მთავარი განსხვავება დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის არის ის, რომ დნმ ტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გადაადგილდებიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე ჭრისა და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით, ხოლო რეტროტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც მოძრაობენ ერთი ადგილიდან. სხვას გენომში კოპირების და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით.
მობილური გენეტიკური ელემენტები (MGE) არის დნმ-ის სეგმენტები, რომლებიც კოდირებენ სპეციფიკურ ფერმენტებსა და ცილებს, რომლებიც შუამავლობენ მათ მოძრაობას გენომში, ან რომლებიც შეიძლება გადავიდეს ერთი სახეობიდან მეორეზე. ისინი ასევე ცნობილია როგორც ეგოისტური გენეტიკური ელემენტები. გადასატანი ელემენტები წარმოადგენს მობილური გენეტიკური ელემენტების რამდენიმე სახეობიდან ერთ-ერთს.არსებობს ტრანსპოზონური ელემენტების ორი ძირითადი ტიპი: დნმ ტრანსპოზონები და რეტროტრანსპოზონები. მაშასადამე, დნმ ტრანსპოზონები და რეტროტრანსპოზონები მობილური გენეტიკური ელემენტებია, რომლებსაც შეუძლიათ გადაადგილება გენომში ადგილიდან ადგილზე.
რა არის დნმ ტრანსპოზონები?
დნმ ტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გადაადგილდებიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე ჭრისა და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით. ისინი მიეკუთვნებიან II კლასის ტრანსპობილ ელემენტებს, რომლებიც მოძრაობენ დნმ-ის შუალედში. ეს ეწინააღმდეგება I კლასის ტრანსპოზირებად ელემენტებს (რეტროტრანსპოზონები), რომლებიც მოძრაობენ რნმ-ის შუალედში. ჩვეულებრივ, დნმ-ის ტრანსპოზონები მოძრაობენ გენომში ჭრისა და ჩასმის მეთოდის გამოყენებით. ეს მეთოდი მოითხოვს ტრანსპოზაზას ფერმენტს, რომელიც კატალიზებს დნმ-ის მოძრაობას მისი ამჟამინდელი მდებარეობიდან გენომში და ჩასმა ახალ ადგილას.
სურათი 01: დნმ ტრანსპოზონები
ამ ტრანსპოზიციას სჭირდება დნმ-ის სამი ადგილი ტრანსპოზონზე (ორი ტრანსპოზიონის თითოეულ ბოლოზე, რომელსაც ეწოდება ტერმინალური ინვერსიული გამეორებები და ერთი სამიზნე ადგილზე). ტრანსპოზაზას ფერმენტი დაუკავშირდება ტრანსპოზონის ბოლო ინვერსიულ გამეორებებს და შუამავლობს ტრანსპოზონის ბოლოების სინაფსს. შემდეგ ტრანსპოზაზას ფერმენტი წყვეტს ელემენტს თავდაპირველი დონორის ადგილის ფლანგური დნმ-ისგან და შუამავლობს ტრანსპოზონის შეერთებას გენომში ახალ ჩასმის ადგილთან. ტრანსპოზიონის დამატება ახალ ადგილას იწვევს მოკლე ხარვეზებს ჩასმული სეგმენტის ორივე მხარეს. მასპინძელი სისტემები ასწორებენ ამ ხარვეზებს, რის შედეგადაც ხდება სამიზნე თანმიმდევრობის დუბლირება (TSD), რაც დამახასიათებელია ტრანსპოზიციისთვის.
რა არის რეტროტრანსპოზონები?
რეტროტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გადაადგილდებიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე კოპირების და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით. ისინი მიეკუთვნებიან I კლასის გადასატან ელემენტებს. I კლასის ტრანსპოსირებადი ელემენტები (რეტროტრანსპოზონები) მოძრაობენ გენომში შუალედური რნმ-ით. ისინი წარმოადგენენ გენეტიკური კომპონენტის ტიპს, რომლებიც კოპირებენ და ათავსებენ საკუთარ თავს სხვადასხვა გენომურ ადგილას.
სურათი 02: რეტროტრანსპოზონები
პირველ რიგში, ისინი ტრანსკრიბირებულია დნმ-დან რნმ-ზე. შემდეგ წარმოქმნილი რნმ უკუ ტრანსკრიბირებულია დნმ-ზე. ეს კოპირებული დნმ მოგვიანებით ისევ ჩასმულია გენომში ახალ ადგილას. საპირისპირო ტრანსკრიპცია კატალიზებულია საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას მიერ. საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა ხშირად კოდირებულია თავად რეტროტრანსპოზინით. ინტეგრაციას ახორციელებს ფერმენტი, რომელსაც ინტეგრაზა ეწოდება. გარდა ამისა, ჩვეულებრივ არის სამი ტიპი: გრძელი ტერმინალის გამეორებები (LTR), გრძელი შეჯვარებული ბირთვული ელემენტები (LINE) და მოკლე ინტერსპერული ბირთვული ელემენტები (SINE).
რა მსგავსებაა დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის?
- დნმ ტრანსპოზონები და რეტროტრანსპოზონები მობილური გენეტიკური ელემენტებია.
- ორივე კლასიფიცირებულია გადასატან ელემენტებში.
- ორივე ცნობილია როგორც ხტომის გენი.
- მათ შეუძლიათ გადაადგილება გენომში ადგილიდან ადგილზე.
- ისინი ძალიან მნიშვნელოვანია ევოლუციურად.
რა განსხვავებაა დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის?
დნმ ტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გადადიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე ჭრისა და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით, ხოლო რეტროტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გადადიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე ასლის და გამოყენებით. პასტის მექანიზმი. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის. გარდა ამისა, დნმ ტრანსპოზონები მიეკუთვნება II კლასის ტრანსპოზირებად ელემენტებს, ხოლო რეტროტრანსპოზონები მიეკუთვნება I კლასის ტრანსპოზირებად ელემენტებს.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – დნმ ტრანსპოზონები რეტროტრანსპოზონების წინააღმდეგ
დნმ ტრანსპოზონები და რეტროტრანსპოზონები მობილური გენეტიკური ელემენტებია. დნმ-ის ტრანსპოზიონები გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე გადაადგილდებიან მოჭრილი პასტის მექანიზმის გამოყენებით. რეტროტრანსპოზონები გადაადგილდებიან გენომში ერთი ადგილიდან მეორეზე კოპირების და ჩასმის მექანიზმის გამოყენებით. ასე რომ, ეს აჯამებს განსხვავებას დნმ ტრანსპოზონებსა და რეტროტრანსპოზონებს შორის.