პოლისომის პროფილირებასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ პოლისომის პროფილირება აანალიზებს რიბოსომის ქცევას როგორც რიბოზომის, ასევე mRNA (პოლისომის) გამოყენებით ტრანსლაციის დროს, ხოლო რიბოზომის პროფილირება აანალიზებს რიბოზომის ქცევას მხოლოდ mRNA თანმიმდევრობის გამოყენებით ტრანსლაციის დროს.
თარგმანი არის ცილის სინთეზის მეორე ფაზა, რომელიც გარდაქმნის ინფორმაციას mRNA-ში ამინომჟავების თანმიმდევრობად. Translatomics არის ORF-ების (ღია კითხვის ჩარჩოების) კვლევა, რომლებიც აქტიურად ითარგმნება ორგანიზმის უჯრედში. პოლისომის და რიბოსომის პროფილირების ტექნიკა არის ორი ტიპის ტექნიკა მოლეკულური ბიოლოგიის სფეროში, რათა შეფასდეს და გამოიტანოს სხვადასხვა პარამეტრები ტრანსლატომის ანალიზის კონტექსტში.
რა არის პოლისომის პროფილირება?
პოლიზომის პროფილირება არის ტექნიკა, რომელიც ადგენს კონკრეტული mRNA-ს ტრანსლაციის სტატუსს როგორც რიბოზომის, ასევე mRNA (პოლისომის) ქცევის ანალიზით. სხვა სიტყვებით რომ ვთქვათ, ეს ტექნიკა გვაწვდის მონაცემებს და დასკვნებს mRNA-ების რიბოზომებთან კავშირის შესახებ. პოლისომა ეხება რიბოზომების ჯგუფს, რომლებიც შეკრულია mRNA-სთან, რომელიც იმყოფება ტრანსლაციის დრეკადობის ფაზაში.
სურათი 01: პოლიზომური პროფილირება
პოლიზომის პროფილირებისთვის საჭიროა უჯრედის ლიზატი, რომელიც შემდეგ ცენტრიფუგირდება. შემდეგ ცენტრიფუგირებული ნიმუში გამოიყოფა მათი სიმკვრივის მიხედვით, რათა დაახასიათოს რიბოზომების მცირე და დიდი ქვედანაყოფები და შესაბამისი mRNA, რომლებიც მონაწილეობენ პოლისომის ფორმირებაში.გარდა ამისა, პროცესი ასევე მოიცავს ოპტიკური სიმკვრივის გაზომვას. ექსპერტებს მოეთხოვებათ პოლიზომური პროფილის შესრულება.
პოლიზომური პროფილირების ტექნიკა მნიშვნელოვანი ინსტრუმენტია მრავალი აპლიკაციისთვის. მეცნიერები იყენებენ ამ ტექნიკას უჯრედებში ტრანსლაციის ხარისხის შესასწავლად. უფრო კონკრეტულად, ეს არის ინსტრუმენტი ინდივიდუალური ცილების და მათი სპეციფიკური mRNA-ების შესწავლის შესახებ ზუსტი ინფორმაციის მიწოდებისთვის. კონკრეტული mRNA-ს ტრანსლაციის ხარისხის შესწავლის კონტექსტში სასიცოცხლოდ მნიშვნელოვანია პოლისომის პროფილირების ტექნიკა. აქ, mRNA-ს 3' და 5' თანმიმდევრობები შეიძლება გამოკვლეული იყოს მათი ზემოქმედების მითითებით წარმოებული mRNA-ს რაოდენობაზე და ტრანსლაციის დონეზე.
რა არის რიბოსომის პროფილირება?
რიბოსომის პროფილირება არის ტექნიკა, რომელიც აანალიზებს რიბოზომის ქცევას მის mRNA-სთან მიმართებაში ტრანსლაციის დროს. ეს ტექნიკა იპოვეს და შეიმუშავეს ჯოან სტეიცმა და მერილინ კოზაკმა. მოგვიანებით ეს ტექნოლოგია შემდგომში განვითარდა ორმა მეცნიერმა, ნიკოლასმა და ჯონათანმა, შემდეგი თაობის თანმიმდევრობასთან ერთად, რამაც განაპირობა სხვადასხვა დაკავშირებული ტექნიკის შემუშავება, როგორიცაა Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) მეთოდოლოგია.
სურათი 02: რიბოსომის თანმიმდევრობა
რიბოსომის პროფილირების პროცედურა მოიცავს mRNA-ს იზოლირებას, რნმ-ის მოცილებას, რომელიც არ არის დაკავშირებული რიბოზომებთან და mRNA-ის გამოყოფას, რომელიც დაკავშირებულია რიბოზომებთან. ამ პროცედურის შემდეგ mRNA იზოლატის საპირისპირო ტრანსკრიბცია ხდება და ხდება cDNA სინთეზი. დაბოლოს, თანმიმდევრობის მონაცემები შეიძლება გასწორდეს მთარგმნელობით პროფილთან, რათა გამოიტანოს რიბოსომის ქცევის მახასიათებლები mRNA-სთან მიმართებაში.
რიბოსომის პროფილირება ეხმარება ბევრ მკვლევარს იდენტიფიცირება და დასკვნა თარგმანის საწყისი ადგილების ადგილმდებარეობის, გადათარგმნილი ღია წაკითხვის ჩარჩოების (ORFs) კომპლიმენტის უჯრედში ან ქსოვილში, რიბოზომების განაწილება mRNA-ზე და სიხშირე. რიბოზომების თარგმნა.რიბოსომის პროფილირება ასევე ცნობილია, როგორც რიბოსომის ნაკვალევი ან Ribo Seq.
რა მსგავსებაა პოლისომის პროფილირებასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის?
- პოლიზომისა და რიბოსომის პროფილირება არის მოლეკულური ბიოლოგიური ტექნიკა, რომელიც მნიშვნელოვანია კვლევაში.
- ისინი გვაწვდიან ინფორმაციას თარგმნის პროცესის შესახებ.
- პროფილირების ორივე პროცესი იძლევა მონაცემებს ტრანსლატომის ანალიზით.
- საჭიროა პროფესიონალი ექსპერტები ორივე ტექნიკის შესასრულებლად ზუსტი შედეგისთვის.
- ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოები მნიშვნელოვან როლს თამაშობენ ორივე ტექნიკაში.
რა განსხვავებაა პოლისომის პროფილირებასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის?
პოლიზომის პროფილირება აანალიზებს რიბოსომის ქცევას როგორც რიბოზომის, ასევე mRNA (პოლისომის) გამოყენებით ტრანსლაციის დროს, ხოლო რიბოზომის პროფილირება აანალიზებს რიბოზომის ქცევას მხოლოდ mRNA თანმიმდევრობის გამოყენებით ტრანსლაციის დროს.ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება პოლისომის პროფილირებასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის. უფრო მეტიც, პოლისომის პროფილირება მოიცავს ისეთ ტექნიკას, როგორიცაა სიმკვრივის გრადიენტური ცენტრიფუგაცია და ოპტიკური სიმკვრივის გაზომვები, ხოლო რიბოსომის პროფილირება მოიცავს mRNA-ს ექსტრაქციას და თანმიმდევრობის ტექნიკას. ასევე, რიბოსომის პროფილირება უფრო ზუსტია, ვიდრე პოლიზომური პროფილირება.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს პოლისომასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
შეჯამება – პოლისომის პროფილირება vs რიბოსომის პროფილი
თარგმანი არის ცილის სინთეზის მეორე ფაზა, რომელიც მოიცავს mRNA თანმიმდევრობის შესახებ ინფორმაციის ამინომჟავის თანმიმდევრობად გადაქცევას. ამ პროცესს სჭირდება mRNA შაბლონი, რიბოზომები, ამინომჟავები, tRNA და სხვა ფაქტორები. პოლისომა და რიბოსომის პროფილირება ორი მოლეკულური ტექნიკაა. პოლისომის პროფილირება აანალიზებს რიბოსომის ქცევას როგორც რიბოზომის, ასევე mRNA (პოლისომის) გამოყენებით ტრანსლაციის დროს, ხოლო რიბოზომის პროფილირება აანალიზებს რიბოზომის ქცევას მხოლოდ mRNA თანმიმდევრობის გამოყენებით ტრანსლაციის დროს.პოლისომის პროფილირება მოიცავს ტექნიკას, როგორიცაა სიმკვრივის გრადიენტური ცენტრიფუგაცია და ოპტიკური სიმკვრივის გაზომვები. რიბოსომის პროფილირება მოიცავს ტექნიკას, როგორიცაა mRNA ექსტრაქცია, cDNA სინთეზი და თანმიმდევრობა. ასე რომ, ეს აჯამებს განსხვავებას პოლისომის პროფილირებასა და რიბოზომის პროფილირებას შორის.
