ქსილენ ციანოლსა და ბრომფენოლ ლურჯს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ 1% აგაროზის გელში ქსილენ ციანოლი უფრო ნელა მიგრირებს, ხოლო ბრომფენოლ ლურჯი უფრო სწრაფად.
ქსილენ ციანოლი და ბრომფენოლ ლურჯი მნიშვნელოვანია, როგორც ფერის მარკერები, რომლებიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას აგაროზის გელის ელექტროფორეზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის პროცესის მონიტორინგისთვის.
რა არის ქსილენ ციანოლი?
ქსილენ ციანოლი არის ელექტროფორეზული ფერის მარკერი ან თვალთვალის საღებავი. ის სასარგებლოა აგაროზის გელის ელექტროფორეზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის პროცესის მონიტორინგისთვის. როდესაც ეს ნივთიერება შერეულია ნიმუშთან, ამ ნივთიერების კონცენტრაცია ჩვეულებრივ ხდება დაახლოებით 0.005%-დან 0.03%-მდე. ზოგიერთი სინონიმი, რომელიც შეგვიძლია გამოვიყენოთ ქსილენ ციანოლისთვის, მოიცავს Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF და ა.შ.
ამ ნაერთის ქიმიური ფორმულაა C25H27N2NaO 6S2 ქსილენ ციანოლის მოლური მასა არის 538,61 გ/მოლი. ამ ნივთიერებას შეუძლია მიგრირება დაახლოებით 4-5 კილობაზის წყვილი დნმ-ის ფრაგმენტებით 1% აგაროზის გელებში. თუმცა, ეს დამოკიდებულია ბუფერზე, რომელსაც ჩვენ ვიყენებთ. როგორც წესი, ქსილენ ციანოლს 6% პოლიაკრილამიდის გელზე შეუძლია მიგრირება დაახლოებით 140 ბაზის წყვილი დნმ-ის ფრაგმენტების სიჩქარით. მეორეს მხრივ, მას შეუძლია მიგრაცია 20% დენატურირებადი პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის დროს 25 ბაზის ოლიგონუკლეოტიდის სიჩქარით.
ქსილენ ციანოლის წყალბადური ბმის დონორის რაოდენობა არის 2 მ, ხოლო წყალბადური ბმის მიმღების რაოდენობა არის 8. ამ ნაერთის მბრუნავი ბმის რაოდენობა შეიძლება იყოს 7. ქსილენ ციანოლის სირთულე შეიძლება აღწერილი იყოს როგორც 1120 გრადუსი. მას აქვს განსაზღვრული ბონდის სტერეოცენტრის რაოდენობა 1.
რა არის ბრომფენოლი ლურჯი?
Bromofenol Blue არის სასარგებლო pH მაჩვენებელი, რომელიც სასარგებლოა როგორც ელექტროფორეზული ფერის მარკერი და საღებავი. მას აქვს ქიმიური სახელი 3', 3", 5', 5"-ტეტრაბრომფენოლსულფონფთალეინი, BPB. ამ ნაერთის ქიმიური ფორმულაა C19H10Br4O5 S. ამ ნაერთის მოლური მასა არის 669,96 გ/მოლი. ის უსუნოა და მისი სიმკვრივე შეიძლება იყოს 2.2 გ/მლ. მისი დნობის წერტილი არის 273 გრადუსი ცელსიუსი, ხოლო დუღილის წერტილი 279 გრადუსი ცელსიუსი. ჩვენ შეგვიძლია მოვამზადოთ ჭარბი ბრომი ნელ-ნელა დავამატებთ ფენოლსულფონფთალეინის ცხელ ხსნარს მყინვარძმარმჟავაში.
ბრომფენოლის ლურჯი სასარგებლოა როგორც მჟავა-ტუტოვანი ინდიკატორი pH 3.0-დან 4.6-მდე დიაპაზონში. მას შეუძლია შეიცვალოს ყვითელიდან pH 3.0 pH 4.6-მდე. უფრო მეტიც, ეს არის შექცევადი რეაქცია. სტრუქტურულად, ბრომფენოლ ლურჯი ფენოლფთალეინის მსგავსია.
გარდა ამისა, ჩვენ შეგვიძლია გამოვიყენოთ როგორც ფერადი მარკერი აგაროზის გელის ელექტროფორეზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის პროცესის მონიტორინგისთვის. ამ ნივთიერებას შეუძლია უარყოფითი მუხტის გადატანა ზომიერ pH-ზე, სადაც მას შეუძლია მიგრირება იმავე მიმართულებით, როგორც დნმ ან ცილა გელში. მიგრაციის სიჩქარე შეიძლება განსხვავდებოდეს გელის სიმკვრივისა და ბუფერული შემადგენლობის მიხედვით. თუმცა, ტიპიური 1% აგაროზის გელში 1 დრო TAE ბუფერში ან TBE ბუფერში, ეს ნივთიერება მიგრირებს იმავე სიჩქარით, როგორც დნმ-ის ფრაგმენტი დაახლოებით 300 ბაზის წყვილი.
რა განსხვავებაა ქსილენ ციანოლსა და ბრომფენოლ ლურჯს შორის?
ქსილენ ციანოლი და ბრომფენოლ ლურჯი მნიშვნელოვანი ფერის მარკერებია. ქსილენ ციანოლსა და ბრომფენოლ ლურჯს შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ 1% აგაროზის გელში ქსილენ ციანოლი უფრო ნელა მიგრირებს, ხოლო ბრომფენოლ ლურჯი უფრო სწრაფად.
ქვემოთ მოცემულია განსხვავების შეჯამება ქსილენ ციანოლსა და ბრომფენოლ ლურჯს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – ქსილენ ციანოლი vs ბრომფენოლი ლურჯი
ქსილენ ციანოლი და ბრომფენოლ ლურჯი მნიშვნელოვანია, როგორც ფერის მარკერები, რომლებიც გამოიყენება აგაროზის გელის ელექტროფორეზისა და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზის პროცესის მონიტორინგისთვის. ქსილენ ციანოლსა და ბრომფენოლ ლურჯს შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ 1% აგაროზის გელში ქსილენ ციანოლი უფრო ნელა მიგრირებს, ხოლო ბრომფენოლი ლურჯი უფრო სწრაფად.
