ძირითადი სხვაობა – ზემო დინების წინააღმდეგ დნმ-ის ქვემოთ
მნიშვნელოვანია გქონდეთ ზოგადი ცოდნა დნმ-ის შემადგენლობისა და სტრუქტურის შესახებ, რათა გავიგოთ განსხვავება დნმ-ს ზემოთ და ქვედა დინებას შორის. დნმ შედგება პოლინუკლეოტიდური ჯაჭვებისაგან. ნუკლეოტიდები არის სამშენებლო ბლოკები, რომლებიც ქმნიან პოლინუკლეოტიდურ ჯაჭვებს და თითოეული ნუკლეოტიდი მზადდება სამი კომპონენტისგან: ხუთნახშირბადოვანი შაქრისგან, აზოტოვანი ფუძისა და ფოსფატის ჯგუფისგან. ფოსფატის ჯგუფი და OH ჯგუფი მიმაგრებულია ნუკლეოტიდში შაქრის მოლეკულის 5' პოზიციის ნახშირბადთან და 3' პოზიციის ნახშირბადთან, შესაბამისად. ნუკლეოტიდები გაერთიანებულია ფოსფოდიესტერული ბმებით, რომლებიც წარმოიქმნება ერთი ნუკლეოტიდის 5' ფოსფატულ ჯგუფსა და მიმდებარე ნუკლეოტიდის 3' OH ჯგუფს შორის.თუ პოლინუკლეოტიდურ ჯაჭვს აქვს თავისუფალი 5' ფოსფატური ჯგუფი, მას ენიჭება 5' ბოლო; თუ მას აქვს თავისუფალი 3' OH ჯგუფი, მას ენიჭება 3' ბოლო. მაშასადამე, დნმ-ის ჯაჭვებს ჩვეულებრივ აქვთ 5' და 3' ბოლოები პოლინუკლეოტიდური ჯაჭვების ბოლო პოზიციების მიხედვით. დნმ ასევე არსებობს ორჯაჭვიანი ფორმით. ორი ძაფი ერთმანეთის ანტიპარალელურია. მაშასადამე, დნმ-ს აქვს ორი ჯაჭვი, რომელიც მიემართება 5'-დან 3'-მდე და 3'-დან 5-მდე მიმართულებით. ზემოთ და ქვედა დინების დნმ მოიხსენიება 5'-დან 3'-მდე mRNA ჯაჭვის ტრანსკრიფციასა და სინთეზზე მითითებით. თუ დნმ განიხილება კოდირების ჯაჭვის მე-5 ბოლოსკენ, ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან, იგი ცნობილია როგორც ზემოთ დნმ. თუ დნმ განიხილება ტრანსკრიპციის დაწყების ადგილიდან კოდირებული ჯაჭვის მე-3 დასასრულისკენ, ცნობილია, როგორც ქვედა დინების დნმ. ეს არის მთავარი განსხვავება ზედა და ქვედა დინების დნმ-ს შორის.
რა არის ზემოთ დნმ?
გენი არის სტრუქტურული და ფუნქციური ერთეული მემკვიდრეობა, რომელიც განლაგებულია ორგანიზმის დნმ-ზე.იგი ინახება ცილის აგების ინსტრუქციებით. გენს აქვს დნმ-ის მოლეკულის სპეციფიკური რეგიონი. საჭიროების შემთხვევაში, ის ტრანსკრიბირებულია და ითარგმნება ცილად mRNA ჯაჭვის სინთეზის გზით. ჩვეულებრივ, გენის კოდირების ჯაჭვი გადის 5-დან 3-მდე მიმართულებით. როდესაც ის ტრანსკრიბირებულია, ის წარმოქმნის mRNA ჯაჭვს იმავე მიმართულებით 5'-დან 3'-მდე. ტრანსკრიფციის დროს, 3'-დან 5' ანტისენსიურ ძაფს ემსახურება შაბლონის ჯაჭვი და იწყებს mRNA სინთეზს. გენში არის ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილი. ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილის მითითებით, დნმ-ის რეგიონი კოდირების ჯაჭვის 5' ბოლოში ცნობილია როგორც ზემოთ დნმ. გენის პრომოტორი ჩვეულებრივ მდებარეობს დნმ-ის ზედა დინებაში. ევკარიოტულ გენებში არის TATA ყუთები, პრომოტორული პროქსიმალური ელემენტები და გამაძლიერებლები გენის ზემოთ მიდამოში. გენის ზემოთ მდებარე რეგიონი მოხსენიებულია უარყოფითი რიცხვებით. გენის ზემოთ დნმ-ს უდიდესი მნიშვნელობა აქვს ტრანსკრიფციისთვის.
რა არის ქვედა დინების დნმ?
ტრანსკრიპციის დაწყების ადგილი ცნობილია როგორც გენის +1 წერტილი. დნმ-ის რეგიონი +1 წერტილიდან კოდირების ჯაჭვის 3' ბოლომდე ცნობილია როგორც ქვედა დინების დნმ. სხვა სიტყვებით რომ ვთქვათ, გენის ქვედა დინება არის ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან შაბლონის ჯაჭვის 5' ბოლომდე. მაშასადამე, გენის რეგიონის ქვედა დნმ მოიცავს ტრანსკრიპციულ ერთეულს და სხვა თანმიმდევრობებს, როგორიცაა ტერმინატორის თანმიმდევრობა. პრომოტორს შეუძლია გავლენა მოახდინოს გენის ქვედა მიმდევრობაზე. გენის ქვედა ნაწილი მოხსენიებულია დადებითი რიცხვებით. გენის ქვედა დნმ არის ფაქტობრივი რეგიონი, რომელიც იძლევა ცილოვან პროდუქტს.
სურათი 01: ზემოთ და ქვემოთ დნმ
რა განსხვავებაა ზედა და ქვედა დინების დნმ-ს შორის?
ზედა დინების წინააღმდეგ დნმ-ის დაბლა |
|
| დნმ-ის რეგიონი კოდირების მიმდევრობის 5' ბოლოსკენ ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან ცნობილია როგორც ზემოთ დნმ. | დნმ-ის რეგიონი კოდირების ჯაჭვის მე-3 დასასრულისკენ ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან ცნობილია, როგორც ქვედა დინების დნმ. |
| ელემენტები | |
| პრომოტერები და გამაძლიერებლები განლაგებულია ზემოთ დნმ-ზე | ტრანსკრიფციის ერთეული და ტერმინატორის თანმიმდევრობები განლაგებულია ქვედა დნმ-ში. |
| ნუმერაცია | |
| ნუკლეოტიდები ზედა დინების რეგიონში მოხსენიებულია უარყოფითი რიცხვებით | ნუკლეოტიდები მოხსენიებულია დადებითი რიცხვებით. |
| ფუნქცია | |
| ეს რეგიონი შეიცავს ელემენტებს, რომლებიც აუცილებელია ტრანსკრიფციის დასარეგულირებლად და დასაწყებად | ეს რეგიონი შეიცავს ინსტრუქციას ცილის წარმოქმნისა და ტრანსკრიპციის შეწყვეტის შესახებ |
შეჯამება – ზემოთ დინებაში vs დნმ-ის ქვედა დინება
ადვილია იდენტიფიცირება რნმ-ის ჯაჭვის ზემოთ და ქვემოთ. რაც შეეხება საცნობარო ადგილს, რნმ-ის ჯაჭვის მე-5' ბოლოსკენ მიმავალი რეგიონი ცნობილია როგორც ზემოთ რნმ, ხოლო 3' ბოლოსკენ მიმავალი რეგიონი ცნობილია როგორც ქვედა დინების რნმ. თუმცა, დნმ-ში არის ორი ჯაჭვი, რომელიც გადის ორივე მიმართულებით 5'-დან 3'-მდე და 3'-დან 5-მდე. აქედან გამომდინარე, განსხვავება დნმ-ს ზემოთ და ქვედა დინებას შორის გართულებულია. ამიტომ, იგი დიფერენცირებულია გენის ტრანსკრიფციის მიხედვით. ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან გრძნობათა ჯაჭვის მე-5 ბოლომდე, დნმ-ის რეგიონი ცნობილია როგორც ზემოთ დნმ, ხოლო ტრანსკრიფციის დაწყების ადგილიდან გრძნობის ჯაჭვის მე-3 ბოლომდე ცნობილია როგორც ქვედა დინების დნმ.ეს არის განსხვავება დნმ-ის ზემოთ და ქვედა დინებას შორის.
