განმეორებითი თანმიმდევრობა და მთლიანი ეგზომის თანმიმდევრობა..
რა არის WGS?
WGS (მთლიანი გენომის თანმიმდევრობა) არის ყოვლისმომცველი მეთოდი უჯრედის მთლიანი გენომიური დნმ-ის ანალიზისთვის ერთ დროს, თანმიმდევრობის ტექნიკის გამოყენებით, როგორიცაა Sanger-ის თანმიმდევრობა, თოფის მიდგომა ან მაღალი გამტარუნარიანობის NGS თანმიმდევრობა. იგი ასევე ცნობილია როგორც სრული გენომის თანმიმდევრობა ან სრული გენომის თანმიმდევრობა. მთლიანი გენომის თანმიმდევრობა გულისხმობს ორგანიზმის მთელი ქრომოსომული დნმ-ის, ასევე დნმ-ის მიტოქონდრიებში, ხოლო მცენარეებისთვის ქლოროპლასტების დნმ-ის ერთ დროს თანმიმდევრობას. WGS საშუალებას აძლევს მეცნიერებს წაიკითხონ ყველა ასოს ზუსტი თანმიმდევრობა, რომლებიც ქმნიან დნმ-ის სრულ კომპლექტს. მოსალოდნელია, რომ WGS NGS პლატფორმის გამოყენებით რევოლუციას მოახდენს კლინიკურ დაყენებაში.
სურათი 02: WGS vs იერარქიული თოფის თანმიმდევრობა
მთლიანი გენომის თანმიმდევრობა დაინერგა კლინიკურ ზრუნვაში 2014 წელს. გარდა ამისა, WGS-ის გამოყენება გულისხმობს გენის თანმიმდევრობას SNP დონეზე ფუნქციური ვარიანტების განსაზღვრა ასოციაციის კვლევებში, თერაპიული ჩარევა პერსონალიზებულ მედიცინაში, ევოლუციური ბიოლოგია, შედარებითი გენომიური ანალიზი., მუტაციების და გადაწყობის კვლევები, იშვიათი ვარიანტების ასოციაციის კვლევები და დაავადების მგრძნობელობისა და წამლის პასუხის პროგნოზირება.
რა მსგავსებაა NGS-სა და WGS-ს შორის?
- NGS და WGS არის ორი თანმიმდევრობის ტექნიკა.
- ორივე ტექნიკა ან დნმ-ის ან რნმ-ის თანმიმდევრობით.
- ეს ტექნიკა ახალი და საიმედოა.
- ისინი ორივე გამოიყენება დაავადებების დიაგნოსტიკაში და წამლების აღმოჩენისთვის.
რა განსხვავებაა NGS-სა და WGS-ს შორის?
NGS არის მასიურად პარალელური მეორე თაობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც არის მაღალი გამტარუნარიანობა, დაბალი ღირებულება და სწრაფი, ხოლო WGS არის უჯრედის მთელი გენომიური დნმ-ის ანალიზის ყოვლისმომცველი მეთოდი ერთ დროს, თანმიმდევრობის ტექნიკის გამოყენებით, როგორიცაა როგორც Sanger-ის თანმიმდევრობა, თოფის მიდგომა ან მაღალი გამტარუნარიანობის NGS თანმიმდევრობა. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება NGS-სა და WGS-ს შორის. გარდა ამისა, NGS შედგება მხოლოდ მეორე თაობის თანმიმდევრობის მეთოდებისგან, ხოლო WGS შედგება პირველი, მეორე და მესამე თაობის თანმიმდევრობის მეთოდებისგან.
შემდეგი ცხრილი წარმოადგენს განსხვავებებს NGS და WGS-ს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – NGS vs WGS
გასული ათწლეულების განმავლობაში, სხვადასხვა თანმიმდევრობის ტექნიკა რეგულარულად გამოიყენება თანამედროვე მოლეკულურ კვლევებში. და ისინიც კი ძალიან მძლავრი იარაღებია მრავალი კლინიკური გამოყენებისთვის. NGS და WGS არის ორი თანმიმდევრობის მეთოდი, რომლებიც ამჟამად გაერთიანებულია ბევრ გენომურ პროექტში. NGS არის მეორე თაობის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც არის მაღალი გამტარუნარიანობა, დაბალი ღირებულება და სწრაფი. მეორეს მხრივ, WGS არის მთელი გენომიური დნმ-ის ან უჯრედის სრული გენომიური დნმ-ის ანალიზის მეთოდი ერთ დროს, თანმიმდევრობის ტექნიკის გამოყენებით, როგორიცაა Sanger sequencing, თოფის მიდგომა ან მაღალი გამტარუნარიანობის NGS თანმიმდევრობა. ასე რომ, ეს არის განსხვავების შეჯამება NGS-სა და WGS-ს შორის.
