სხვაობა დნმ ლიგაზასა და დნმ პოლიმერაზას შორის

2024 ავტორი: Alex Aldridge | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2023-12-17 13:43

ძირითადი განსხვავება - დნმ ლიგაზა დნმ პოლიმერაზას წინააღმდეგ

დნმ ლიგაზა და დნმ პოლიმერაზა მნიშვნელოვანი ფერმენტებია, რომლებიც მონაწილეობენ ორგანიზმების დნმ-ის რეპლიკაციაში და დნმ-ის აღდგენის მექანიზმებში. დნმ ლიგაზა პასუხისმგებელია დნმ-ის ფრაგმენტების შეერთებაზე ნუკლეოტიდებს შორის ფოსფოდიესტერული ბმების წარმოქმნის კატალიზაციით. დნმ პოლიმერაზა პასუხისმგებელია დნმ-ის სინთეზზე მისი სამშენებლო ბლოკებიდან (ნუკლეოტიდები) შაბლონური დნმ-ის გამოყენებით. ეს არის მთავარი განსხვავება დნმ ლიგაზასა და დნმ პოლიმერაზას შორის.

რა არის დნმ ლიგაზა?

დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც კატალიზებს ფოსფოდიესტერული ბმის ფორმირებას ნუკლეოტიდების 3'-OH და 5'-PO_{4 ჯგუფებს შორის და ხელს უწყობს დნმ-ის ფრაგმენტების შეერთებას.იგი ასევე ცნობილია როგორც მოლეკულური ნაკერი. ეს უნარი იძლევა დნმ-ის ხარვეზების ან ლაქების შევსებას და დნმ-ის რეპლიკაციის დროს წარმოქმნილი ოკაზაკის ფრაგმენტების შეერთებას. დნმ ლიგაზები ძალზე სასარგებლოა რეკომბინანტული დნმ-ის ტექნოლოგიაში რეკომბინანტული დნმ-ის მოლეკულების წარმოებისთვის. დნმ ლიგაზა უერთდება საინტერესო დნმ-ს ვექტორულ დნმ-ს. ამიტომ ის ორგანიზმებისთვის მნიშვნელოვანი ფერმენტია.}

დნმ ლიგაზას ფერმენტი მისი ფუნქციისთვის დამოკიდებულია კოფაქტორზე და Mg2⁺ იონებზე. არსებობს ორი კოფაქტორი, რომელიც ეხმარება დნმ-ის ლიგაზებს. NAD^{+ მოქმედებს როგორც კოფაქტორი ბაქტერიული დნმ ლიგაზებისთვის, ხოლო ATP ხშირად მოქმედებს როგორც კოფაქტორული ვირუსი და ევკარიოტული დნმ ლიგაზები. ევკარიოტული დნმ ლიგაზას მოქმედება სრულდება სამი ძირითადი საფეხურით.}

ნაბიჯი 01. დნმ ლიგაზა უტევს ATP მოლეკულას და ათავისუფლებს პიროფოსფატს (ორი ფოსფატის ჯგუფი) და AMP და აყალიბებს ლიგაზა-ადენილატის შუალედს კოვალენტურად შეკვრის შედეგად AMP-თან.

ნაბიჯი 02: ჩამოყალიბებული ფერმენტ AMP შუალედური გადააქვს AMP-ს წიაღის 5' ფოსფატზე და აყალიბებს დნმ - ადენილატს (დნმ-ის ჯაჭვის 5'-ფოსფატური ჟანგბადი უტევს ლიგაზა-ადენილატის შუალედური ფოსფორს).

ნაბიჯი 03: დნმ ლიგაზა კატალიზებს 3'-OH ნიკის შეტევას დნმ-ადენილატზე, რათა შეუერთდეს პოლინუკლეოტიდებს და ათავისუფლებს AMP.

დნმ ლიგაზები ჩვეულებრივ იზოლირებულია T4 ბაქტერიოფაგისგან და ფართოდ გამოიყენება რეკომბინანტულ დნმ ტექნოლოგიაში.

სურათი 01: დნმ ლიგაზა ნიკაპის შეკეთებისას

რა არის დნმ პოლიმერაზა?

დნმ პოლიმერაზა არის ყველგან გავრცელებული ფერმენტი, რომელიც იმყოფება ყველა ორგანიზმში, რომელიც მონაწილეობს დნმ-ის სინთეზსა და გენომის რეპლიკაციაში. გენეტიკური ინფორმაცია გადადის მშობლიდან შთამომავლობაზე დნმ პოლიმერაზების დახმარებით. იგი ახდენს არსებული დნმ-ის კომპლემენტარული ახალი დნმ-ის სინთეზს. დნმ პოლიმერაზა ამატებს ნუკლეოტიდებს (ნუკლეინის მჟავების სამშენებლო ბლოკებს) პრაიმერის თანმიმდევრობის 3' OH ჯგუფს და აგრძელებს ჯაჭვის ფორმირებას 5' მიმართულებით.დნმ-პოლიმერაზების უმეტესობას აქვს 5'-დან 3'-მდე პოლიმერაზული აქტივობა და 3'-დან 5'-მდე ეგზონუკლეაზური აქტივობა კორექტირებისთვის.

პროკარიოტული დნმ პოლიმერაზები აღწერილია ხუთ ძირითად ჯგუფში. ევკარიოტები შეიცავს სულ მცირე 16 განსხვავებულ დნმ პოლიმერაზას. ყველა ეს დნმ პოლიმერაზა დაჯგუფებულია შვიდ ოჯახად, კერძოდ A, B, C, D, X, Y და RT (უკუ ტრანსკრიპტაზა).

სურათი 02: დნმ პოლიმერაზა განპირობებული დნმ-ის რეპლიკაცია

რა განსხვავებაა დნმ ლიგაზასა და დნმ პოლიმერაზას შორის?

დნმ ლიგაზა vs დნმ პოლიმერაზა
დნმ ლიგაზა არის ფერმენტი, რომელიც ახდენს ნუკლეოტიდებს შორის ფოსფოდიესტერული ბმების წარმოქმნას და ერთმანეთთან აკავშირებს დნმ-ის ფრაგმენტებს.	დნმ პოლიმერაზა არის ფერმენტი, რომელიც აკატალიზებს დნმ-ის სინთეზს ნუკლეოტიდების გამოყენებით.
როლი დნმ-ის რეპლიკაციაში
დნმ ლიგაზა არის დამატებითი ფერმენტი დნმ-ის რეპლიკაციაში, რომელიც უერთდება ოკაზაკის ფრაგმენტებს.	დნმ პოლიმერაზა არის მთავარი ფერმენტი დნმ-ის რეპლიკაციაში.
მოთხოვნები
ეს დამოკიდებულია Mg2+ იონებზე და ATP/NAD+ კოფაქტორებზე	ეს დამოკიდებულია შაბლონზე, ნუკლეოტიდებზე, პრაიმერებზე და Mg2+.
ფუნქციები
დნმ ლიგაზა მნიშვნელოვანია დნმ-ის რეკომბინაციისთვის, დნმ-ის აღდგენისა და დნმ-ის რეპლიკაციისთვის.	დნმ პოლიმერაზა მნიშვნელოვანია დნმ-ის რეპლიკაციისთვის, დნმ-ის აღდგენისა და დნმ-ის რეკომბინაციის ტექნოლოგიისთვის.

შეჯამება - დნმ ლიგაზა vs დნმ პოლიმერაზა

დნმ ლიგაზა არის მნიშვნელოვანი ფერმენტი, რომელიც საჭიროა დნმ-ის ფრაგმენტების ფოსფოდიესტერული ბმებით შეერთებისთვის. დნმ პოლიმერაზა არის მთავარი ფერმენტი, რომელიც მნიშვნელოვანია ახალი დნმ-ის სინთეზისთვის. დნმ ლიგაზასა და დნმ პოლიმერაზას შორის მთავარი განსხვავებაა მათი ფუნქცია. თუმცა, ორივე ფერმენტი აუცილებელია დნმ-ის აღდგენისთვის, დნმ-ის რეპლიკაციისთვის და რეკომბინანტული დნმ-ის ტექნოლოგიისთვის.