მთავარი განსხვავება dNTP და ddNTP-ს შორის არის ის, რომ dNTP ან დეზოქსირიბონუკლეოტიდები არის დნმ-ის სამშენებლო ბლოკები და აქვთ 3ʹ-OH ჯგუფი პენტოზის შაქრის სტრუქტურაზე, ხოლო ddNTP ან დიდოქსინუკლეოზიდის ტრიფოსფატები არის ნუკლეოტიდები, რომლებსაც არ აქვთ 3ʹ-OH ჯგუფი და გამოიყენება Sanger-ის დიდოქსი დნმ-ის თანმიმდევრობის ტექნიკაში სხვადასხვა სიგრძის დნმ-ის თანმიმდევრობის შესაქმნელად.
dNTP და ddNTP არის ნუკლეოტიდები. dNTP ეხება დეზოქსირიბოზის ნუკლეოტიდებს. ისინი დნმ-ის სამშენებლო ბლოკებია. dNTP გამოიყენება დნმ-ის სინთეზისთვის. dNTP, თავის მხრივ, ეხება დიდოქსინუკლეოზიდის ტრიფოსფატებს. ისინი გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობაში, რათა შეწყვიტოს დნმ-ის სინთეზი სხვადასხვა სიგრძეზე.მათ არ აქვთ OH ჯგუფი 3' პოზიციაზე. წყალბადი იმყოფება 3ʹ პოზიციაზე OH ჯგუფის ნაცვლად. მაშასადამე, ddNTP-ებს არ შეუძლიათ ფოსფოდიესტერული კავშირის შექმნა მომდევნო ნუკლეოტიდთან. dNTP-ს შეუძლია განახორციელოს დნმ-ის სინთეზი, ხოლო ddNTP-ს შეუძლია შეწყვიტოს დნმ-ის პოლიმერიზაცია.
რა არის dNTP?
dNTP ნიშნავს დეზოქსირიბოზის ნუკლეოტიდს ან დეზოქსირიბონუკლეოტიდს. ეს არის დნმ-ის სამშენებლო მასალა. არსებობს ოთხი ტიპის dNTP. ეს არის dATP, dTTP, dCTP და dGTP. ისინი დასახელებულია პურინის ან პირიმიდინის აზოტოვანი ფუძეების მიხედვით: ადენინი (A), გუანინი (G), თიმინი (T) და ციტოზინი (C).
სურათი 01: dNTP
ადენინი და გუანინი არის პურინის ფუძეები, ხოლო თიმინი და ციტოზინი არის პირიმიდინის ფუძეები. dNTP-ის პენტოზა შაქარი არის დეზოქსირიბოზა.ასევე არსებობს ფოსფატის ჯგუფი. ამრიგად, dNTP შედგება სამი კომპონენტისგან: აზოტოვანი ფუძე, დეზოქსირიბოზა შაქარი და ფოსფატის ჯგუფი. ეს dNTP-ები ერწყმის ერთმანეთს ფოსფოდიესტერული ბმების მეშვეობით. dNTP-ებში არის OH ჯგუფი მიმაგრებული პენტოზა შაქრის მე-3' პოზიციაზე, რომელიც საჭიროა შემდეგი ნუკლეოტიდის შაქრის 5ʹ ნახშირბადთან მიმაგრებულ ფოსფატ ჯგუფთან კავშირის შესაქმნელად. ვინაიდან ყველა dNTP-ს აქვს ეს 3ʹ-OH ჯგუფი, მათ შეუძლიათ დნმ-ის ჯაჭვების სინთეზირება და გაფართოება. აქედან გამომდინარე, dNTP მოქმედებს როგორც დნმ-ის და გენების ქიმიური ნივთიერების ძირითადი განმეორებითი ერთეული. დნმ-ის სინთეზი ყოველთვის მიმდინარეობს 5ʹ-დან 3ʹ-მდე.
რა არის DdNTP?
სანჯერის თანმიმდევრობა არის პირველი თაობის დნმ-ის თანმიმდევრობის მეთოდი, რომელიც შემუშავებულია ფრედერიკ სენგერმა და მისმა კოლეჯებმა 1977 წელს. იგი ასევე ცნობილია როგორც ჯაჭვის შეწყვეტის თანმიმდევრობა ან დიდეოქსის თანმიმდევრობა, რადგან ამ მეთოდის ძირითადი პრინციპია ჯაჭვის შეწყვეტა დიდოქსინუკლეოზიდის ტრიფოსფატების გამოყენებით. (ddNTPs). ddNTPs არის ნუკლეოტიდები, რომლებიც გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობაში.სანჯერის თანმიმდევრობა ეფუძნება ddNTP-ების შერჩევით ჩართვას და დნმ-ის სინთეზის შეწყვეტას ინ ვიტრო დნმ-ის რეპლიკაციის დროს. ddNTP-ების სპეციალობა არის ის, რომ მათ აკლიათ 3ʹ-OH ჯგუფი პენტოზას შაქარზე, რათა გააგრძელონ ფოსფოდიესტერული ბმის ფორმირება 5ʹ ფოსფატულ ჯგუფს შორის მიმდებარე ნუკლეოტიდში. მაშასადამე, როგორც კი ddNTP მიმაგრებულია გაფართოებულ ძაფზე, ჯაჭვის გახანგრძლივება წყდება და მთავრდება ამ წერტილიდან. ddNTP-ები მოქმედებენ როგორც დნმ პოლიმერაზას ჯაჭვის გამაგრძელებელი ინჰიბიტორები სანგერის თანმიმდევრობის მეთოდის დროს.
სურათი 02: ddNTP
არსებობს ოთხი ddNTP: ddATP, ddCTP, ddGTP და ddTTP, რომლებიც გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობით. ეს ნუკლეოტიდები აჩერებენ დნმ-ის რეპლიკაციის პროცესს, როდესაც ისინი შედიან დნმ-ის მზარდ ჯაჭვში. შედეგად, სანგერის თანმიმდევრობა წარმოქმნის სხვადასხვა სიგრძის მოკლე დნმ-ს.კაპილარული გელის ელექტროფორეზი გამოიყენება ამ მოკლე დნმ-ის ჯაჭვების ორგანიზებისთვის მათი ზომების მიხედვით გელზე. ddNTP-ები რადიოაქტიურად ან ფლუორესცენტურად არის მონიშნული სხვადასხვა ფერებით, დნმ-ის თანმიმდევრობის გასაანალიზებლად. გელის ანალიზით შეიძლება განისაზღვროს უცნობი დნმ-ის ჯაჭვის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა.
რა მსგავსებაა dNTP-სა და DdNTP-ს შორის?
- როგორც dNTP, ასევე ddNTP გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობაში.
- არსებობს ოთხი ტიპის dNTP და ddNTP.
- ისინი შედგება სამი კომპონენტისგან: აზოტოვანი ფუძე, დეზოქსირიბოზა შაქარი და ფოსფატური ჯგუფები.
რა განსხვავებაა dNTP-სა და DdNTP-ს შორის?
dNTP არის დეზოქსირიბონუკლეოტიდების ოთხი ტიპიდან ერთ-ერთი, რომელიც წარმოადგენს დნმ-ის სამშენებლო ბლოკებს. ddNTP არის ერთ-ერთი ოთხი ტიპის დიდოქსირიბონუკლეოზიდის ტრიფოსფატებიდან, რომლებიც გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობის ტექნიკაში. dNTP-ს აქვს 3ʹ-OH ჯგუფი პენტოზა შაქარზე, ხოლო ddNTP-ს აკლია 3ʹ-OH ჯგუფი პენტოზა შაქარზე.ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება dNTP-სა და ddNTP-ს შორის. უფრო მეტიც, dNTP ახორციელებს დნმ-ის პოლიმერიზაციას, ხოლო ddNTP წყვეტს დნმ-ის პოლიმერიზაციას. აქედან გამომდინარე, ეს არის კიდევ ერთი მთავარი განსხვავება dNTP-სა და ddNTP-ს შორის.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა ჩამოთვლის განსხვავებებს dNTP-სა და ddNTP-ს შორის ცხრილის სახით.
რეზიუმე – dNTP vs DdNTP
ნორმალური dNTP არის დნმ-ის სამშენებლო ბლოკები, ხოლო ddNTP არის ნუკლეოტიდები, რომლებიც გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობის ტექნიკაში. dNTP-ს აქვს 3ʹ-OH, ხოლო ddNTP-ს აკლია 3ʹ-OH. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება dNTP-სა და ddNTP-ს შორის. უფრო მეტიც, dNTP-ს შეუძლია დნმ-ის ჯაჭვის სინთეზირება, ხოლო ddNTP-ს შეუძლია შეწყვიტოს დნმ-ის პოლიმერიზაცია. ამიტომ, ddNTP-ები გამოიყენება Sanger-ის თანმიმდევრობაში, რათა წარმოიქმნას სხვადასხვა სიგრძის დნმ-ის ჯაჭვები. Sanger-ის თანმიმდევრობის დროს, ორივე dNTP და ddNTP შედის.
