ITS1-სა და ITS2-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ ITS1 არის დისპერსიული დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 18S და 5.8S rRNA გენებს შორის, ხოლო ITS2 არის დისპერსიული დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 5.8S და 28S rRNA გენებს შორის..
შიდა ტრანსკრიბირებული დისპეტერი (ITS) არის დნმ-ის დისტანციური, რომელიც ჩვეულებრივ მდებარეობს მცირე ქვედანაყოფების რიბოსომურ რნმ-სა და დიდი ქვედანაყოფების რიბოსომური რნმ-ის გენებს შორის ქრომოსომაში ან შესაბამის ტრანსკრიფციულ რეგიონში პოლიცისტრონული rRNA წინამორბედის ტრანსკრიპტის მოლეკულაში. ბაქტერიებსა და არქეებში, არსებობს მხოლოდ ერთი ITS 16S და 23S rRNA გენებს შორის. მაგრამ ევკარიოტებში არსებობს ორი ITS დისტანციური დნმ: ITS1 (18S-დან 5-მდე.8S rRNA გენები) და ITS2 (5.8S და 28S rRNA შორის). ამიტომ, ITS1 და ITS2 არის ორი დისტანციური დნმ, რომელიც ნაპოვნია ევკარიოტებში rRNA გენებს შორის.
რა არის ITS1?
ITS1 არის დისტანციური დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 18S და 5.8S rRNA გენებს შორის. ITS ეხება არაფუნქციონალური დნმ-ის ნაწილს, რომელიც მდებარეობს rRNA გენებს შორის. ITS1-ს აქვს უფრო დიდი სიგრძის ცვალებადობა, ვიდრე ITS2. ITS1-ის სიგრძის ვარიაცია არის დაახლოებით (200-300bp). ITS მარკერებმა, როგორიცაა ITS1, დაამტკიცა მათი ეფექტურობა ფილოგენეტიკური ურთიერთობების გარკვევაში სხვადასხვა ტაქსებს შორის. უფრო მეტიც, ITS1 spacer დნმ ნაკლებად არის კონსერვირებული ვიდრე ITS2 spacer დნმ. ITS1 სტრუქტურები შენარჩუნებულია მხოლოდ ბევრად უფრო მცირე ტაქსონომიურ ერთეულებში. თითოეული ევკარიოტული რიბოსომური კლასტერი ასევე შეიცავს რეგიონებს, რომლებსაც უწოდებენ გარე ტრანსკრიბირებული სპაისერებს (5' და 3' ETS).
სურათი 01: ITS1 რეგიონი
ITS1 დისპანსერი დნმ ძალიან ახლოს არის 5'გარე ტრანსკრიბირებული სპაისერთან (5' ETS). გარდა ამისა, თუ ვინმეს სურს ITS1 რეგიონის გაძლიერება ფილოგენეტიკური ურთიერთობის კვლევებისთვის, მათ უნდა გამოიყენონ კონკრეტული პრაიმერის წყვილი (უკუ და წინსვლის პრაიმერები) ამ მიზნით. ITS1 რეგიონის გასაძლიერებლად, ლაბორატორიების PCR პროტოკოლებში ჩვეულებრივ გამოიყენება ორი პრაიმერის ნაკრები. ისინი არიან ITS1 წინ და ITS2 უკან ან ITS1 წინ და ITS4 უკან.
რა არის ITS2?
ITS2 არის შუალედური დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 5.8S და 28S rRNA გენებს შორის. ITS2 რეგიონს აქვს უფრო მოკლე სიგრძის ვარიაცია, ვიდრე ITS1 რეგიონს. ITS2-ის სიგრძის ვარიაცია არის დაახლოებით (180-240bp). თუმცა, ITS2 რეგიონი უფრო კონსერვირებულია, ვიდრე ITS1 რეგიონი ბევრ ტაქსონომიურ ერთეულში. ის განსაზღვრავს, რომ ყველა ITS2 თანმიმდევრობას აქვს მეორადი სტრუქტურის საერთო ბირთვი. უფრო მეტიც, 40% ITS2 რეგიონი დაცულია ყველა ანგიოსპერმებს შორის, მაშინ როცა შესაძლებელია ITS2 რეგიონის 50%-ის გასწორება ოჯახსა და უფრო მაღალ დონეზე.
სურათი 02: ITS2 რეგიონი
კონსერვაციის ფარგლების მიუხედავად, ITS2 რეგიონის გამოყენება ასევე ძალიან პოპულარულია, როგორიცაა ITS1 რეგიონი ფილოგენეტიკური ურთიერთობის კვლევებში, განსაკუთრებით სოკოების დნმ-ის შტრიხკოდირებაში. ITS2 რეგიონის გასაძლიერებლად, პრაიმერის სპეციფიკური ნაკრები ჩვეულებრივ გამოიყენება ლაბორატორიების PCR პროტოკოლებში. ეს არის ITS1 წინ და ITS4 უკან. მაგრამ როდესაც PCR პროტოკოლი იყენებს ამ პრაიმერის კომპლექტს, ის ასევე აძლიერებს ITS1 რეგიონს ITS2 რეგიონთან ერთად. გარდა ამისა, ITS2 spacer დნმ არის ძალიან ახლოს 3'გარე ტრანსკრიბირებულ სპაისერთან (3' ETS).
მსგავსება ITS1-სა და ITS2-ს შორის
- ITS1 და ITS2 არის ორი დისტანციური დნმ, რომელიც მდებარეობს rRNA გენებს შორის.
- ისინი გვხვდება მხოლოდ ევკარიოტებში.
- ორივე შეიძლება გაძლიერდეს კონკრეტული პრაიმერის წყვილების გამოყენებით.
- ორივე ამოკვეთილია rRNA მომწიფებისას, როგორც არაფუნქციური ქვეპროდუქტები.
- ორივე ძალიან მნიშვნელოვანია ფილოგენეტიკური ურთიერთობის კვლევებისთვის, განსაკუთრებით სოკოების დნმ-ის შტრიხკოდირებისას.
სხვაობა ITS1-სა და ITS2-ს შორის
ITS1 არის დისტანციური დნმ, რომელიც იმყოფება ევკარიოტებში 18S და 5.8S rRNA გენებს შორის, ხოლო ITS2 არის დისპერსიული დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 5.8S და 28S rRNA გენებს შორის. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება ITS1-სა და ITS2-ს შორის. გარდა ამისა, ITS1-ს აქვს უფრო დიდი სიგრძის ცვალებადობა ITS2-თან შედარებით. მეორეს მხრივ, ITS2-ს აქვს უფრო მოკლე სიგრძის ცვალებადობა ITS1-თან შედარებით. ეს არის კიდევ ერთი განსხვავება ITS1-სა და ITS2-ს შორის.
ქვემოთ მოცემულ ინფოგრაფიკაში მოცემულია განსხვავებები ITS1 და ITS2 შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
შეჯამება – ITS1 vs ITS2
შიდა ტრანსკრიბირებული რეგიონი (ITS) არის დნმ-ის შუალედური ნაწილის არაფუნქციური ნაწილი, რომელიც მდებარეობს rRNA გენებს შორის. ბაქტერიებსა და არქეებში მხოლოდ ერთი ITS რეგიონია.მაგრამ ევკარიოტებში არსებობს ორი ITS რეგიონი: ITS1 და ITS2. ITS1 არის დისპერსიული დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 18S და 5.8S rRNA გენებს შორის, ხოლო ITS2 არის დისპერსიული დნმ, რომელიც მდებარეობს ევკარიოტებში 5.8S და 28S rRNA გენებს შორის. ამრიგად, ეს არის ITS1-სა და ITS2-ს შორის განსხვავების შეჯამება.
