სერინისა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ სერინის რეკომბინაზაში სერინი არის ნუკლეოფილური ამინომჟავა, რომელსაც ფერმენტი იყენებს დნმ-ზე თავდასხმის ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს, ხოლო ტიროზინის რეკომბინაზაში ტიროზინი არის ნუკლეოფილური ამინომჟავა, რომელიც გამოიყენება. ფერმენტის მიერ დნმ-ზე თავდასხმის ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს.
ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაცია (კონსერვატიული ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაცია) არის გენეტიკური რეკომბინაციის ტექნიკის ტიპი, სადაც დნმ-ის ჯაჭვის გაცვლა ხდება სეგმენტებს შორის, რომლებსაც აქვთ გარკვეული ხარისხის თანმიმდევრობის ჰომოლოგია. უბნის სპეციფიკური რეკომბინაზები არეგულირებს უბნის სპეციფიკურ რეკომბინაციის პროცესს.ეს ფერმენტები დაჯგუფებულია ორ ოჯახად, როგორც სერინის რეკომბინაზას ოჯახი და ტიროზინის რეკომბინაზას ოჯახი. სახელები მომდინარეობს შენარჩუნებული ნუკლეოფილური ამინომჟავის ნარჩენიდან, რომელიც იმყოფება რეკომბინაზების ზემოთ ორ კლასში, რომელიც გამოიყენება დნმ-ის შეტევისთვის და რომელიც კოვალენტურად უკავშირდება მას ძაფების გაცვლის დროს უბნის სპეციფიკურ რეკომბინაციაში.
რა არის სერინის რეკომბინაზა?
ადგილის სპეციფიური რეკომბინაციის მეთოდში, ორი მოკლე დნმ-ის თანმიმდევრობა („სამიზნე ადგილები“) იჭრება ორივე ჯაჭვის კონკრეტულ წერტილებში და ამოჭრილი ბოლოები უერთდება ახალ პარტნიორებს. უბნის სპეციფიკური რეკომბინაციის ტექნოლოგიები არის გენომიური ხელსაწყოები გენური ინჟინერიაში, რომლებიც დამოკიდებულია რეკომბინაზას ფერმენტებზე დნმ-ის სამიზნე მონაკვეთის ჩანაცვლებისთვის. ნაპოვნია მრავალი ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის სისტემა, რომელიც ახორციელებს ამ დნმ-ის გადაკეთებას სხვადასხვა მიზნებისთვის. მაგრამ ყველა ეს რეკომბინაზა ფერმენტი ეკუთვნის ორ ოჯახს. სერინის რეკომბინაზა ერთ-ერთი მათგანია. მათ შეუძლიათ განახორციელონ დნმ-ის სამი სახის გადაწყობა: ინტეგრაცია, ამოკვეთა და ინვერსია.
სურათი 01: სერინის რეკომბინაზა
ადგილის სპეციფიური რეკომბინაზები, როგორიცაა სერინის რეკომბინაზა, ახორციელებენ დნმ-ის გადაწყობას დნმ-ის მოკლე თანმიმდევრობის ამოცნობით და კავშირით (სამიზნე ადგილი), სადაც ისინი ჭრიან დნმ-ის ხერხემალს. მოგვიანებით ხდება დნმ-ის ორი სპირალის გაცვლა და ხდება დნმ-ის ჯაჭვების ხელახლა შეერთება. სერინის რეკომბინაზაში, სერინი არის ამინომჟავა, რომელსაც ფერმენტი იყენებს დნმ-ზე თავდასხმისთვის უბნის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს. დნმ-ის დაშლის დროს ცილა-დნმ ბმა იქმნება ტრანსესტერიფიკაციის რეაქციის მეშვეობით. ფოსფოდიესტერული ბმა ჩანაცვლებულია ფოსფოსერინული კავშირით 5-ფოსფატის ჯგუფს გაყოფის ადგილზე და კონსერვირებული სერინის ნარჩენის ჰიდროქსილის ჯგუფს შორის. ახალი ბმა ინახავს ენერგიას, რომელიც იხარჯება სამიზნე ადგილზე დნმ-ის დაშლაში.ეს ენერგია მოგვიანებით გამოიყენება დნმ-ის შესაერთებლად დეოქსირიბოზას ჰიდროქსილის შესაბამის ჯგუფთან მეორე ადგილზე. სერინის რეკომბინაზების მაგალითებია სერინის რეზოლვაზები/ინვერტაზები და სერინის ინტეგრაზები.
რა არის ტიროზინის რეკომბინაზა?
ტიროზინის რეკომბინაზა არის ფერმენტის სხვა კლასი, რომელიც არეგულირებს კონსერვატიულ უბნის სპეციფიკურ რეკომბინაციას. როგორც ადრე იყო აღწერილი, ტიროზინის რეკომბინაზა ასევე ახორციელებს დნმ-ის გადაწყობას იმავე წესით დნმ-ის მოკლე თანმიმდევრობის ამოცნობით და შეერთებით (სამიზნე ადგილი), სადაც ისინი ჭრიან დნმ-ის ხერხემალს. მოგვიანებით ხდება დნმ-ის ორი სპირალის გაცვლა და დნმ-ის ჯაჭვების ხელახლა შეერთება.
სურათი 02: ტიროზინის რეკომბინაზა
მაგრამ ტიროზინის რეკომბინაზაში, ტიროზინი არის ამინომჟავა, რომელსაც ფერმენტი იყენებს დნმ-ზე თავდასხმისთვის ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს.ამ კლასის საერთო მახასიათებელია კონსერვირებული ნუკლეოფილური ტიროზინის ნარჩენი, რომელიც თავს ესხმის დნმ-ფოსფატს, რათა შექმნას 3'-ფოსფოტიროზინის კავშირი. ტიროზინის რეკომბინაზები (A1) და ტიროზინინტეგრაზები (A2) წარმოადგენენ ფერმენტების გამორჩეულ ჯგუფებს ტიროზინ რეკომბინაზას ფერმენტების ოჯახში.
რა მსგავსებაა სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის?
- ეს არის რეკომბინაზას ფერმენტების კლასი.
- ორივე არეგულირებს საიტის სპეციფიკურ რეკომბინაციას.
- ისინი პროტეინებია.
- ძირითადი ქიმიური რეაქცია ორივესთვის ერთნაირია.
- ორივე ახდენს ტრანსესტერიფიკაციის რეაქციების კატალიზებას.
რა განსხვავებაა სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის?
სერინის რეკომბინაზაში, სერინი არის ნუკლეოფილური ამინომჟავა, რომელსაც ფერმენტი იყენებს დნმ-ზე თავდასხმისთვის უბნის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს. მეორეს მხრივ, ტიროზინის რეკომბინაზაში, ტიროზინი არის ნუკლეოფილური ამინომჟავა, რომელსაც ფერმენტი იყენებს დნმ-ზე თავდასხმისთვის უბნის სპეციფიკური რეკომბინაციის დროს.ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის. სერინის რეკომბინაზას საერთო მახასიათებელია ის, რომ იგი აყალიბებს ფოსფოსერინულ კავშირს დნმ-თან, ხოლო ტიროზინის რეკომბინაზა აყალიბებს ფოსფოტიროზინურ კავშირს დნმ-თან სპეციფიკური რეკომბინაციის პროცესის დროს.
ქვემოთ მოცემულ ინფოგრაფიკაში ჩამოთვლილია განსხვავებები სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის ტაბულური ფორმით.
-
განსხვავება სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის ტაბულური ფორმით
რეზიუმე - სერინი vs ტიროზინ რეკომბინაზა
რეკომბინაცია შეიძლება მოხდეს დნმ-ის მსგავს მოლეკულებს შორის, როგორც ჰომოლოგების რეკომბინაციაში ან განსხვავებულ მოლეკულებს შორის, როგორც არაჰომოლოგების რეკომბინაციაში. უბნის სპეციფიკური რეკომბინაცია არის გენეტიკური რეკომბინაციის ტიპი, რომელშიც დნმ-ის ჯაჭვის გაცვლა ხდება სეგმენტებს შორის, რომლებსაც აქვთ გარკვეული თანმიმდევრობის ჰომოლოგია მაინც.იგი კატალიზებულია რეკომბინაზებით. რეკომბინაზების უმეტესობა დაჯგუფებულია ორ ოჯახად: სერინის რეკომბინაზა და ტიროზინ რეკომბინაზა. სერინის რეკომბინაზა იყენებს სერინს, როგორც ნუკლეოფილურ ამინომჟავას დნმ-ზე თავდასხმის მიზნით ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის პროცესის დროს. ტიროზინის რეკომბინაზა იყენებს ტიროზინს, როგორც ნუკლეოფილურ ამინომჟავას დნმ-ზე თავდასხმისთვის ადგილის სპეციფიკური რეკომბინაციის პროცესის დროს. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება სერინსა და ტიროზინის რეკომბინაზას შორის.
