ძირითადი განსხვავება EcoRI და HindIII შემაკავებელ ფერმენტებს შორის არის ის, რომ EcoRI არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E. coli-სგან, ხოლო HindIII არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია Haemophilus influenza-სგან.
შემზღუდავი ფერმენტი ან რესტრიქციული ენდონუკლეაზა არის ფერმენტი, რომელიც ანაწილებს დნმ-ს ფრაგმენტებად დნმ-ის მოლეკულაში ამოცნობის სპეციფიკურ ადგილებში (შეზღუდვის ადგილები). ეს შეზღუდვის ფერმენტები გვხვდება ბაქტერიებსა და არქეებში. ისინი უზრუნველყოფენ დამცავ მექანიზმს შემოჭრილი ვირუსებისგან. შემაკავებელი ფერმენტები ზოგადად კლასიფიცირდება ხუთ სხვადასხვა ტიპად: ტიპი I, ტიპი II, ტიპი III, IV და ტიპი V. EcoRI და HindIII არის ორი შემაკავებელი ფერმენტი, რომლებიც მიეკუთვნება II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტების ჯგუფს.
რა არის EcoRI შემაკავებელი ფერმენტები?
EcoRI არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E.coli სახეობიდან. ეს არის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც არღვევს დნმ-ის ორმაგ სპირალებს ფრაგმენტებად კონკრეტულ ადგილებში. EcoRI ასევე შეზღუდვა-მოდიფიკაციის სისტემის ნაწილია. EcoRI იყო პირველი ფერმენტი, რომელიც თავდაპირველად იზოლირებული იყო E. coli სახეობის RY13 შტამიდან. იგი გამოიყენება როგორც შემაკავებელი ფერმენტი მოლეკულურ ბიოლოგიაში. EcoRI ქმნის 4 ნუკლეოტიდის წებოვან ბოლოს AATT-ის 5' ბოლო გადახურვით. EcoRI წყვეტს დნმ-ს G↓AATTC-ის ამოცნობის სპეციფიკურ თანმიმდევრობით. მას აქვს CTTAA↓G-ის პალინდრომული დამატებითი თანმიმდევრობა. უფრო მეტიც, ეს შეზღუდვის ფერმენტი მიეკუთვნება II P ტიპის (პალინდრომიული სპეციფიკის) ქვეკლასს. თავისი პირველადი სტრუქტურით, EcoRI შეიცავს PD. D/EXK მოტივს თავის აქტიურ ობიექტში, ისევე როგორც ბევრი სხვა შემზღუდველი ფერმენტი.
სურათი 01: EcoRI
EcoRI შემაკავებელი ფერმენტი არის 31 kDa-ის ჰომოდიმერი. ის შეიცავს α/β არქიტექტურის ერთ გლობულურ დომენს. თითოეული ქვედანაყოფი შეიცავს მარყუჟს, რომელიც გამოდის გლობულური დომენიდან და ახვევს დნმ-ს, როდესაც შეკრულია. ეს ფერმენტი შეიძლება იყოს კოკრისტალიზებული თანმიმდევრობით, რომელსაც ჩვეულებრივ წყვეტს. გარდა ამისა, EcoRI შეზღუდვის ფერმენტი გამოიყენება მოლეკულური გენეტიკური ტექნიკის მრავალფეროვნებაში, მათ შორის კლონირებაში, დნმ-ის სკრინინგსა და დნმ-ის ინ-ვიტრო პირობების წაშლის სექციებში.
რა არის HindIII შეზღუდვის ფერმენტები?
HindIII არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია Haemophilus influenza-სგან. ის წყვეტს დნმ-ის პალინდრომულ თანმიმდევრობას AACCTT კოფაქტორის Mg2+ ჰიდროლიზის მეშვეობით.ამ კონკრეტული თანმიმდევრობის გაყოფა AA'S-ს (5'A↓ACCTT3' და 3'TTCGA↓A5') შორის იწვევს დნმ-ის მოლეკულაზე 5' გადახურვას, რომელსაც წებოვანი ბოლოები ეწოდება. ეს ფერმენტი გვხვდება პროკარიოტულ ორგანიზმებში, როგორიცაა ბაქტერიები. ბაქტერიები იყენებენ ამ ფერმენტს, როგორც თავდაცვის მექანიზმს ვირუსებისგან, როგორიცაა ბაქტერიოფაგები.
სურათი 02: HindIII
სტრუქტურულად, HindIII არის ჰომოდიმერი. იგი შეიცავს საერთო სტრუქტურულ ბირთვს, რომელიც მოიცავს ოთხ β ფურცელს და ერთ α სპირალს, ისევე როგორც სხვა ტიპის II შეზღუდვის ფერმენტები. ამ ფერმენტის მოლეკულური მასა არის 34,9 kDa. გარდა ამისა, HindIII ძალიან სასარგებლოა თანამედროვე მოლეკულურ ბიოლოგიურ სამეცნიერო ექსპერიმენტებში, როგორიცაა დნმ-ის თანმიმდევრობა და რუქა.
რა მსგავსებაა EcoRI და HindIII შეზღუდვის ფერმენტებს შორის?
- EcoRI და HindIII არის ორი შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც მიეკუთვნება II ტიპის შეზღუდვის ფერმენტის ჯგუფს.
- EcoRI და HindIII აღმოაჩინეს 1970-იანი წლების დასაწყისში.
- EcoRI და HindIII ორივე შეიცავს PD.. D/EXK ამინომჟავების თანმიმდევრობის მოტივს.
- ორივე შემზღუდველი ფერმენტი ასრულებს დნმ-ის ძალიან სპეციფიკურ დაშლას.
- ამ შემაკავებელ ფერმენტებს სჭირდებათ Mg2+, როგორც კოფაქტორი მათი სპეციფიკური აქტივობისთვის.
- ისინი წარმოქმნიან წებოვან ბოლოებს დნმ-ის მოჭრის შემდეგ.
- ისინი ძალიან სასარგებლო კომპონენტებია თანამედროვე მოლეკულურ ბიოლოგიურ კვლევაში.
რა განსხვავებაა EcoRI და HindIII შეზღუდვის ფერმენტებს შორის?
EcoRI არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E.coli-ს სახეობებისგან, ხოლო HindIII არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია Haemophilus influenza-ს სახეობებისგან. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება EcoRI-სა და HindIII-ს შორის.გარდა ამისა, EcoRI წყვეტს დნმ-ს სპეციფიკური ამოცნობის G↓AATTC თანმიმდევრობით, ხოლო HindIII წყვეტს დნმ-ს A↓ACCTT ამოცნობის სპეციფიკურ თანმიმდევრობით..
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს EcoRI-სა და HindIII-ს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე - EcoRI vs HindIII შეზღუდვის ფერმენტები
EcoRI და HindIII არის ორი შემაკავებელი ფერმენტი, რომლებიც მიეკუთვნება II ტიპის p ქვეკლასს. ისინი ასრულებენ დნმ-ის ძალიან სპეციფიკურ დაშლას. EcoRI არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია E.coli-ს სახეობებისგან, ხოლო HindIII არის II ტიპის შემაკავებელი ფერმენტი, რომელიც იზოლირებულია Haemophilus influenza-სგან. ასე რომ, ეს აჯამებს განსხვავებას EcoRI-სა და HindIII-ს შორის.
