ძირითადი განსხვავება LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის არის ის, რომ LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ტიპი, რომელსაც აქვს გრძელი ტერმინალური გამეორებები მათ სტრუქტურაში, ხოლო არა-LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ტიპი, რომელსაც არ აქვს გრძელი ტერმინალური გამეორება. მათ სტრუქტურაში.
რეტროტრანსპოზონები (I კლასის ტრანსპოზირებადი ელემენტები ან ტრანსპოზონები რნმ-ის შუალედური საშუალებებით) არის გენეტიკური კომპონენტის ტიპი, რომელსაც შეუძლია საკუთარი თავის კოპირება და ჩასმა სხვადასხვა გენომურ ადგილას. ისინი ამას ასრულებენ რნმ-ის დნმ-ად გადაქცევით პროცესის მეშვეობით, რომელსაც ეწოდება საპირისპირო ტრანსკრიფცია რნმ-ის ტრანსპოზიციის შუალედური ნივთიერების გამოყენებით.არსებობს რეტროტრანსპოზონების ორი ძირითადი ტიპი, როგორც LTR და არა LTR რეტროტრანსპოზონები
რა არის LTR რეტროტრანსპოზონები?
LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ტიპი, რომლებსაც აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში. განმეორებადი დნმ-ის გრძელი ჯაჭვები შეიძლება მოიძებნოს LTR რეტროტრანსპოზონის თითოეულ ბოლოში. ეს ცნობილია როგორც ხანგრძლივი ტერმინალის გამეორებები (LTR). თითოეული LTR არის რამდენიმე ასეული ბაზის წყვილის სიგრძე. LTR რეტროტრანსპოზონები ჩვეულებრივ 5 კილობაზზე მეტია. უფრო მეტიც, გრძელ ტერმინალურ გამეორებებს შორის არის გენები, რომელთა ტრანსკრიფცია შესაძლებელია რეტროვირუსის გენების gag და pol. ეს გენები გადახურულია ისე, რომ ისინი კოდირებენ პროტეაზას, რომელიც ჩვეულებრივ ამუშავებს მიღებულ ტრანსკრიპტს ფუნქციურ გენის პროდუქტებად.
სურათი 01: LTR რეტროტრანსპოზონები
რეტროტრანსპოზონების Gag გენი ქმნის პროდუქტს, რომელიც ასოცირდება სხვა რეტროტრანსპოზონების ტრანსკრიპტებთან ვირუსის მსგავსი ნაწილაკების წარმოქმნით. Pol გენი ქმნის პროდუქტებს, რომლებიც შეიცავს ფერმენტებს, როგორიცაა საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა, ინტეგრაზა და რიბონუკლეაზა H დომენები. საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას ფერმენტი ახორციელებს რეტროტრანსპოზონის დნმ-ის საპირისპირო ტრანსკრიფციას. ინტეგრაზა ფერმენტი აერთიანებს რეტროტრანსპოზონის დნმ-ს ევკარიოტული გენომის დნმ-ში. რიბონუკლეაზა H დომენები სასარგებლოა რნმ-ის შუალედებს შორის ფოსფოდიესტერული ბმების გაწყვეტაში. LTR რეტროტრანსპოზონები ასევე აკოდირებენ ტრანსკრიპტებს tRNA-ს შემაკავშირებელ ადგილებთან, რათა მათ საკმაოდ მარტივად გაიარონ საპირისპირო ტრანსკრიფცია. გარდა ამისა, ვინაიდან რეტროტრანსპოზიონი შეიცავს ევკარიოტული გენომის ინფორმაციას, მას შეუძლია თავისი ასლების ჩასმა ევკარიოტული უჯრედის სხვა გენომურ ადგილებში.
რა არის არა-LTR რეტროტრანსპოზონები?
არა-LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ტიპი, რომლებსაც არ აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში. LTR რეტროტრანსპოზონების მსგავსად, არა-LTR რეტროტრანსპოზონები ასევე შეიცავს გენებს საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას, რნმ-ის დამაკავშირებელ პროტეინს, ნუკლეაზას და ზოგჯერ რიბონუკლეაზას H დომენებს. მაგრამ მათ არ აქვთ გრძელი ტერმინალის გამეორებები; ამის ნაცვლად, მათ აქვთ მოკლე გამეორებები, რომლებსაც შეიძლება ჰქონდეთ ფუძეების შებრუნებული რიგი ერთმანეთის გვერდით. რნმ-ის დამაკავშირებელი პროტეინები უკავშირდებიან რნმ-ის ტრანსპოზიციის შუალედს და ნუკლეაზები წყვეტენ ფოსფოდიესტერულ კავშირებს ნუკლეოტიდებს შორის ნუკლეინის მჟავებში.
სურათი 02: LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონები
მიუხედავად იმისა, რომ ისინი რეტროტრანსპოზონები არიან, მათ არ შეუძლიათ შეასრულონ საპირისპირო ტრანსკრიფცია რნმ შუალედური ნივთიერების გამოყენებით ისევე, როგორც LTR რეტროტრანსპოზონები. ეს იმიტომ ხდება, რომ არა-LTR რეტროტრანსპოზონები არ შეიცავს თანმიმდევრობას, რომელიც აკავშირებს tRNA-ს. აქედან გამომდინარე, არა-LTR რეტროტრანსპოზიონი, რომელიც ტრანსკრიბირებულია mRNA-ში და ითარგმნება ცილებში, მოქმედებს როგორც საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა.საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა ქმნის არა-LTR რეტროტრანსპოზინის რნმ-ის დნმ-ის ასლს, რომელიც შეიძლება ინტეგრირებული იყოს გენომში ახალ ადგილზე. გარდა ამისა, არა-LTR რეტროტრანსპოზონები იყოფა ორ ტიპად: LINEs (გრძელი ინტერსპერსიული ბირთვული ელემენტები) და SINE (მოკლე ინტერსპერსიული ბირთვული ელემენტები).
რა მსგავსებაა LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის?
- LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ორი ძირითადი ტიპი.
- ორივე ტიპი შეიცავს გენებს ფერმენტებისთვის, როგორიცაა საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა, რნმ-ის დამაკავშირებელი ცილა, ნუკლეაზა და რიბონუკლეაზა H დომენები.
- ისინი გვხვდება ადამიანის გენომში.
- ორივე ტიპი ევოლუციურად მნიშვნელოვანია.
რა განსხვავებაა LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის?
LTR რეტროტრანსპოზონებს აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში, ხოლო არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს არ აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში.ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება LTR და არა LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის. გარდა ამისა, LTR რეტროტრანსპოზონებს აქვთ გრძელი პირდაპირი გამეორებები, რომლებიც ფუძეების მხოლოდ ერთი თანმიმდევრობაა, რომლებიც იმეორებენ საკუთარ თავს. მეორეს მხრივ, არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს აქვთ მოკლე გამეორებები, რომლებსაც შეიძლება ჰქონდეთ ფუძეების შებრუნებული რიგი ერთმანეთის გვერდით.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – LTR vs არა-LTR რეტროტრანსპოზონები
LTR და არა-LTR რეტროტრანსპოზონები არის რეტროტრანსპოზონების ორი ძირითადი ტიპი. LTR რეტროტრანსპოზონებს აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში, ხოლო არა-LTR რეტროტრანსპოზონებს არ აქვთ გრძელი ტერმინალური გამეორებები თავიანთ სტრუქტურაში. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება LTR და არა LTR რეტროტრანსპოზონებს შორის.
