Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ კუმასის შეღებვა არის ცილის შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს coomassie ბრწყინვალე ცისფერ ლაქას, ხოლო სლივერ შეღებვა არის ცილის შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს ვერცხლის შეღებვას.
პროტეინის გამოყოფა და იდენტიფიკაცია არის კრიტიკული ნაბიჯი პროტეომის ანალიზში. მათ სჭირდებათ მაღალი გარჩევადობის ცილის დახასიათება გელის ელექტროფორეზის შემდეგ. არსებობს უამრავი შეღებვის ტექნიკა, რომელიც მოიცავს სხვადასხვა ლაქებს, როგორიცაა ანიონური საღებავები (coomassie brilliant blue), ლითონის კათიონები (იმიდაზოლ-თუთია), ვერცხლის შეღებვა და ფლუორესცენტური საღებავები და ა.შ. ზოგჯერ რადიოაქტიური ზონდების გამოყენებაც შეიძლება.შეღებვის ტექნიკის არჩევანი დამოკიდებულია ლაბორატორიაში გამოსახულების აღჭურვილობის სიმარტივეს, ხელმისაწვდომობაზე და ა.შ.
რა არის Coomassie შეღებვა?
Coomassie შეღებვა არის ცილის შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს coomassie ბრწყინვალე ცისფერ ლაქას. მას ზოგადად უწოდებენ coomassie blue ტექნიკას. Coomassie brilliant blue არის ყველაზე პოპულარული ანიონური ცილოვანი საღებავი. ეს ლაქა ჩვეულებრივ ღებავს თითქმის ყველა ცილას კარგი რაოდენობრივი წრფივობით საშუალო მგრძნობელობის დროს. Coomassie ბრწყინვალე ლურჯი ლაქა არასპეციფიკურად უკავშირდება თითქმის ყველა ცილას. არსებობს coomassie ბრწყინვალე ლურჯი ლაქის ორი განსხვავებული ვარიანტი: R-250 და G-250. R-250 გთავაზობთ უფრო მოკლე შეღებვის დროს, ხოლო G-250 ხელმისაწვდომია უფრო მგრძნობიარე და ეკოლოგიურად სუფთა ფორმულირებებით.
სურათი 01: Coomassie შეღებვა
Coomassie საღებავები ძალიან პოპულარულია მასის სპექტრომეტრიულ კვლევებში და ცილების იდენტიფიკაციის კვლევებში. უფრო მეტიც, bio-safe coomassie stain არის coomassie blue G-250-ის არასაშიში ფორმულირება, რომელიც ამჟამად ხელმისაწვდომია ბაზარზე. ამ ფორმულირების უპირატესობა ის არის, რომ მას მხოლოდ წყალი სჭირდება გამრეცხვისა და გასაწმენდად. Bio-safe coomassie stain გთავაზობთ მგრძნობელობას, რომელიც ექვივალენტურია ჩვეულებრივი coomassie ლურჯი G-250-ისა, მაგრამ უკეთესია ვიდრე coomassie stain R-250. გარდა ამისა, მას აქვს უფრო მარტივი და სწრაფი შეღებვის პროტოკოლი, ვიდრე ჩვეულებრივი Coomassie blue G-250. Coomassie ლურჯი შეღებვის ნაკლი ის არის, რომ ის ნაკლებად მგრძნობიარეა ვერცხლის შეღებვასთან შედარებით. Coomassie ლურჯი შეღებვა დაახლოებით 50-ჯერ ნაკლებად მგრძნობიარეა, ვიდრე ვერცხლის შეღებვა. თუმცა, შეკვრის სიმარტივის გამო, მას უპირატესობას ანიჭებენ ბევრ კვლევაში.
რა არის ვერცხლის შეღებვა?
ვერცხლის შეღებვა არის ცილოვანი შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს ვერცხლის შეღებვას.ვერცხლის შეღებვა გამოიყენება როგორც აგაროზის, ასევე პოლიაკრილამიდის გელების შესაღებად. ცილის ვერცხლის შეღებვა აგაროზას გელებში პირველად განვითარდა 1973 წელს კერენიისა და გალიას მიერ. მოგვიანებით, იგი ადაპტირებული იყო პოლიაკრილამიდის გელების ცილებისთვის, რომლებიც გამოიყენება SDS-PAGE-ში. ამჟამად, ვერცხლის შეღებვა ასევე გამოიყენება დნმ-ის ან რნმ-ის შესაღებად. გელების შეღებვის მიზნით, ამ მეთოდით გელები ინკუბირებულია ვერცხლის ნიტრატის ხსნარით. ვერცხლისფერი შეღებვა აფერხებს იმ ადგილებს, სადაც ცილები არის ყავისფერიდან შავამდე.
სურათი 02: ვერცხლის შეღებვა
ვერცხლის შეღებვის ინტენსივობა დამოკიდებულია ცილის პირველად სტრუქტურაზე. უფრო მეტიც, გამოყენებული ჭურჭლის სისუფთავე და რეაგენტების სისუფთავე ასევე შეიძლება გავლენა იქონიოს ვერცხლის შეღებვის ხარისხზე.თუმცა, ვერცხლის შეღებვის ნაკლი ის არის, რომ მას არ შეუძლია აღმოაჩინოს ყველა ცილა, განსაკუთრებით გლიკოპროტეინები და პროტეინები დიდი მოდიფიცირებული ჯგუფებით, რომლებიც მიმაგრებულია მათ გვერდით ჯაჭვებზე.
რა მსგავსებაა Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის?
- Coomassie და ვერცხლის შეღებვა არის ორი ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ცილის შეღებვისას.
- მათ შეუძლიათ შეღებონ როგორც ცილები, ასევე დნმ.
- შეღებვის ორივე ტექნიკას აქვს ნაკლი.
- ამ ტექნიკას აქვს მსგავსი საფეხურები, როგორიცაა დამაგრება, შეღებვა და შეღებვა.
რა განსხვავებაა Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის?
Coomassie შეღებვა არის ცილოვანი შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს coomassie ბრწყინვალე ლურჯ ლაქას, ხოლო ნაჭრის შეღებვა არის ცილის შეღებვის ტექნიკა, რომელიც იყენებს ვერცხლის შეღებვას. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის. გარდა ამისა, Coomassie შეღებვა ნაკლებად მგრძნობიარეა, ვიდრე ვერცხლის შეღებვა.
ქვემოთ მოცემულ ინფოგრაფიკაში ჩამოთვლილია განსხვავებები Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
რეზიუმე – Coomassie vs Silver Staining
პროტეინების ვიზუალიზაციისთვის შეიძლება ჩატარდეს პროტეინის სპეციფიკური საღებავების შემაკავშირებელი ან ფერის გამომწვევი ქიმიური რეაქცია. ამას ეწოდება ცილის შეღებვა. Coomassie და ვერცხლის შეღებვა არის ორი ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ცილის შეღებვაში. Coomassie შეღებვის ტექნიკა იყენებს coomassie ბრწყინვალე ლურჯ ლაქას, ხოლო ნაჭრის შეღებვა იყენებს ვერცხლის ლაქას. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება Coomassie-სა და ვერცხლის შეღებვას შორის.
