ძირითადი განსხვავება T4 დნმ ლიგაზასა და E. coli დნმ ლიგაზას შორის არის ის, რომ T4 დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია ბაქტერიოფაგ T4-დან, ხოლო E. coli დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია ბაქტერიისგან E. coli..
დნმ ლიგაზა არის ფერმენტის სპეციფიკური ტიპი, რომელიც ხელს უწყობს დნმ-ის ჯაჭვების ერთმანეთთან შეერთებას ფოსფოდიესტერული ბმის წარმოქმნით. ის მნიშვნელოვან როლს ასრულებს ცოცხალი ორგანიზმების დნმ-ში ერთჯაჭვიანი და ორჯაჭვიანი რღვევების აღდგენით. უფრო მეტიც, დნმ ლიგაზა გამოიყენება როგორც დნმ-ის შეკეთებაში, ასევე დნმ-ის რეპლიკაციაში. ზემოაღნიშნული გამოყენების გარდა, დნმ ლიგაზას ასევე აქვს ფართო გამოყენება მოლეკულურ ბიოლოგიურ ექსპერიმენტებში, როგორიცაა რეკომბინანტული დნმ ტექნოლოგია. T4 დნმ ლიგაზა და E. coli დნმ ლიგაზა არის დნმ ლიგაზას ფერმენტების ორი ტიპი.
რა არის T4 დნმ ლიგაზა?
T4 ლიგაზა არის დნმ-ის შემაერთებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია ბაქტერიოფაგ T4-დან. T4 ბაქტერიოფაგი არის ვირუსი, რომელიც აინფიცირებს Escherichia coli-ს. T4 ლიგაზას ფერმენტი არის ყველაზე ხშირად გამოყენებული დნმ ლიგაზა მოლეკულურ ბიოლოგიურ ლაბორატორიულ კვლევებში. ჩვეულებრივ, T4 ლიგაზა კატალიზებს ორჯაჭვიანი დნმ-ის ორი შეკრული ან ბლაგვი ჯაჭვის შეერთებას მიმდებარე ნუკლეოტიდების 5'ფოსფატულ და 3'ჰიდროქსილის ჯგუფებს შორის. მას ასევე შეუძლია რნმ-ის შეერთების კატალიზირება დნმ-ის ან რნმ-ის ჯაჭვთან დუპლექსის მოლეკულაში. თუმცა, ეს ფერმენტი არ შეუერთდება ერთჯაჭვიან ნუკლეინის მჟავებს. უფრო მეტიც, მას ასევე შეუძლია ბლაგვი ბოლოიანი დნმ-ის ლიგატი ბევრად უფრო დიდი ეფექტურობით, ვიდრე E. coli დნმ ლიგაზა.
სურათი 01: T4 დნმ ლიგაზა
ეს ფერმენტი მოითხოვს ATP-ს, როგორც კოფაქტორს. გენეტიკური ინჟინერიის ზოგიერთმა კვლევითმა ექსპერიმენტმა უკვე გამოუშვა უფრო აქტიური დნმ ლიგაზას ფერმენტები, ვიდრე ველური ტიპის T4 დნმ ლიგაზა. ერთ-ერთ მიდგომაში მათ შექმნეს ფერმენტის შერწყმის მოლეკულა T4 დნმ ლიგაზას p50 ან NF-kB მოლეკულასთან შერწყმით. ეს ახალი T4 ლიგაზას ფერმენტი 160%-ით უფრო აქტიური იყო ბლაგვი ბოლო ლიგატების კლონირების მიზნით, ვიდრე ველური ტიპის T4 დნმ ლიგაზა. გარდა ამისა, T4 დნმ ლიგაზას ოპტიმალური ტემპერატურა ლიგაციის რეაქციის უფრო ზუსტად კატალიზებისთვის არის 16 °C.
რა არის E Coli დნმ ლიგაზა?
E. coli დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E. coli ბაქტერიისგან. გენი, რომელიც პასუხისმგებელია E. coli დნმ ლიგაზას წარმოქმნაზე, არის lig გენი. E. coli დნმ, ლიგაზა, ისევე როგორც პროკარიოტების უმეტესი დნმ ლიგაზები, იყენებენ ენერგიას, რომელიც მიიღება NAD-ით (ნიკოტინამიდ ადენინ დინუკლეოტიდი) ფოსფოდიესტერული კავშირის შესაქმნელად.
სურათი 02: E. Coli დნმ ლიგაზა
E. coli დნმ ლიგაზა არის ლიგირებადი ფერმენტი, რომელსაც შეუძლია შეუერთდეს დნმ-ის ფრაგმენტებს ფოსფოდიესტერული ბმების წარმოქმნის კატალიზაციით ორჯაჭვიან დნმ-ის ფრაგმენტებს შორის, რომლებიც შეიცავს 5'ფოსფატის ბოლოსა და 3'ჰიდროქსილის ბოლოებს. უფრო მეტიც, ის არ აკავშირებს ბლაგვი ბოლოებით დნმ-ს, გარდა სპეციალური პირობებისა, როგორიცაა მოლეკულური გადატვირთვა პოლიეთილენ გლიკოლით. მას ასევე არ შეუძლია ეფექტურად შეუერთოს რნმ დნმ-ს. გარდა ამისა, E. coli დნმ ლიგაზას აქტივობა შეიძლება გაძლიერდეს დნმ პოლიმერაზა 1-ის არსებობით სწორი კონცენტრაციით. თუმცა, როდესაც დნმ პოლიმერაზა 1 ფერმენტის კონცენტრაცია უფრო მაღალია, მას აქვს უარყოფითი გავლენა E. coli დნმ ლიგაზას აქტივობაზე.
რა მსგავსებაა T4 დნმ ლიგაზასა და E Coli დნმ ლიგაზას შორის?
- T4 დნმ ლიგაზა და E-coli დნმ ლიგაზა არის დნმ ლიგაზას ფერმენტების ორი ტიპი.
- ორივე ცილაა, რომელიც შედგება ამინომჟავებისგან.
- ეს ფერმენტები ახდენენ ფოსფოდიესტერული კავშირის ფორმირებას დუპლექს დნმ-ში შეთავსებულ 5'ფოსფატსა და 3'ჰიდროქსილის ბოლოებს შორის.
- მათ აქვთ ფართო გამოყენება მოლეკულური ბიოლოგიის ექსპერიმენტებში, როგორიცაა რეკომბინანტული დნმ ტექნოლოგია.
რა განსხვავებაა T4 დნმ ლიგაზასა და E Coli დნმ ლიგაზას შორის?
T4 დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია ბაქტერიოფაგ T4-დან, ხოლო E. coli დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E. coli ბაქტერიისგან. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება T4 დნმ ლიგაზასა და E. coli დნმ ლიგაზას შორის. გარდა ამისა, T4 დნმ ლიგაზას ენერგიის წყაროა ATP. მეორე მხრივ, E. coli დნმ ლიგაზას ენერგიის წყაროა NAD.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს T4 დნმ ლიგაზასა და E coli დნმ ლიგაზას შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე - T4 დნმ ლიგაზა vs E Coli დნმ ლიგაზა
T4 დნმ ლიგაზა და E. coli დნმ ლიგაზა არის ორი ფერმენტი, რომელიც ახორციელებს ფოსფოდიესტერული კავშირის ფორმირებას დუპლექსურ დნმ-ში შეთავსებულ 5' ფოსფატსა და 3' ჰიდროქსილის ბოლოებს შორის. T4 ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია ბაქტერიოფაგ T4-დან, ხოლო E. coli დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E. coli ბაქტერიისგან. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება T4 დნმ ლიგაზასა და E coli დნმ ლიგაზას შორის.
