ძირითადი განსხვავება – დასაწყობი გელი და გამყოფი ლარი
ტერმინები დაწყობის გელი და გამყოფი გელი გამოიყენება SDS-PAGE ტექნიკის ასახსნელად. SDS-PAGE ან ნატრიუმის დოდეცილის სულფატ-პოლიაკრილამიდის გელის ელექტროფორეზი არის ლაბორატორიული ტექნიკა, რომელიც გამოიყენება ცილის მოლეკულების გამოყოფისთვის მათი მოლეკულური წონის მიხედვით. ტექნიკის მიღმა არსებული თეორია არის ის, რომ სხვადასხვა მოლეკულური წონის ცილები აჩვენებენ სხვადასხვა მიგრაციის სიჩქარეს; დაბალი მოლეკულური წონის მოლეკულები უფრო სწრაფად მიგრირებენ, ხოლო მაღალი მოლეკულური მოლეკულები ნელა. მიგრაციის საშუალება არის ლარი. არსებობს ორი სახის გელის დასახელება, როგორც დასაწყობი და გამყოფი ლარი.მთავარი განსხვავება დასაწყობ გელსა და გამყოფ გეელს შორის არის ის, რომ დასაწყობი გელის pH არის 6.8, ხოლო გამყოფი გელის pH არის 8.8.
რა არის დასაწყობი გელი?
დაწყობის გელი არის დაბალი კონცენტრირებული პოლიაკრილამიდის გელი, რომელიც მოთავსებულია უფრო კონცენტრირებული გამხსნელი გელის (გამყოფი გელის) თავზე SDS-PAGE ტექნიკით. დაწყობის გელი გამოიყენება ელექტროფორეზის გარჩევადობის გასაუმჯობესებლად. გარჩევადობა იზრდება დასაწყობი გელისა და გამხსნელი გელის კონცენტრაციებს შორის განსხვავების გამო, რაც გავლენას ახდენს ნიმუშის ცილებზე. ვინაიდან პოლიაკრილამიდის კონცენტრაცია დასაწყობ გელში დაბალია, ფორების ზომა უფრო მაღალია. ეს ასევე ხელს უწყობს განშორების გაზრდას.
დაწყობის გელი არის ფხვიერი პოლიაკრილამიდის გელი დიდი ფორებით, დაახლოებით 7% პოლიაკრილამიდით. ეს ფორები არ მოქმედებენ როგორც მნიშვნელოვანი ბარიერი დიდი ცილის მოლეკულებისთვის. ამიტომ ეს გელი ოდნავ მოქმედებს ამ ცილების მობილურობაზე. ეს ხდის გამოყოფას ცილების მობილურობისა და ზომის მიხედვით, მათი კონცენტრაციით ორ გელს შორის.
სურათი 01: SDS-PAGE აკრილამიდის გელი
დაწყობის გელის pH არის 6.8. მისი pH მჟავეა, ვიდრე გელი 2 pH ერთეულით. ეს pH გულისხმობს დაბალ იონურ სიძლიერეს, შესაბამისად უფრო მაღალ ელექტრულ წინააღმდეგობას. ეს პროვოცირებს ცილების მობილურობას, ვიდრე გელში არსებული სხვა დამუხტული ნაწილაკები.
რა არის გამყოფი გელი?
გამყოფი გელი ან SDS-PAGEტექნიკის გამხსნელი გელი არის მაღალკონცენტრირებული პოლიაკრილამიდის გელი, რომელიც მოთავსებულია დაბალი კონცენტრაციის დასაწყობი გელის თავზე. გამყოფი გელი შეიცავს დიდი რაოდენობით პოლიაკრილამიდს (10%). ამ გელის pH შენარჩუნებულია როგორც pH=8.8, რაც უფრო მაღალია pH-ის დონესთან შედარებით დაწყობილი გელის.
სურათი 02: გელის ელექტროფორეზის აპარატი
როდესაც ცილის მოლეკულები მიაღწევენ გამყოფ გელს, ამ მოლეკულების მიგრაცია შენელდება, რადგან გამყოფი გელი არის მაღალი კონცენტრაციის გელი მცირე ფორების ზომით, რომელსაც შეუძლია მნიშვნელოვანი ბარიერი იყოს ცილის მოლეკულების გადაადგილებისთვის.. ეს შენელება საშუალებას აძლევს სხვა პროტეინებს ნელა მიგრირონ, რათა დაეწიონ, რის შედეგადაც წარმოიქმნება ვიწრო, კონცენტრირებული ზოლი ორ გელს შორის.
რა კავშირია გელის დაწყობასა და გელის გაყოფას შორის?
დაწყობის გელის და გამყოფი გელის ტიპები გამოიყენება ერთსა და იმავე აპარატში
რა განსხვავებაა გელის დაწყობასა და გამყოფ გეელს შორის?
დაწყობის გელი vs გამყოფი გელი |
|
| დაწყობის გელი არის დაბალი კონცენტრირებული პოლიაკრილამიდის გელი, რომელიც მოთავსებულია უფრო კონცენტრირებული გამხსნელი გელის (გამყოფი გელის) თავზე SDS-PAGE ტექნიკით. | გამყოფი გელი ან გამხსნელი გელი SDS-PAGE ტექნიკით არის უაღრესად კონცენტრირებული პოლიაკრილამიდური გელი, რომელიც მოთავსებულია დაბალი კონცენტრირებული დაწყობის გელის თავზე. |
| განთავსება | |
| დაწყობის გელი თავსდება გამხსნელ (გამყოფ) გელზე. | გამყოფი გელი მოთავსებულია გელის ელექტროფორეზისთვის გამოყენებული კონტეინერის ძირზე. |
| კონცენტრაცია | |
| დაწყობის გელის კონცენტრაცია მაღალია. | გამყოფი გელის კონცენტრაცია დაბალია. |
| პოლიაკრილამიდის შემცველობა | |
| დაწყობის გელი შეიცავს დაახლოებით 7% პოლიაკრილამიდს. | გამყოფი გელი შეიცავს დაახლოებით 10% პოლიაკრილამიდს. |
| pH | |
| დაწყობის გელის pH არის 6.8. | გამყოფი გელის pH არის 8.8. |
| ფორების ზომა | |
| დიდი ფორების ზომები წარმოდგენილია დასაწყობ გელში. | პატარა ფორების ზომები წარმოდგენილია გამყოფ გელში. |
| რეზოლუცია | |
| დაწყობის გელი იძლევა უკეთეს გარჩევადობას. | გამყოფი გელი იძლევა ცუდ გარჩევადობას. |
რეზიუმე – დასაწყობი გელის წინააღმდეგ გამყოფი ლარი
დაწყობის გელი და გამყოფი გელი არის ორი ტიპის პოლიაკრილამიდის გელები, რომლებიც გამოიყენება მოცემულ ნიმუშში ცილის მოლეკულების უკეთესად გამოყოფისთვის.დაწყობის გეელსა და გამყოფ გეელს შორის განსხვავება ისაა, რომ დასაწყობი გელის pH არის 6.8, ხოლო გამყოფი გელის pH არის 8.8.
