ძირითადი განსხვავება – გელის ელექტროფორეზი vs SDS გვერდი
გელის ელექტროფორეზი არის ტექნიკა, რომელიც გამოყოფს მაკრომოლეკულებს ელექტრულ ველში. მოლეკულურ ბიოლოგიაში გავრცელებული მეთოდია დნმ-ის, რნმ-ისა და ცილების გამოყოფა ნარევებიდან მათი მოლეკულური ზომის მიხედვით. SDS გვერდი არის გელის ელექტროფორეზის ტიპი, რომელიც გამოიყენება ცილების გამოყოფისთვის ცილოვანი ნარევიდან მათი ზომის მიხედვით. გელის ელექტროფორეზი არის ტერმინი, რომელიც გამოიყენება დნმ-ის, რნმ-ის და ცილების განცალკევებისთვის გამოყენებული ნორმალური ტექნიკისთვის, ხოლო SDS Page არის გელის ელექტროფორეზის ერთი ტიპი. ეს არის მთავარი განსხვავება გელის ელექტროფორეზსა და SDS გვერდს შორის.
რა არის გელის ელექტროფორეზი?
გელის ელექტროფორეზი არის გავრცელებული ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ლაბორატორიებში დამუხტული მოლეკულების გამოყოფისთვის, როგორიცაა დნმ, რნმ, ცილები და ა.შ. მათი ნარევებიდან. გელი გამოიყენება გელის ელექტროფორეზის დროს. ის მოქმედებს როგორც მოლეკულური საცერი. გელის ელექტროფორეზის დროს გამოიყენება გელის ორი ტიპი, კერძოდ, აგაროზა და პოლიაკრილამიდი. გელისა და გელის მომზადების შერჩევა მნიშვნელოვანი ფაქტორებია, რომლებიც გასათვალისწინებელია გელის ელექტროფორეზის დროს, ვინაიდან გელის ფორების ზომა ფრთხილად უნდა იყოს მანიპულირებული გელის ელექტროფორეზის საშუალებით მოლეკულების კარგი განცალკევების მიზნით. გელის ელექტროფორეზს აქვს ელექტრული ველი, რომელიც დაკავშირებულია გელის ორ ბოლოსთან. გელის ერთი ბოლო აჩვენებს დადებით მუხტს, მეორე ბოლო კი უარყოფითად.
დნმ და რნმ უარყოფითად დამუხტული მოლეკულებია. მას შემდეგ, რაც ისინი გელის ნეგატიური ბოლოდან გელში ჩაიტვირთება და ელექტრულ ველზე ვრცელდება, ისინი მიგრირებენ გელის ფორების მეშვეობით გელის დადებითად დამუხტული ბოლოებისკენ.მიგრაციის სიჩქარე დამოკიდებულია მოლეკულის მუხტზე და ზომაზე. უფრო მცირე მოლეკულები ადვილად გადადიან გელის ფორებში, ვიდრე უფრო დიდი მოლეკულები. აქედან გამომდინარე, პატარა მოლეკულები დიდ მანძილზე მოგზაურობენ გელის მეშვეობით, ხოლო დიდი მოლეკულები მცირე მანძილზე. გელზე მოლეკულების მოძრაობის დასაკვირვებლად გამოიყენება სპეციალური ტიპის საღებავები. ელექტრული ველი გამოიყენება გარკვეული პერიოდის განმავლობაში და შეჩერებულია მოლეკულების დაკარგვის თავიდან ასაცილებლად და მოლეკულების გადაადგილებულ პოზიციებზე შესანარჩუნებლად. გელში შეიძლება შეინიშნოს სხვადასხვა ზოლები. ეს ზოლები წარმოადგენს სხვადასხვა ზომის მოლეკულებს. ამრიგად, გელის ელექტროფორეზი სასარგებლოა მოლეკულების მათი ზომის მიხედვით დიფერენცირებისთვის.
გელის ელექტროფორეზი ჩართულია სხვადასხვა ტექნიკაში, როგორც მოსამზადებელი ტექნიკა მოლეკულურ ბიოლოგიაში, როგორიცაა PCR, RFLP, კლონირება, დნმ-ის თანმიმდევრობა, სამხრეთის ბლოტი, გენომის რუკა და ა.შ.
სურათი 01: აგაროზის გელის ელექტროფორეზი
რა არის SDS გვერდი?
ნატრიუმის დოდეცილსულფატის პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი (SDS Page) არის გელის ელექტროფორეზის ტიპი, რომელიც გამოიყენება ცილების გამოყოფისთვის. როდესაც გელის ელექტროფორეზი გამოიყენება ცილების განცალკევებისთვის, საჭიროა სპეციალური მკურნალობა, რადგან ცილები არ არის უარყოფითად დამუხტული, როგორც დნმ და რნმ და არ მიგრირებენ პოზიტიურ ან უარყოფით დასასრულისკენ. ამრიგად, ცილები დენატურირებულია და დაფარულია უარყოფითი მუხტით გელის ელექტროფორეზის წინ. იგი კეთდება სარეცხი საშუალებით, რომელსაც ეწოდება ნატრიუმის დოდეცილ სულფატი (SDS). გელის ელექტროფორეზი, რომელიც იყენებს SDS-ს და პოლიაკრილამიდის გელს დამხმარე გარემოსთვის, ცნობილია როგორც SDS Page. ეს ტექნიკა ჩვეულებრივ გამოიყენება ბიოქიმიაში, გენეტიკაში, სასამართლო მეცნიერებაში და მოლეკულურ ბიოლოგიაში.
სდს გვერდის დროს პროტეინები შერეულია SDS-თან. SDS აყალიბებს ცილებს ხაზოვან ფორმაში და ფარავს მათ უარყოფითი მუხტით, რომელიც პროპორციულია მათი მოლეკულური მასის.უარყოფითი მუხტის გამო, ცილის მოლეკულები მიგრირებენ გელის დადებითი მუხტის ბოლოსკენ და გამოიყოფა მათი მოლეკულური მასის მიხედვით. SDS Page-ში პოლიაკრილამიდი გამოიყენება გელის მყარ საყრდენად. ცილების რეალური გამოყოფა ძირითადად დამოკიდებულია გელის თვისებებზე. ამიტომ, პოლიაკრილამიდის გელის მომზადება ფრთხილად უნდა იყოს და გამოყენებული იქნას პოლიაკრილამიდის სწორი კონცენტრაცია. პოლიაკრილამიდის გელები აჩვენებენ მაღალ გარჩევადობას, ვიდრე აგაროზის გელები. აქედან გამომდინარე, SDS გვერდი განიხილება ცილების გამოყოფის მაღალი გარჩევადობის ტექნიკად.
SDS გვერდი არის დენატურული გელის ელექტროფორეზის ტიპი. მას აქვს ძირითადი შეზღუდვა ცილების ანალიზში. ვინაიდან SDS ახდენს ცილების დენატურაციას გამოყოფამდე, ის არ იძლევა ფერმენტული აქტივობის, ცილებთან შეკავშირების ურთიერთქმედების, ცილოვანი კოფაქტორების და ა.შ. გამოვლენის საშუალებას.
სურათი 02: SDS გვერდი
რა განსხვავებაა გელის ელექტროფორეზისა და SDS გვერდის შორის?
გელის ელექტროფორეზი vs SDS გვერდი |
|
| გელის ელექტროფორეზი არის მაკრომოლეკულების გამოყოფის მეთოდი ელექტრული ველის გამოყენებით. | SDS გვერდი არის მაღალი გარჩევადობის გელის ელექტროფორეზის ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ცილების გამოყოფისთვის მათი მასის მიხედვით. |
| ლარი რუნ | |
| შეიძლება შესრულდეს ჰორიზონტალურად ან ვერტიკალურად. | SDS გვერდი ყოველთვის მუშაობს ვერტიკალურად. |
| განშორების საფუძველი | |
| გამოყოფა ხდება დამუხტვისა და ზომის მიხედვით. | პროტეინის გამოყოფა ხდება მასისა და მუხტის მიხედვით. |
| რეზოლუცია | |
| აგაროზას გელის ელექტროფორეზი აქვს დაბალი გარჩევადობის და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი უფრო მაღალი გარჩევადობის | SDS გვერდს აქვს უკეთესი გარჩევადობა. |
| დენატურაცია | |
| გელის ელექტროფორეზი მოიცავს როგორც დენატურირების, ისე არადენატურაციის ტექნიკას. | SDS გვერდი ახდენს ცილების დენატურაციას გამოყოფამდე. |
რეზიუმე – გელის ელექტროფორეზი vs SDS გვერდი
გელის ელექტროფორეზი არის გავრცელებული ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება დნმ-ის, რნმ-ის და ცილების გამოყოფისა და ანალიზისთვის მათი ზომისა და მუხტის მიხედვით. გელის ელექტროფორეზის ორი ძირითადი ტიპი არსებობს, კერძოდ, აგაროზის გელის ელექტროფორეზი და პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი. აგაროზის გელები ძირითადად გამოიყენება ნუკლეინის მჟავების გამოყოფისთვის; როდესაც საჭიროა უფრო მაღალი გარჩევადობა, გამოიყენება პოლიაკრილამიდის გელები. SDS Page არის გელის ელექტროფორეზის ტიპი, რომელიც ჩვეულებრივ გამოიყენება ცილების რთული ნარევების გამოსაყოფად. იგი განიხილება, როგორც მაღალი რეზოლუციის ცილების გამოყოფის ტექნიკა. ეს არის განსხვავება გელის ელექტროფორეზისა და SDS გვერდის შორის.
