ცის და ტრანს შეერთებას შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ ცის შერწყმა არის ინტრამოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტშია, ხოლო ტრანს-სპლისინგი არის ინტერმოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს ან აუტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც არ არიან იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტის ფარგლებში.
რნმ-ის შერწყმა არის რნმ-ის დამუშავების ფორმა ცილის სინთეზამდე. ამ პროცესში, ახლად შექმნილი წინასწარ მესინჯერი რნმ-ის ტრანსკრიპტი გარდაიქმნება სექსუალურ მესინჯერ რნმ-ად. მომწიფებული მესინჯერი რნმ ხელს უწყობს ცილის მოლეკულის გამომუშავებას. რნმ-ის შერწყმის დროს ინტრონები (არაკოდიციური უბნები) ამოღებულია და ეგზონები (კოდირების რაიონები) გაერთიანებულია, რათა მოხდეს მომწიფებული mRNA. Cis და trans splicing არის რნმ-ის შერწყმის მექანიზმების ორი ტიპი.
რა არის Cis Splicing?
Cis splicing არის ინტრამოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტის ფარგლებშია. ნორმალური cis splicing ამუშავებს რნმ-ის ერთ მოლეკულას. Cis splicing არის პრემრნმ-ის ტიპიური შერწყმის პროცესი, რომელსაც ახორციელებს სპლისეოსომები. ინტრონში, დონორის ადგილი (ინტრონის 5' ბოლო), განშტოების ადგილი (ინტრონის 3' ბოლოსთან ახლოს) და მიმღების ადგილი (ინტრონის 3' ბოლო) ძალზე მნიშვნელოვანია შეჯვარებისთვის. შეერთების დონორის ადგილი მოიცავს ინვარიანტულ GU მიმდევრობას ინტრონის 5' ბოლოს. შეერთების მიმღების ადგილს ინტრონის 3' ბოლოში აქვს ინვარიანტული AG თანმიმდევრობა. AG თანმიმდევრობის ზემოთ არის რეგიონი, რომელსაც ეწოდება პირიმიდინის რეგიონი (პოლიპირიმიდინის ტრაქტი). პოლიპირიმიდინის ტრაქტიდან უფრო მაღლა, არის განშტოება, რომელიც მოიცავს ადენოზინის ნუკლეოტიდს. ეს ნუკლეოტიდი მონაწილეობს ლარიატის ფორმირებაში.
სურათი 01: Cis და Trans Splicing
მთავარი სპლისოსომებია U1, U2, U4, U5 და U6. მათ შორის ძალიან მნიშვნელოვანია U1 და U2. cis splicing-ში, U1 აკავშირებს 5’ შერწყმის ადგილს, ხოლო U2 უკავშირდება განშტოების წერტილს 3’ შერწყმის ადგილთან. U5/U4/U6 აკავშირებს ეგზონებს 5’ ადგილზე, U6 უკავშირდება U2-ს. მოგვიანებით U1 გამოვიდა. U5 გადადის ეგზონიდან ინტრონში და U6 აკავშირებს 5’ შეჯვარების ადგილზე. გარდა ამისა, U4 ასევე გამოვიდა. U6/U2 კატალიზებს ტრანსესტერიფიკაციას, რაც აქცევს ინტრონის 5' ბოლოს ლიგატს A ნუკლეოტიდზე ინტრონი. ეს იწვევს ლარის ფორმირებას. ლარიატის ფორმირებისას, U5 აკავშირებს ეგზონს 3' შერწყმის ადგილზე და 5' ადგილი იჭრება. შეჯვარების ბოლო ფაზაზე, U2/U5/U6 რჩება მიბმული ლარიატთან და 3' ადგილი იჭრება. გარდა ამისა, ამ ფაზაში ეგზონები ლიგირებულია ATP ჰიდროლიზის გამოყენებით.
რა არის ტრანს შერწყმა?
ტრანსპლაისინგი არის ინტერმოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს ან აუტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც არ არიან იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტის ფარგლებში. ტრანს-სპლაისინგის დროს, წინა mRNA მოლეკულაზე არ არის 5’ შერწყმის ადგილი U1 პროტეინის დასაკავშირებლად. ამის ნაცვლად, დახურული შერწყმის ლიდერი (SL) რნმ ტრანს-სპლიცირებულია აუტრონში მიმდევრობით.
სურათი 02: ტრანსსპლისინგი
აუტრონი არის წინამრნმ-ის რეგიონი 5' თავსახურსა და ტრანს შერწყმის ადგილს შორის. თუმცა, U2 ცილა ჩვეულებრივ აკავშირებს 3’ შერწყმის ადგილს. აუტრონის ამოღების შემდეგ, შერწყმის ლიდერი (SL) ეგზონი ერწყმის პირველ ეგზონს პრემრნმ-ზე. გარდა ამისა, ტრანს-სპლისინგი არის მექანიზმი, რომელიც შეინიშნება გარკვეულ მიკროორგანიზმებში, როგორიცაა Kinetoplastae კლასის პროტისტები გენების გამოხატვის მიზნით.
რა მსგავსებაა Cis და Trans Splicing-ს შორის?
- Cis და trans splicing არის რნმ-ის შერწყმის მექანიზმების ორი ტიპი.
- ორივე მექანიზმში ინტრონები ამოღებულია.
- ასევე, ორივე მექანიზმში ეგზონები გაერთიანებულია მომწიფებული mRNA-ს წარმოქმნით.
- ორივე მექანიზმი გვხვდება ევკარიოტებში.
- ეს მექანიზმები არ არსებობს პროკარიოტებში.
რა განსხვავებაა Cis და Trans Splicing-ს შორის?
Cis შერწყმა არის ინტრამოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტის ფარგლებშია, ხოლო ტრანს-სპლისინგი არის ინტერმოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს ან აუტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც არ არიან იმავე რნმ-ში. ტრანსკრიფცია. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება cis და trans splicing-ს შორის. გარდა ამისა, cis splicing-ში, ინტრონები ამოღებულია მომწიფებული mRNA-ს შესაქმნელად. მეორეს მხრივ, ტრანსსლაინგში ინტრონები ან აუტრონები ამოღებულია მომწიფებული mRNA-ს შესაქმნელად.
შემდეგი ინფოგრაფიკა ჩამოთვლის განსხვავებებს cis და trans splicing-ს შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
შეჯამება – Cis vs Trans Splicing
რნმ-ის შერწყმა არის რნმ-ის დამუშავების ფორმა ცილის სინთეზის პროცესამდე. Cis და trans splicing არის რნმ-ის შერწყმის მექანიზმების ორი ტიპი, რომლებიც გვხვდება ევკარიოტებში. Cis splicing არის ინტრამოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტშია, ხოლო ტრანს-სპლისინგი არის ინტერმოლეკულური მექანიზმი, რომელიც შლის ინტრონებს ან აუტრონებს და უერთდება ეგზონებს, რომლებიც არ არიან იმავე რნმ-ის ტრანსკრიპტის ფარგლებში. ამრიგად, ამით დასრულდა განხილვა ცის და ტრანს სლაინგს შორის განსხვავების შესახებ.
