მთავარი განსხვავება შაინ დალგარნოსა და კოზაკის თანმიმდევრობას შორის არის ის, რომ შაინ დალგარნოს თანმიმდევრობა არის რიბოსომური დამაკავშირებელი ადგილი ბაქტერიულ და არქეალურ მესენჯერ რნმ-ში, ხოლო კოზაკის თანმიმდევრობა არის ცილის ტრანსლაციის დაწყების ადგილი ევკარიოტული მესენჯერის რნმ-ებში..
Shine Dalgarno და Kozak თანმიმდევრობა არის ორი კონსენსუსის თანმიმდევრობა, რომლებიც ძალიან მნიშვნელოვანია თარგმანის დაწყებისთვის. მოლეკულურ ბიოლოგიაში ტრანსლაცია არის პროცესი, რომლითაც ციტოპლაზმაში რიბოსომები სინთეზირებენ ცილებს ტრანსკრიპციის პროცესის შემდეგ. თარგმანში, mRNA (მესენჯერი რნმ) დეკოდირდება რიბოსომაში, რათა წარმოიქმნას სპეციფიკური ამინომჟავის ჯაჭვი ბირთვის გარეთ.როგორც წესი, რიბოსომა იწვევს დეკოდირების პროცესს, რაც ხელს უწყობს დამატებითი tRNA ანტიკოდონის თანმიმდევრობების მიბმას mRNA კოდონებთან. თარგმანი მიმდინარეობს სამ ეტაპად: დაწყება, გახანგრძლივება და დასრულება.
რა არის Shine Dalgarno Sequence?
Shine Dalgarno თანმიმდევრობა არის რიბოსომური შემაკავშირებელი ადგილი ბაქტერიულ და არქეალურ მესენჯერ რნმ-ში. ის ძირითადად განლაგებულია საწყისი კოდონის AUG-ის ზემოთ 8 ფუძის გარშემო. რნმ-ის ეს თანმიმდევრობა ხელს უწყობს რიბოზომების რეკრუტირებას მესინჯერ რნმ-ში რიბოსომის გასწორებით mRNA საწყისი კოდონთან. ამრიგად, ის იწყებს ცილის სინთეზს. რეკრუტირების შემდეგ, tRNA-ს შეუძლია დაამატოთ ამინომჟავები თანმიმდევრობით, როგორც ამას კარნახობს mRNA კოდონები. ეს განსაკუთრებული თანმიმდევრობა ხშირია ბაქტერიებში, მაგრამ უფრო იშვიათია არქეებში. უფრო მეტიც, ის ასევე გვხვდება ქლოროპლასტებსა და მიტოქონდრიულ ტრანსკრიპტებში. Shine Dalgarno-ს თანმიმდევრობა პირველად შემოგვთავაზეს ავსტრალიელმა მეცნიერებმა ჯონ შაინმა და ლინ დალგარნომ. ექვსი ბაზის კონსენსუსის თანმიმდევრობა არის AGGAGG. მაგალითად, Escherichia coli-ში თანმიმდევრობა არის AGGAGGU.
სურათი 01: Shine Dalgarno Sequence
დაწყების ადგილის შერჩევა (AUG) დამოკიდებულია რიბოსომის 30S ქვეერთეულსა და mRNA შაბლონს შორის ურთიერთქმედებას. პირიმიდინით მდიდარი რეგიონი 30S ქვეგანყოფილების 16srRNA კომპონენტზე უკავშირდება პურინით მდიდარ რეგიონს, რომელიც ცნობილია როგორც Shine Dalgarno თანმიმდევრობა mRNA-ში AUG საწყისი კოდონის ზემოთ. გარდა ამისა, საწყისი კომპლექსის ფორმირებისას, ეს დამატებითი ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობები წყვილდება ორჯაჭვიანი რნმ-ის სტრუქტურის შესაქმნელად. ეს აადვილებს mRNA-ს რიბოსომასთან შეკავშირებას ისე, რომ საწყისი კოდონი მოთავსებულია რიბოსომის P ადგილზე.
რა არის Kozak Sequence?
კოზაკის თანმიმდევრობა არის ცილის ტრანსლაციის დაწყების ადგილი ევკარიოტული mRNA უმეტესობაში.ამ თანმიმდევრობას ასევე უწოდებენ კოზაკის კონსენსუსის თანმიმდევრობას. კოზაკის თანმიმდევრობა არის ოპტიმალური თანმიმდევრობა ევკარიოტებში ტრანსლაციის დასაწყებად. ეს თანმიმდევრობა ცილის რეგულირების განუყოფელი ასპექტია. ის ასევე ძალიან მნიშვნელოვანია მთლიანი უჯრედის ჯანმრთელობისთვის. ის გენეტიკური შეტყობინებებიდან ცილების თარგმნის კორექტირებას უწყობს ხელს რიბოსომის შეკრებისა და თარგმანის დაწყების შუამავლობით.
სურათი 02: კოზაკის თანმიმდევრობა
ამ თანმიმდევრობას ეწოდა მეცნიერის, მერლინ კოზაკის სახელი, რომელმაც ის აღმოაჩინა. მან ის აღმოაჩინა დნმ-ის გენომიური თანმიმდევრობების დეტალური ანალიზით. კოზაკის თანმიმდევრობა არის 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. დიდი ასოები მიუთითებს შენახულ ფუძეებზე, ხოლო პატარა ასოები მიუთითებს საერთო ცვლადის ფუძეებზე. R მიუთითებს პურინს (ადენინი ან გუანინი), რომელიც ყოველთვის ამ ადგილას არის განლაგებული.
რა მსგავსებაა შაინ დალგარნოსა და კოზაკის თანმიმდევრობას შორის?
- Shine Dalgarno და Kozak თანმიმდევრობა არის ორი კონსენსუსის თანმიმდევრობა, რომლებიც ძალიან მნიშვნელოვანია თარგმანის დაწყებისას.
- ორივე რნმ-ის თანმიმდევრობაა.
- რიბოსომის უფრო მცირე ქვედანაყოფი უკავშირდება ორივე თანმიმდევრობას.
- ორივე თანმიმდევრობა შუამავლობს რიბოსომის სათანადო შეკრებასა და ტრანსლაციის დაწყებაში.
- ისინი ცილების რეგულირებისა და მთლიანი უჯრედული ჯანმრთელობის განუყოფელი ასპექტებია.
რა განსხვავებაა Shine Dalgarno-სა და Kozak Sequence-ს შორის?
Shine Dalgarno თანმიმდევრობა არის რიბოსომური შემაკავშირებელი ადგილი, რომელიც გვხვდება ბაქტერიულ და არქეალურ მესენჯერ რნმ-ში, ხოლო კოზაკის თანმიმდევრობა არის ცილის თარგმნის დაწყების ადგილი, რომელიც გვხვდება ევკარიოტული მესენჯერის რნმ-ში. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება Shine Dalgarno-სა და Kozak-ის თანმიმდევრობას შორის. გარდა ამისა, შაინ დალგარნოს თანმიმდევრობა არის 5'AGGAGGU3', ხოლო კოზაკის თანმიმდევრობა არის 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
შემდეგი ინფოგრაფიკა ჩამოთვლის განსხვავებებს Shine Dalgarno-სა და Kozak-ის თანმიმდევრობას შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – შაინ დალგარნო წინააღმდეგ კოზაკის თანმიმდევრობა
Shine Dalgarno და Kozak თანმიმდევრობა არის ორი კონსენსუსის რნმ თანმიმდევრობა, რომლებიც ძალიან მნიშვნელოვანია რიბოსომის შეკრებისა და ტრანსლაციის დაწყებისთვის. შაინ დალგარნოს თანმიმდევრობა არის რიბოსომური შემაკავშირებელი ადგილი ბაქტერიულ და არქეალურ მესენჯერ რნმ-ში, ხოლო კოზაკის თანმიმდევრობა არის ცილის ტრანსლაციის დაწყების ადგილი ევკარიოტული მესენჯერის რნმ-ში. ამრიგად, ეს აჯამებს განსხვავებას შაინ დალგარნოსა და კოზაკის თანმიმდევრობას შორის.
