ძირითადი განსხვავება – Alpha Helix vs Beta Pleated Sheet
ალფა ხვეულები და ბეტა ნაკეცები არის ორი ყველაზე ხშირად ნაპოვნი მეორადი სტრუქტურა პოლიპეპტიდურ ჯაჭვში. ეს ორი სტრუქტურული კომპონენტი არის პირველი ძირითადი საფეხური პოლიპეპტიდური ჯაჭვის დაკეცვის პროცესში. Alpha Helix-სა და Beta Pleated Sheet-ს შორის მთავარი განსხვავებაა მათ სტრუქტურაში; მათ აქვთ ორი განსხვავებული ფორმა კონკრეტული სამუშაოს შესასრულებლად.
რა არის Alpha Helix?
ალფა სპირალი არის ამინომჟავების ნარჩენების მარჯვენა ხვეული პოლიპეპტიდურ ჯაჭვზე. ამინომჟავების ნარჩენების დიაპაზონი შეიძლება განსხვავდებოდეს 4-დან 40 ნარჩენამდე.ზედა ხვეულზე C=O ჯგუფის ჟანგბადსა და ქვედა კოჭის N-H ჯგუფის წყალბადს შორის წარმოქმნილი წყალბადის ბმები ხელს უწყობს ხვეულის შეკავებას. წყალბადის ბმა იქმნება ყოველი ოთხი ამინომჟავის ნარჩენზე ჯაჭვში ზემოთ მოყვანილი წესით. ეს ერთიანი ნიმუში აძლევს მას გარკვეულ მახასიათებლებს, როგორიცაა ხვეულის სისქე და ის კარნახობს ყოველი სრული შემობრუნების სიგრძეს სპირალის ღერძის გასწვრივ. ალფა სპირალის სტრუქტურის სტაბილურობა დამოკიდებულია რამდენიმე ფაქტორზე.
O ატომები წითლად, N ატომები ლურჯში და წყალბადის ბმები მწვანე წერტილოვანი ხაზების სახით
რა არის ბეტა ნაკეციანი ფურცელი?
ბეტა ნაკეცები, ასევე ცნობილი როგორც ბეტა ფურცელი, განიხილება, როგორც მეორადი სტრუქტურის მეორე ფორმა ცილებში. ის შეიცავს ბეტა ძაფებს, რომლებიც დაკავშირებულია ლატერალურად მინიმუმ ორი ან სამი ხერხემლის წყალბადის ბმით, რათა შექმნან დაგრეხილი, ნაკეც ფურცელი, როგორც ეს ნაჩვენებია სურათზე.ბეტა ჯაჭვი არის პოლიპეპტიდური ჯაჭვის მონაკვეთი; მისი სიგრძე ზოგადად უდრის 3-დან 10 ამინომჟავას, მათ შორის ხერხემალი გაფართოებულ დადასტურებაში.
4-ჯაჭვიანი ანტიპარალელური β ფურცლის ფრაგმენტი ფერმენტ კატალაზას კრისტალური სტრუქტურიდან.
a) გვიჩვენებს ანტიპარალელურ წყალბადურ ბმებს (წერტილები) პეპტიდურ NH და CO ჯგუფებს შორის მიმდებარე ძაფებზე. ისრები მიუთითებს ჯაჭვის მიმართულებაზე, ხოლო ელექტრონის სიმკვრივის კონტურები ასახავს არა-H ატომებს. O ატომები წითელი ბურთულებია, N ატომები ლურჯია და H ატომები გამოტოვებულია სიმარტივისთვის; გვერდითი ჯაჭვები ნაჩვენებია მხოლოდ პირველი გვერდითი ჯაჭვის C ატომამდე (მწვანე)
ბ) ცენტრალური ორი β ძაფების კიდეზე ხედი
ბეტა ნაკეც ფურცლებში პოლიპეპტიდური ჯაჭვები ეშვება ერთმანეთის გასწვრივ.სტრუქტურის ტალღისებური გარეგნობის გამო მან მიიღო სახელწოდება "პლისირებული ფურცელი". ისინი ერთმანეთთან დაკავშირებულია წყალბადის ბმებით. ეს სტრუქტურა საშუალებას გაძლევთ შექმნათ მეტი წყალბადის ბმები პოლიპეპტიდური ჯაჭვის გაჭიმვის გზით.
რა განსხვავებაა Alpha Helix-სა და Beta Pleated Sheet-ს შორის?
ალფა ჰელიქსისა და ბეტა ნაკეცის ფურცლის სტრუქტურა
Alpha Helix:
ამ სტრუქტურაში, პოლიპეპტიდური ხერხემალი მჭიდროდ არის მიბმული წარმოსახვითი ღერძის გარშემო, როგორც სპირალური სტრუქტურა. იგი ასევე ცნობილია როგორც პეპტიდური ჯაჭვის ჰელიკოიდური განლაგება.
ალფა სპირალის სტრუქტურის ფორმირება ხდება მაშინ, როდესაც პოლიპეპტიდური ჯაჭვები ხვეულია სპირალურად. ეს საშუალებას აძლევს ჯაჭვის ყველა ამინომჟავას შექმნას წყალბადის ბმები (ბმა ჟანგბადის მოლეკულასა და წყალბადის მოლეკულას შორის). წყალბადის ბმები საშუალებას აძლევს სპირალს შეინარჩუნოს სპირალური ფორმა და იძლევა მჭიდრო ხვეულს. ეს სპირალური ფორმა ალფა სპირალს ძალიან ძლიერს ხდის.
წყალბადის ბმები მითითებულია ყვითელი წერტილებით.
ბეტა ნაკეციანი ფურცელი:
როდესაც პოლიპეპტიდური ჯაჭვის(ებ)ის ორი ან მეტი ფრაგმენტი ერთმანეთს ემთხვევა და წყალბადის ბმების რიგს ქმნის ერთმანეთთან, შემდეგი სტრუქტურები შეიძლება მოიძებნოს. ეს შეიძლება მოხდეს ორი გზით; პარალელური განლაგება და ანტიპარალელური განლაგება.
სტრუქტურის მაგალითები:
Alpha Helix: ხელების ან ფეხის ფრჩხილები შეიძლება მივიღოთ, როგორც ალფა სპირალის სტრუქტურის მაგალითი.
ბეტა ნაკეციანი ფურცელი: ბუმბულის სტრუქტურა ბეტა ნაკეციანი ფურცლის სტრუქტურის მსგავსია.
სტრუქტურის მახასიათებლები:
ალფა სპირალი: ალფა სპირალის სტრუქტურაში არის 3.6 ამინომჟავა სპირალის ყოველ შემობრუნებაზე.ყველა პეპტიდური ბმა არის ტრანს და პლანური, ხოლო პეპტიდურ ბმებში N-H ჯგუფები მიმართულია იმავე მიმართულებით, რომელიც დაახლოებით პარალელურია სპირალის ღერძისა. ყველა პეპტიდური ბმის C=O ჯგუფები მიმართულია საპირისპირო მიმართულებით და ისინი პარალელურია სპირალის ღერძისა. თითოეული პეპტიდური ბმის C=O ჯგუფი მიბმულია პეპტიდური ბმის N-H ჯგუფთან, რომელიც ქმნის წყალბადურ კავშირს. ყველა R- ჯგუფი მიმართულია სპირალიდან გარეთ.
ბეტა ნაკეციანი ფურცელი: ბეტა ნაკეცის ფურცლის თითოეული პეპტიდური ბმა არის პლანშეტური და აქვს ტრანს-კონფორმაცია. მიმდებარე ჯაჭვებიდან პეპტიდური ბმების C=O და N-H ჯგუფები ერთ სიბრტყეშია და მიმართულია ერთმანეთისკენ, ქმნიან წყალბადის კავშირს მათ შორის. ყველა R- ჯგუფი ნებისმიერ ჯაჭვში შეიძლება ალტერნატიულად აღმოჩნდეს ფურცლის სიბრტყის ზემოთ და ქვემოთ.
განმარტებები:
მეორადი სტრუქტურა: ეს არის დასაკეცი ცილის ფორმა წყალბადის კავშირის გამო მის ხერხემალ ამიდსა და კარბონილის ჯგუფებს შორის.
