რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციას შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციაში ტრანსპოზონი კოპირდება ახალ ადგილას, ხოლო ამოჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციის დროს ტრანსპოზიონი გადატანილია ახალ ადგილას.
გადაადგილებადი ელემენტები ან მხტუნავი გენები არის დნმ-ის თანმიმდევრობა, რომელსაც შეუძლია შეცვალოს მათი პოზიცია გენომში. ეს მოხსენიებულია, როგორც ტრანსპოზიცია. ტრანსპოზიციას ზოგჯერ შეუძლია შექმნას ან შეცვალოს მუტაციები და შეცვალოს უჯრედის გენეტიკური იდენტობა და გენომის ზომა. ტრანსპოზიცია აღმოაჩინა ბარბარა მაკკლინტოკმა 1983 წელს. ტრანსპოზიცია შეიძლება განხორციელდეს ორი ტექნიკით, როგორიცაა დუბლირება და დაჭრა და ჩასმა.
რა არის რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია?
რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, რომელიც ეხმარება ტრანსპოზონის ამოკვეთას მშობლიური ადგილიდან მეორეზე რეპლიკაციური ან დუბლირებული ტექნიკის მეშვეობით. ეს მექანიზმი პირველად იპოვა ჯეიმს ა შაპირომ 1979 წელს. ამ მექანიზმში ტრანსპოზიციური ელემენტის დუბლირება ხდება ტრანსპოზიციის რეაქციის დროს ისე, რომ ტრანსპონირებადი ერთეული არის ორიგინალური ელემენტის ასლი. უფრო მეტიც, ამ მექანიზმში, დონორი და რეცეპტორის დნმ-ის თანმიმდევრობები ქმნიან დამახასიათებელ შუალედურ „თეტა“კონფიგურაციას, რომელსაც ეწოდება Shapiro intermediate (კოინტეგრატი). რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია დამახასიათებელი რეტროტრანსპოზონია. ეს მექანიზმი ჩვეულებრივ გვხვდება I კლასის ტრანსპოზონებში.
სურათი 01: რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია
რეპლიკაციური ტრანსპოზიციის კარგი მაგალითი შეიძლება შეინიშნოს E. coli TN3 ტრანსპოზონში. TN3 ტრანსპოზონს შეუძლია გადაადგილდეს ორიგინალური პლაზმიდიდან სხვა სამიზნე პლაზმიდში რეპლიკაციური ან დუბლირებული ტექნიკით. მთელი ეს მოვლენა შუამავალია ორი მნიშვნელოვანი ფერმენტის მიერ, სახელწოდებით ტრანსპოზაზა და რეზოლვაზა. გარდა ამისა, რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია შეიძლება შეინიშნოს როგორც დნმ ტრანსპოზონებში, ასევე რეტროპოზონებში. ყველაზე კარგად შესწავლილი ტრანსპოზირებადი ბაქტერიული ვირუსი არის ბაქტერიოფაგი Mu.
რა არის Cut and Paste Transposition?
Cut and Paste ტრანსპოზიცია არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, რომელიც ეხმარება ტრანსპოზონის ამოკვეთას მშობლიური ადგილიდან მეორეზე ჭრისა და ჩასმის ტექნიკის მეშვეობით. ეს მექანიზმი ასევე ცნობილია, როგორც ტრანსპოზიციის კონსერვატიული მოდელი. ამ არარეპლიკაციურ ტრანსპოზიციაში, ტრანსპოზონის ამოკვეთა და ინტეგრაცია ერთი გენომიური ადგილიდან მეორეში ხდება ასლის დატოვების გარეშე.
სურათი 02: ამოჭრა და ჩასვით ტრანსპოზიცია
ამ მექანიზმში, ტრანსპოზაზას ფერმენტი ჯერ აკავშირებს ტერმინალურ გამეორებებს, რომლებიც ჩვეულებრივ გვხვდება ტრანსპოზონების ორივე ბოლოზე და შემდეგ ქმნის სტრუქტურას, რომელსაც სინაფსური კომპლექსი (ტრანსპოზიომა) ეწოდება. სინაფსური კომპლექსი წყვეტს ტრანსპოზონს თავდაპირველი გენომიური მდებარეობიდან და აერთიანებს მას ახალ სამიზნე მდებარეობაში. ამის შემდეგ, ტრანსპოზები ტოვებენ ტრანსპოზიონის ორივე ბოლოდან. როგორც კი ტრანსპოზაზას ფერმენტი ტოვებს ტრანსპოზონს, ხარვეზები ივსება მასპინძელი პოლიმერაზას ფერმენტით. ეს საშუალებას აძლევს ტრანსპოზონის სრულ შეერთებას ახალ გენომურ მდებარეობასთან. ეს მექანიზმი ჩვეულებრივ გვხვდება II კლასის ტრანსპოზონებში. გარდა ამისა, TN5 ბაქტერიული ტრანსპოზონები არის ცნობილი მაგალითი, რომელიც აჩვენებს კონსერვატიულ ან მოჭრილი და ჩასმული ტრანსპოზიციის მექანიზმს.
რა მსგავსებაა რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ამოჭრასა და ჩასმა ტრანსპოზიციას შორის?
- რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია და ამოჭრა და ჩასვით ტრანსპოზიცია ტრანსპოზიციის ორი ტიპის მექანიზმია.
- ორივე მექანიზმში გადასატანი ელემენტები გადადიან ერთი გენომიური ადგილიდან მეორე ახალ გენომიურ ადგილას.
- ორივე მექანიზმს შეუძლია შექმნას ან შეცვალოს მუტაციები და შეცვალოს უჯრედის გენეტიკური იდენტობა.
- ბაქტერიული ტრანსპოზონები აჩვენებს ორივე მექანიზმს.
- ისინი ძალიან მნიშვნელოვანი მოვლენებია ევოლუციისთვის.
რა განსხვავებაა რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციას შორის?
რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, სადაც ტრანსპოზიონი კოპირდება ახალ ადგილას, ხოლო cut and past transposition არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, სადაც ტრანსპოზიონი გადადის ახალ ადგილას.ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციას შორის. გარდა ამისა, რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია ჩვეულებრივ ხდება I კლასის ტრანსპოზონებში, ხოლო დაჭრილი და ჩასმული ტრანსპოზიცია ჩვეულებრივ ხდება II კლასის ტრანსპოზონებში.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციას შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია ჭრისა და ჩასმის ტრანსპოზიციის წინააღმდეგ
რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია და ამოჭრა და ჩასვით ტრანსპოზიცია ტრანსპოზიციის მექანიზმების ორი ტიპია. რეპლიკაციური ტრანსპოზიცია არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, სადაც ტრანსპოზიონი კოპირდება ახალ ადგილას, ხოლო cut and past transposition არის ტრანსპოზიციის მექანიზმის ტიპი, სადაც ტრანსპოზიონი გადადის ახალ ადგილას. ასე რომ, ეს აჯამებს განსხვავებას რეპლიკაციურ ტრანსპოზიციასა და ჭრის და ჩასმის ტრანსპოზიციას შორის.
