CDS-სა და ORF-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ CDS არის გენის ის ფაქტობრივი ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც ითარგმნება ცილად, ხოლო ORF არის დნმ-ის თანმიმდევრობის მონაკვეთი, რომელიც იწყება ტრანსლაციის დაწყების ადგილით (დაწყების კოდონით) და მთავრდება თარგმანის შეწყვეტის საიტი (სტოპ კოდონი).
გენს აქვს კოდირების თანმიმდევრობა (CDS). იგი შედგება გენის მთლიანი ეგზონებისა და საწყისი კოდონისა და გაჩერების კოდონისგან. ეს არის გენის რეალური ნაწილი, რომელიც თარგმნის და გამოიმუშავებს ცილებს. ღია წაკითხვის ჩარჩო ან ORF არის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა, რომელიც მდებარეობს საწყისი კოდონსა და გაჩერების კოდონს შორის. ORF-ში არ არსებობს გაჩერების კოდონი, რომელიც წყვეტს გენეტიკურ კოდს, რომელიც ითარგმნება ცილად.პროკარიოტებში, გენის CDS და ORF იგივეა.
რა არის CDS?
CDS ან კოდირების თანმიმდევრობა არის გენის ნაწილი, რომელიც რეალურად ითარგმნება ცილად. იგი შედგება ეგზონებისა და ორი კოდონისგან, რომლებიც ცნობილია როგორც AUG კოდონი და სტოპ კოდონი. CDS არ შეიცავს ორ გადაუთარგმნელ რეგიონს: 5' UTR და 3' UTR. უფრო მეტიც, ინტრონები არ შედის CDS-ში.
სურათი 01: კოდირების თანმიმდევრობა
როდესაც შევადარებთ ინდივიდის მთელ გენომს, კოდირების თანმიმდევრობა მცირე ფრაქციაა. კოდირების თანმიმდევრობა შედგება აუცილებელი ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობისგან ცილის ამინომჟავის თანმიმდევრობის შესაქმნელად. ამრიგად, CDS არის კონცენტრირებული ეგზონები, რომლებიც შეიძლება დაიყოს ნუკლეოტიდულ სამეულებად ან კოდონებად. კოდონები წარმოქმნიან ამინომჟავებს.
რა არის ORF?
ღია წაკითხვის ჩარჩო ან ORF არის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობის უწყვეტი მონაკვეთი, რომელიც იწყება საწყისი კოდონით და მთავრდება გაჩერების კოდონით.მარტივი სიტყვებით, ORF ეხება ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობის რეგიონს, რომელიც მდებარეობს საწყისი და გაჩერების კოდონებს შორის. მათ შორის, არ არსებობს გაჩერების კოდონი, რომელიც წყვეტს ORF-ს. ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა დაწყებისა და გაჩერების კოდონებს შორის კოდირებს ამინომჟავებს. ზოგადად, საწყისი კოდონი არის ATG, ხოლო გაჩერების კოდონები არის TAG, TAA და TGA. ORF იძლევა ფუნქციურ ცილას ტრანსკრიბციის და თარგმნისას. აქედან გამომდინარე, ORF მოიცავს საწყისი კოდონს, რამდენიმე კოდონს შუა რეგიონში და გაჩერების კოდონს. საინტერესოა, რომ ORF-ს აქვს სიგრძე, რომელიც შეიძლება დაიყოს სამზე.
სურათი 02: გახსენით კითხვის ჩარჩო
პროკარიოტებში, რადგან არ არსებობს ინტრონები, ORF არის გენის კოდირების თანმიმდევრობა, რომელიც ტრანსკრიფციას უშუალოდ რნმ-ში ახდენს. ამიტომ, CDS და PRF იგივეა პროკარიოტებში. პროკარიოტებში გენების ძიებისას ადვილია ORF-ის აღმოჩენა და გენის პოვნა პროკარიოტებში.ევკარიოტებში, რადგან არსებობს ინტრონები, ORF არის კოდონის თანმიმდევრობა, რომელიც წარმოიქმნება დამუშავების ან რნმ-ის შერწყმის შემდეგ. ORF არის მტკიცებულება, რომელიც ეხმარება გენის პროგნოზირებას, სანამ ORF სავარაუდოდ გენის ნაწილია.
რა მსგავსებაა CDS-სა და ORF-ს შორის?
- პროკარიოტებში CDS და ORF იგივეა.
- ორივეს აქვს საწყისი კოდონი და გაჩერების კოდონი.
- მათ აქვთ რამდენიმე ნუკლეოტიდი, რომელიც შეიძლება გაიყოს სამზე.
- როდესაც ისინი თარგმნიან, ისინი წარმოქმნიან ამინომჟავების თანმიმდევრობას.
რა განსხვავებაა CDS-სა და ORF-ს შორის?
CDS არის გენის რეალური ნაწილი, რომელიც ითარგმნება ცილად, ხოლო ORF არის დნმ-ის მონაკვეთი საწყისი კოდონსა და გაჩერების კოდონს შორის. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება CDS-სა და ORF-ს შორის. გარდა ამისა, CDS არ შეიცავს ინტრონებს, მაგრამ ORF შეიძლება შეიცავდეს ინტრონებს. CDS სრულად გადაიწერება სრულ mRNA თანმიმდევრობაში, ხოლო ORF შეიძლება იყოს mRNA თანმიმდევრობის ნაწილი.ამრიგად, ეს არის კიდევ ერთი განსხვავება CDS-სა და ORF-ს შორის.
ქვემოთ ინფოგრაფიკის ცხრილები გვერდიგვერდ ასახავს განსხვავებებს CDS-სა და ORF-ს შორის.
რეზიუმე – CDS vs ORF
CDS და ORF არის გენის ორი მნიშვნელოვანი ნაწილი. CDS ეხება დნმ-ის რეალურ რეგიონს, რომელიც ითარგმნება ცილად. ORF არის დნმ-ის თანმიმდევრობა, რომელიც იწყება საწყისი კოდონით "ATG" და მთავრდება სამი ტერმინალური კოდონიდან რომელიმე (TAA, TAG ან TGA). ORF შეიძლება იყოს გენის სრული mRNA-ს ნაწილი. თუმცა, გენის კოდირების თანმიმდევრობა ტრანსკრიბირებულია mRNA-ს სრულ თანმიმდევრობაზე. ყველა CDS არის ORF. მაგრამ ყველა ORF არ არის CDS. ამრიგად, ეს აჯამებს განსხვავებას CDS-სა და ORF-ს შორის.
