აქტიურ ადგილსა და შემაკავშირებელ ადგილს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ აქტიური ადგილი ხელს უწყობს ქიმიური რეაქციის კატალიზებას, ხოლო შემაკავშირებელი ადგილი ხელს უწყობს ლიგანდის შეკავშირებას დიდ მოლეკულასთან.
შეკავშირების ადგილი არის რეგიონი ცილაზე, დნმ-ზე ან რნმ-ზე, რომელსაც ლიგანდს შეუძლია მიბმა. ფერმენტები არის ცილები. აქტიური უბანი არის ფერმენტის რეგიონი, რომელსაც სუბსტრატებს შეუძლიათ დაკავშირება ქიმიური რეაქციის გასატარებლად. ამ კონკრეტულ რეგიონს ასევე აქვს დამაკავშირებელი ადგილი კატალიზურ ადგილთან ერთად. მაშასადამე, დამაკავშირებელი ადგილები ხელს უწყობს მხოლოდ ლიგანდის შეკავშირებას დიდ მოლეკულასთან, მაშინ როდესაც აქტიური ადგილები ხელს უწყობს ლიგანდის შეკავშირებას დიდ მოლეკულასთან, ხოლო მას აძლევენ კატალიზებულ ქიმიურ რეაქციას.
რა არის აქტიური საიტი?
აქტიური ადგილი არის ფერმენტის რეგიონი, რომელსაც ქიმიური რეაქციის სუბსტრატები უკავშირდებიან კატალიზებული ქიმიური რეაქციის გასატარებლად. ეს რეგიონი შედგება ორი ქვერეგიონისგან, როგორც დამაკავშირებელი და კატალიზური ადგილი. დამაკავშირებელი ადგილი შეიცავს ნარჩენებს, რომლებიც ხელს უწყობენ სუბსტრატის (რეაქტანტების) შეკავშირებას ფერმენტთან. კატალიზური ადგილი ხელს უწყობს ქიმიური რეაქციის კატალიზებას. უფრო მეტიც, ეს რეგიონი ძალიან მცირეა ფერმენტის მთელ მოცულობასთან შედარებით; ფერმენტის მთლიანი მოცულობის დაახლოებით 10-20%.
სურათი 01: აქტიური უბნის სავალდებულო ადგილი და კატალიზური ადგილი
ჩვეულებრივ, აქტიური საიტი შეიცავს 3-4 ამინომჟავას. ფერმენტის დანარჩენი ამინომჟავები, რომლებიც მონაწილეობენ ფერმენტის მესამეული სტრუქტურის შენარჩუნებაში.რაც მთავარია, აქტიურ საიტს აქვს სპეციფიკური დიზაინი, რომელიც შეიძლება მოერგოს კონკრეტულ სუბსტრატს. ამიტომ, ეს ფერმენტები რეაგირებენ მხოლოდ კონკრეტულ სუბსტრატებთან. მაგრამ ზოგჯერ ფერმენტებს მათი ფუნქციისთვის კოფაქტორები სჭირდებათ. აქტიური ადგილის მთავარი ფუნქციაა ქიმიური რეაქციის აქტივაციის ენერგიის შემცირება და ამით რეაქციის სიჩქარის გაზრდა.
რა არის სავალდებულო საიტი?
შეკავშირების ადგილი არის რეგიონი ცილაზე, დნმ-ზე ან რნმ-ზე, რომელსაც ლიგანდები შეუძლიათ შეკავშირება. იქ, ლიგანდს შეუძლია შექმნას ქიმიური კავშირი ამ ადგილზე. ეს რეგიონები აჩვენებენ სპეციფიკას; კონკრეტული ლიგანდი დაუკავშირდება კონკრეტულ დამაკავშირებელ ადგილს. აქედან გამომდინარე, ეს საიტი არის ლიგანდების ტიპების საზომი, რომლებსაც შეუძლიათ მოლეკულასთან შეკავშირება.
უფრო მეტიც, ჩვენ ხშირად ვიყენებთ ამ რეგიონებს ბიომოლეკულების ფუნქციური დახასიათებისთვის. მაგალითად, ჩვენ შეგვიძლია დავახასიათოთ აქტიური საიტის ფუნქციონირება მისი დამაკავშირებელი საიტის მეშვეობით. უფრო მეტიც, დნმ-ის შემთხვევაში, დამაკავშირებელი ადგილის სპეციფიკური ტიპია დნმ-ზე არსებული ტრანსკრიპციის ფაქტორის დამაკავშირებელი ადგილი.
რა განსხვავებაა აქტიურ საიტსა და სავალდებულო საიტს შორის?
აქტიური ადგილი არის ფერმენტის რეგიონი, რომელსაც ქიმიური რეაქციის სუბსტრატები უკავშირდებიან კატალიზებული ქიმიური რეაქციის გასატარებლად, ხოლო შემაკავშირებელი ადგილი არის რეგიონი ცილაზე, დნმ-ზე ან რნმ-ზე, რომელსაც ლიგანდები შეუძლიათ შეკავშირება. ეს არის მთავარი განსხვავება აქტიურ ადგილსა და სავალდებულო ადგილს შორის. უფრო მეტიც, აქტიური ადგილები წარმოდგენილია ფერმენტებზე და ისინი ხელს უწყობენ კონკრეტული ქიმიური რეაქციის რეაქციის სიჩქარის გაზრდას ამ რეაქციის აქტივაციის ენერგიის ბარიერის შემცირებით. შემაკავშირებელი ადგილები, მეორე მხრივ, პასუხისმგებელია კონკრეტული ლიგანდის შეკავშირებაზე კონკრეტულ მოლეკულასთან.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებას აქტიურ საიტსა და სავალდებულო საიტს შორის ცხრილის სახით.
რეზიუმე – აქტიური საიტი vs სავალდებულო საიტი
აქტიური ადგილები არის ფერმენტების რეგიონები, რომლებსაც შეუძლიათ გაზარდონ ქიმიური რეაქციის რეაქციის სიჩქარე ამ რეაქციის აქტივაციის ენერგიის ბარიერის შემცირებით. დამაკავშირებელი ადგილი არის ნებისმიერი რეგიონი, რომელსაც ლიგანდს შეუძლია მიბმა. აქტიური საიტი ასევე შეიცავს სავალდებულო ადგილს. განსხვავება აქტიურ ადგილსა და სავალდებულო საიტებს შორის მდგომარეობს არსებობასა და ფუნქციონირებაში. მაშასადამე, აქტიურ ადგილსა და შემაკავშირებელ ადგილს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ აქტიური ადგილი ხელს უწყობს ქიმიური რეაქციის კატალიზებას, ხოლო შემაკავშირებელი ადგილი ხელს უწყობს ლიგანდის შეკავშირებას დიდ მოლეკულასთან.
