კონსენსუსის PCR-სა და პან PCR-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ კონსენსუს PCR ყოველთვის მიზნად ისახავს კონსერვაციულ რეგიონებს, ხოლო Pan PCR მიმართულია ცვლადი რეგიონების მიმართ ჯგუფის სხვადასხვა შტამების იდენტიფიცირებისთვის
პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქცია (PCR) არის გენის გაძლიერების ტექნიკა, რომელიც შედგება სამი ძირითადი ეტაპისგან, როგორიცაა დენატურაცია, ანილირება და გაფართოება. ეს ფართოდ გამოიყენება დიაგნოსტიკაში და მოლეკულურ იდენტიფიკაციაში. Consensus PCR და Pan PCR ტექნიკა ეფუძნება პრაიმერის სამიზნეებს, რომლებსაც იყენებს თითოეული PCR ტიპი.
რა არის Consensus PCR?
Consensus PCR არის PCR ტექნიკა, რომელიც მიზნად ისახავს კონსერვაციულ რეგიონს კონკრეტული სახეობის ან გვარისთვის.ამიტომ, გაძლიერებისთვის არჩეულია მაღალკონსერვირებული რეგიონები. ამ მეთოდის საშუალებით შესაძლებელია ორგანიზმების იდენტიფიცირება და მათი კონსენსუსის საფუძველზე გამოყოფა. ეს მეთოდი განსაზღვრავს კონსერვაციულ რეგიონს კონკრეტული სახეობისთვის. მაგალითად, ბაქტერიების 16s rRNA რეგიონი რჩება შენახულ რეგიონად ბაქტერიებს შორის. ამიტომ, გაძლიერებისთვის საჭიროა მხოლოდ ერთი პრაიმერის ნაკრები. უმეტეს შემთხვევაში, უნივერსალური პრაიმერი შეიძლება გამოყენებულ იქნას შენახული რეგიონისთვის.
სურათი 01: PCR ტექნიკა
კონსენსუსის PCR მეთოდის დაცვით, სახეობების დახასიათება და ევოლუციური ურთიერთობები შეიძლება გამოიტანოს. კონკრეტული ნიმუშის ორგანიზმის ამპლიფიკაციის ეფექტურობიდან გამომდინარე, ორგანიზმის კონსენსუსი ჯგუფის მიმართაც შეიძლება გამოიტანოს. გარდა ამისა, კონსენსუსის PCR-ის ჩატარება სასიცოცხლოდ მნიშვნელოვანია ფილოგენეტიკურ კვლევებში.ის საშუალებას აძლევს სახეობის იდენტიფიკაციას და განმარტავს კონკრეტული ორგანიზმის გადახრას საერთო წინაპრის მიხედვით.
რა არის Pan PCR?
Pan PCR არის PCR-ის მულტიპლექსირების რეჟიმი. ამ ტექნიკაში, სხვადასხვა შტამები გაძლიერებულია სხვადასხვა პრაიმერის სამიზნეების გამოყენებით. თუმცა, სამიზნეები შეიძლება იყოს საერთო სამიზნეები შტამების ჯგუფებისთვის. ამგვარად, Pan PCR-ში შესაძლებელია ერთდროულად ორზე მეტი პრაიმერის კომპლექტის გამოყენება. ეს შეიძლება მოხდეს ერთი მილის რეაქციის მეთოდით ან მრავალ მილის რეაქციის მეთოდით. Pan PCR უფრო შრომატევადი და რთულია კონსენსუსის PCR-თან შედარებით. ამ მიზეზის გამო, PCR შედეგების ინტერპრეტაცია შესაძლოა უფრო რთული იყოს Pan PCR-ში.
პან PCR-ის ძირითადი გამოყენება მოლეკულურ დიაგნოსტიკაშია. ეს საშუალებას იძლევა განასხვავოს სახეობის სხვადასხვა შტამები სამიზნე გაძლიერებით. Pan PCR იდეალური ტექნიკაა დაავადების გამომწვევი ერთი სახეობის სხვადასხვა შტამების იდენტიფიცირებისთვის. უმეტეს შემთხვევაში, Pan PCR ტექნიკის ავტომატიზაცია ჯანმრთელობის სხვადასხვა მდგომარეობისთვის ძალიან მნიშვნელოვანია და არის საიმედო და მაღალეფექტური ტექნიკა.
რა მსგავსებაა Consensus PCR-სა და Pan PCR-ს შორის?
- Consensus PCR და Pan PCR არის PCR ტექნიკის ორი ტიპი.
- ორივე პროცედურა მიჰყვება ზოგად სამეტაპიან პროცედურას - დენატურაცია, ანილირება და გაფართოება.
- ისინი იყენებენ სამიზნე სპეციფიკურ პრაიმერებს.
- ორივე რეაქცია მიმდინარეობს თერმოციკლერში.
- ეს რეაქციები შეიძლება ავტომატიზირებული იყოს.
- ორივე შეიძლება გამოყენებულ იქნას მოლეკულურ დიაგნოსტიკაში და იდენტიფიკაციაში; თუმცა, სიზუსტე განსხვავდება.
- ეს პროცედურები საჭიროებს ვალიდაციას.
რა განსხვავებაა Consensus PCR-სა და Pan PCR-ს შორის?
ორივე Consensus და Pan PCR მიჰყვება ერთსა და იმავე რუტინულ პროცედურას. ამასთან, ძირითადი განსხვავება კონსენსუს PCR-სა და Pan PCR-ს შორის ემყარება პრაიმერის სამიზნეებს, რომლებსაც თითოეული პროცედურა იყენებს. მიუხედავად იმისა, რომ კონსენსუსის PCR ყოველთვის მიზნად ისახავს შენახულ რეგიონებს, Pan PCR მიზნად ისახავს ცვლადი რეგიონებს ჯგუფის სხვადასხვა შტამების იდენტიფიცირებისთვის.ამ განსხვავების გამო, პრაიმერის დიზაინის პროტოკოლები, გამოყენებული პრაიმერის ნაკრების რაოდენობა და სპეციფიკური აპლიკაციები განსხვავდება.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა აჯამებს განსხვავებას Consensus PCR-სა და Pan PCR-ს შორის.
რეზიუმე - კონსენსუსის PCR vs Pan PCR
Mulli-ს მიერ შემოღებული PCR მნიშვნელოვან რევოლუციურ როლს ასრულებს მოლეკულური ბიოლოგიის აპლიკაციებში. Consensus და Pan PCR არის PCR-ის ორი ტიპი, მათი პრაიმერის სამიზნე რეგიონების მიხედვით. მიუხედავად იმისა, რომ კონსენსუსის PCR მიზნად ისახავს შენახულ რეგიონებს, Pan PCR მიზნად ისახავს ცვლადი რეგიონებს და მნიშვნელოვან როლს ასრულებს შტამის იდენტიფიკაციაში. კონსენსუს PCR-სა და Pan PCR-ს შორის ამ ძირითადი განსხვავების გამო, PCR-ის თითოეული ტიპის სპეციფიკური ფუნქციები ასევე განსხვავდება ფილოგენეტიკური ანალიზიდან მოლეკულურ დახასიათებამდე მოლეკულურ დიაგნოსტიკამდე.
