კომპოზიტურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ კომპოზიციური ტრანსპოზონები არის ტრანსპოზონების ტიპი, რომელიც ატარებს დამხმარე გენებს, როგორიცაა ანტიბიოტიკების წინააღმდეგობის გენები, ხოლო IS ელემენტები (ან ჩასმის თანმიმდევრობის ელემენტები) ტრანსპოზირებადი ელემენტებია, რომლებიც ატარებენ მხოლოდ გენებს კოდის ტრანსპოზაზა, რომელიც ახდენს ტრანსპოზიციის აქტივობის კატალიზებას.
ტრანსპოზიონი არის დნმ-ის ფრაგმენტი, რომელსაც შეუძლია შეცვალოს მისი პოზიცია ბაქტერიის გენომში. აქედან გამომდინარე, ისინი მობილური დნმ-ის თანმიმდევრობაა. ისინი გადადიან გენომის ახალ ადგილებში, ცვლის ბაქტერიების გენომის თანმიმდევრობას, რაც იწვევს გენეტიკურ ინფორმაციას მნიშვნელოვან ცვლილებებს.ტრანსპოზონები ასევე ცნობილია, როგორც ხტუნვის გენები, რადგან მათ შეუძლიათ დაბლოკონ გენების ტრანსკრიფცია და გადააკეთონ ბაქტერიის გენეტიკური მასალა. უფრო მეტიც, ისინი პასუხისმგებელნი არიან წამლის რეზისტენტობის მოძრაობაზე, ანტიბიოტიკორეზისტენტობის გენების პლაზმიდებსა და ქრომოსომებს შორის. კომპოზიტური ტრანსპოზონები და IS ელემენტები არის ორი ტიპის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც გვხვდება ბაქტერიებში. ორივეს შეუძლია გენომის ერთი ადგილიდან მეორეზე გადასვლა.
რა არის კომპოზიტური ტრანსპოზონები?
კომპოზიტური ტრანსპოზიონი არის დნმ-ის სეგმენტი, რომელიც გარშემორტყმულია მსგავსი ჩასმის მიმდევრობის ელემენტების ორი ასლით. კომპოზიციურ ტრანსპოზონში არის ცილის კოდირების ცენტრალური რეგიონი. გენები ხშირად ანტიბიოტიკებისადმი რეზისტენტული გენებია. ისინი ასევე შეიძლება შეიცავდეს კატაბოლურ გენებს. უფრო მეტიც, კომპოზიციური ტრანსპოზიონი შედგება ორი ინვერსიული გამეორებისგან. კომპოზიტური ტრანსპოზონის მთელი სიგრძე მოძრაობს როგორც ერთი სრული ერთეული.
სურათი 01: კომპოზიტური ტრანსპოზონი
Tn10 არის კომპოზიტური ტრანსპოზონი. იგი შედგება 6,5 კბ ცენტრალური კოდირების რეგიონისგან (ტეტრაციკლინისადმი რეზისტენტული გენი) და 1,4 კბ ინვერსიული ჩასმის თანმიმდევრობის ელემენტებისაგან თითოეულ ბოლოში. IS ელემენტების მიწოდება ტრანსპოზაზას. ტრანსპოზაზა არის ფერმენტი, რომელიც ახდენს ტრანსპოზონის მოძრაობას. კომპოზიტური ტრანსპოზონები შეიძლება გაძლიერდეს, IS ელემენტების პრაიმერების დიზაინით.
რა არის ელემენტები?
ჩასმის თანმიმდევრობის ელემენტები ან IS ელემენტები არის მობილური გენეტიკური ელემენტის ტიპი. ისინი ტრანსპოზონების მარტივი ფორმაა. ისინი ატარებენ მხოლოდ ტრანსპოზაზას ფერმენტების კოდირებულ გენებს. ტრანსპოზაზას ფერმენტები ახდენენ ტრანსპოზონების ტრანსპოზიციის კატალიზებას. სტრუქტურულად, IS ელემენტების კოდირების თანმიმდევრობა შემოიფარგლება ორი ინვერსიული გამეორებით. მაგალითად, IS ელემენტს, სახელად IS911, გვერდითაა ორი 36bp ინვერსიული განმეორებითი კიდურით.
IS ელემენტები არის ყველაზე უხვი ავტონომიური ტრანსპოზირებადი ელემენტები ბაქტერიების გენომში. აქედან გამომდინარე, ისინი ძალზე მნიშვნელოვანია პროკარიოტული გენომის ორგანიზაციისა და ევოლუციისთვის. გარდა ამისა, IS ელემენტები წარმოიქმნება როგორც კომპოზიტური ტრანსპოზონების ნაწილები. ზოგადად, ორი IS ელემენტია ნაპოვნი კომპოზიციური ტრანსპოზიონის კოდირების თანმიმდევრობის გვერდით. მაგრამ ერთეული ტრანსპოზონები არ ატარებენ ფლანგური IS ელემენტებს.
რადგან IS ელემენტებს შეუძლიათ გადაადგილება გენომში, მათ შეუძლიათ შეწყვიტონ სხვა გენების კოდირების თანმიმდევრობა და გაააქტიურონ გენები ექსპრესიის დაბლოკვით.
რა მსგავსებაა კომპოზიტურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის?
- როგორც კომპოზიციურ ტრანსპოზონებს, ასევე IS ელემენტებს შეუძლიათ შეცვალონ პოზიცია ბაქტერიის გენომში.
- კოდირების რეგიონი ორივე ტრანსპოზიონში ჩვეულებრივ შემოიფარგლება შებრუნებული გამეორებებით.
- კომპოზიტური ტრანსპოზონი შემოიფარგლება ორი ცალკე IS ელემენტით.
რა განსხვავებაა კომპოზიტურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის?
კომპოზიტური ტრანსპოზონები არის მობილური გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც შედგება ორი ჩასმული თანმიმდევრობისგან (ISs), რომლებიც ხშირად გვერდითაა ერთი ან მეტი ანტიბიოტიკებისადმი რეზისტენტობის გენი. მეორეს მხრივ, IS ელემენტები არის მარტივი ტრანსპოზირებადი ელემენტის ტიპი, რომელიც შეიცავს ტრანსპოზაზის ფერმენტის კოდირებულ გენებს ტრანსპოზიციის კატალიზებისთვის. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება კომპოზიციურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის.
ქვემოთ მოცემულია განსხვავებების სია კომპოზიციურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – კომპოზიტური ტრანსპოზონები IS ელემენტების წინააღმდეგ
ბაქტერიულ გენომს აქვს გენეტიკური ელემენტები, რომლებიც მობილურია.კომპოზიტური ტრანსპოზონები და IS ელემენტები მობილური გენეტიკური ელემენტების ორი ტიპია. კომპოზიტური ტრანსპოზონები ატარებენ ანტიბიოტიკებისადმი მდგრად გენებს და გვერდით IS ელემენტებს. IS ელემენტები ატარებენ გენეტიკურ კოდს ტრანსპოზაზას წარმოქმნით, რომელიც კატალიზებს ტრანსპოზონების მოძრაობას. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება კომპოზიციურ ტრანსპოზონებსა და IS ელემენტებს შორის.