I ჯგუფისა და II ჯგუფის ინტრონებს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ I ჯგუფის ინტრონებში შერწყმის რეაქცია იწყება გუანოზინის კოფაქტორის მიერ, ხოლო II ჯგუფის ინტრონებში შერწყმის რეაქცია იწყება შიდა ადენოზინით.
პრე-მრნმ არის პირველადი ტრანსკრიპტი, რომელსაც აქვს როგორც ინტრონები, ასევე ეგზონები. პრე-მრნმ ტრანსლაციამდე უნდა გარდაიქმნას mRNA-დ. რნმ-ის შერწყმა ან პრე-მრნმ-ის შერწყმა არის ერთ-ერთი ასეთი პოსტტრანსკრიპციული მოდიფიკაცია. რნმ-ის შერწყმისას ინტრონები ამოღებულია პრე-მრნმ-ის მოლეკულიდან და ეგზონები გაერთიანებულია. I და II ჯგუფის ინტრონები თვითშეჯვარებადი ინტრონებია. ისინი იშლება პრე-მრნმ-ის მოლეკულიდან სხვა ფერმენტის დახმარების გარეშე.მაშასადამე, ისინი წარმოადგენენ რნმ ფერმენტებს ან რიბოზიმებს, რომლებიც ახდენენ პრე-მრნმ-ისგან საკუთარ შეერთებას. უფრო მეტიც, მათ აქვთ მობილური ელემენტების ფუნქცია. შეჯვარების დროს ხდება ტრანსესტერიფიკაციის რეაქციების სერია, რათა მოხდეს ინტრონის ამოკვეთა და ეგზონების ლიგირება. ეს რიბოზიმები გვხვდება სამივე დომენში, მათ შორის ბაქტერიებში, არქეაში და ევკარიოტებში.
რა არის I ჯგუფის ინტრონები?
I ჯგუფის ინტრონები არის რიბოზიმების ერთგვარი სახეობა, რომლებიც გვხვდება ბაქტერიებში, ბაქტერიოფაგებსა და ევკარიოტებში (ორგანულ და ბირთვულ გენომებში). ისინი გვხვდება აუცილებელ გენებში. მათ შეუძლიათ საკუთარი შერწყმის კატალიზირება პრე-მრნმ-ის მოლეკულიდან. I ჯგუფის ინტრონებს შეიძლება ჰქონდეს რამდენიმე ასეულიდან სამ ათასამდე ნუკლეოტიდი. გარდა ამისა, ისინი აჩვენებენ მცირე თანმიმდევრობით მსგავსებას ორგანიზმებს შორის.
სურათი 01: I ჯგუფის ინტრონები
მეორადი სტრუქტურები ძალზედ დაცულია ოთხ მოკლე რეგიონში. არსებობს სპლაისინგის ტრანსესტერიფიკაციის რეაქციის ორი ეტაპი. I ჯგუფის ინტრონები იწყებენ შერწყმის მექანიზმს გუანოზინის კოფაქტორის 3' ჰიდროქსილის ნუკლეოფილური შეტევით 5P შერწყმის ადგილზე.
რა არის II ჯგუფის ინტრონები?
II ჯგუფის ინტრონები არის თვითშეჯვარებადი ინტრონების ტიპი, რომელიც გვხვდება ორგანიზმებში, რომლებიც მიეკუთვნებიან სამივე დომენს. ისინი რიბოზიმებია, რომლებიც ახდენენ პრე-მრნმ-დან საკუთარი შერწყმის რეაქციების კატალიზებას. ისინი გვხვდება rRNA, tRNA და ცილის კოდირების გენებში. მაგრამ ისინი არ გვხვდება ბირთვულ გენომებში, განსხვავებით I ჯგუფის ინტრონებისაგან.
სურათი 02: II ჯგუფის ინტრონები
II ჯგუფის ინტრონები ახდენენ შეერთების კატალიზებას ორი ტრანსესტერიფიკაციის საფეხურის მეშვეობით I ჯგუფის ინტრონების მსგავსი.ეს ფერმენტები იწყებენ შერწყმის რეაქციას 2' OH-ის ტოტის ადგილის ადენოზინის ნუკლეოფილური შეტევით 5' შეჯვარების შეერთებაზე. შერწყმის რეაქციების დროს II ჯგუფის ინტრონები ქმნიან ლარიატის მსგავს სტრუქტურას. უფრო მეტიც, ინტრონის შერწყმა ხდება GTP-ის არარსებობის შემთხვევაში.
რა მსგავსებაა I და II ჯგუფის ინტრონებს შორის?
- I ჯგუფის და II ჯგუფის ინტრონები არის რნმ-ის ფერმენტების ორი ტიპი, რიბოზიმები, რომლებიც ახდენენ საკუთარი შერწყმის კატალიზებას სხვადასხვა მექანიზმით.
- ისინი დიდი რიბოციმებია.
- ორივე ნაპოვნია სამივე დომენში.
- ეს არის მობილური ელემენტები.
- უფრო მეტიც, ისინი გვხვდება rRNA, tRNA და ცილის კოდირების გენებში.
- ორივე ფერმენტი გამოიყენება როგორც ინსტრუმენტები ბიოტექნოლოგიაში და მოლეკულურ მედიცინაში მიზნობრივი გენის ნოკაუტ/დანგრევის, გენის მიწოდების ან გენოთერაპიის სისტემებისთვის.
რა განსხვავებაა I და II ჯგუფის ინტრონებს შორის?
I ჯგუფის ინტრონები არის რიბოზიმები, რომლებიც გვხვდება ბაქტერიებში, ბაქტერიოფაგებში და ევკარიოტულ ორგანულ და ბირთვულ გენომებში. II ჯგუფის ინტრონები არის რიბოზიმები, რომლებიც გვხვდება ბაქტერიებში, არქეებში და ევკარიოტულ ორგანელებში. გარდა ამისა, I ჯგუფის ინტრონები იწყებენ შერწყმის რეაქციას გუანოზინის კოფაქტორის 3' ჰიდროქსილის ნუკლეოფილური შეტევით 5P შერწყმის ადგილზე, ხოლო II ჯგუფის ინტრონები იწყებენ შერწყმის რეაქციას 2' OH ტოტის ადგილის ადენოზინის ნუკლეოფილური შეტევით. 5′ შერწყმა. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება I ჯგუფისა და II ჯგუფის ინტრონებს შორის.
უფრო მეტიც, II ჯგუფის ინტრონები ქმნიან ლარიატის მსგავს სტრუქტურას შერწყმის დროს, ხოლო I ჯგუფის ინტრონები არ ქმნიან. ამრიგად, ეს არის კიდევ ერთი მნიშვნელოვანი განსხვავება I და II ჯგუფის ინტრონებს შორის. გარდა ამისა, I ჯგუფის ინტრონები გვხვდება ევკარიოტების ბირთვულ გენომებში, ხოლო II ჯგუფის ინტრონები არ გვხვდება ევკარიოტული ბირთვული გენომებში.
ქვემოთ ინფოგრაფიკაში მოცემულია განსხვავებები I და II ჯგუფის ინტრონებს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე - ჯგუფი I vs ჯგუფი II ინტრონები
I და II ჯგუფის ინტრონები არის დიდი რიბოზიმები, რომლებიც კატალიზებენ ტრანსესტერიფიკაციის რეაქციას პირველადი ტრანსკრიპტიდან ინტრონების გამოყოფის მიზნით. ისინი გვხვდება სამივე დომენში. ორივე მობილური გენეტიკური ელემენტია. უფრო მეტიც, ისინი გამოიყენება როგორც ინსტრუმენტები ბიოტექნოლოგიასა და მოლეკულურ მედიცინაში. თუმცა, I ჯგუფის ინტრონები იწყებენ შერწყმის რეაქციას გუანოზინის კოფაქტორის 3' OH-ის ნუკლეოფილური შეტევით 5P შერწყმის ადგილზე. მაგრამ, II ჯგუფის ინტრონები იწყებენ შერწყმის რეაქციას 2' OH-ის ტოტის ადგილის ადენოზინის ნუკლეოფილური შეტევით 5' შეერთების შეერთებაზე. უფრო მეტიც, II ჯგუფის ინტრონები ქმნიან ლარიატის მსგავს სტრუქტურას შერწყმის დროს, ხოლო I ჯგუფის ინტრონები არ ქმნიან ლარიატის მსგავს სტრუქტურას.ამრიგად, ეს არის I ჯგუფისა და II ჯგუფის ინტრონების განსხვავების შეჯამება.
