კონსერვირებული და კონსენსუსის თანმიმდევრობას შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ შენახული თანმიმდევრობა ეხება ნუკლეინის მჟავების ან ამინომჟავების მსგავს თანმიმდევრობებს, რომლებიც გვხვდება სხვადასხვა ან ერთსა და იმავე სახეობებში თაობების განმავლობაში, ხოლო კონსენსუსის თანმიმდევრობა არის ჩვეულებრივ ნაცნობი ნუკლეოტიდების თანმიმდევრობა ან ნაპოვნი ამინომჟავების თანმიმდევრობა. დნმ-ის ან რნმ-ის ან პროტეინის უაღრესად დაკონსერვებულ რეგიონში.
ორგანიზმებს აქვთ მსგავსი და განსხვავებული მახასიათებლები. ორგანიზმებს შორის ურთიერთობის შესწავლისას და მათი კლასიფიკაციისას ძალიან მნიშვნელოვანია ორგანიზმების გენომი ან გენეტიკური შემადგენლობა. არსებობს რამდენიმე ნუკლეოტიდური ან ამინომჟავის თანმიმდევრობა, რომლებიც საერთოა სხვადასხვა ორგანიზმებს შორის.შენახული თანმიმდევრობა არის ნუკლეინის მჟავა ან ამინომჟავის თანმიმდევრობა, რომელიც შეესაბამება სახეობებს შორის. ამიტომ, ისინი ფილოგენეტიკურად მნიშვნელოვანია ფილოგენეტიკური ხეების წარმოქმნისას. შენახულ თანმიმდევრობებში არის სპეციფიკური ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობები, რომლებიც უფრო ხშირად გვხვდება. ისინი ცნობილია როგორც კონსენსუსის თანმიმდევრობა.
რა არის შენახული თანმიმდევრობა?
კონსერვირებული თანმიმდევრობა არის ნუკლეინის მჟავების თანმიმდევრობა ან ამინომჟავების თანმიმდევრობა, რომელიც მსგავსია სახეობებს შორის. ამიტომ, ის თანმიმდევრულია ყველა სახეობაში ევოლუციის განმავლობაში. ზოგადად, ეს თანმიმდევრობები შენარჩუნებულია ბუნებრივი გადარჩევით. ისინი უცვლელი რჩება ფილოგენეტიკური ხის უკან. აქედან გამომდინარე, შენახული თანმიმდევრობები მნიშვნელოვანია ფილოგენეტიკური ხეების მშენებლობაში. ითვლება, რომ უაღრესად დაკონსერვებულ მიმდევრობებს ხშირად აქვთ მნიშვნელოვანი ფუნქციონალური მნიშვნელობა. ისინი სასარგებლოა გენეტიკური დაავადებების იდენტიფიცირებისთვისაც. თუმცა, შენახული თანმიმდევრობები შეიძლება იყოს კოდირების ან არაკოდირების ნუკლეინის მჟავების თანმიმდევრობები. გარდა ამისა, შენახული თანმიმდევრობები აჩვენებენ მუტაციის უფრო ნელ ტემპებს.აქედან გამომდინარე, ისინი აჩვენებენ ძალიან მინიმალურ ცვლილებებს მათ შემადგენლობაში; ზოგჯერ ისინი არ აჩვენებენ ცვლილებებს მთელი თაობის განმავლობაში.
სურათი 01: შენახული თანმიმდევრობა
რიბოსომების რნმ-ის კომპონენტები წარმოდგენილია სიცოცხლის ყველა დომენში, ჰომეობოქსების თანმიმდევრობები ევკარიოტებში და tmRNA ბაქტერიებში არის უაღრესად კონსერვირებული თანმიმდევრობის რამდენიმე მაგალითი. შენახული მიმდევრობების იდენტიფიცირება მარტივია, როდესაც გამოიყენება ბიოინფორმატიკის მიდგომები, განსაკუთრებით თანმიმდევრობის გასწორების ინსტრუმენტი. გარდა ამისა, მრავალი მიმდევრობის გასწორება ხელს უწყობს შენახული თანმიმდევრობების ვიზუალიზაციას.
რა არის კონსენსუსის თანმიმდევრობა?
კონსენსუსის თანმიმდევრობა არის თანმიმდევრობა, რომელიც ჩვეულებრივ გვხვდება დნმ-ის ან რნმ-ის მოცემულ კონსერვაციულ რეგიონში. ეს არის ძალიან სპეციფიკური ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობა.მაგალითად, არის კონსენსუსის თანმიმდევრობა -10-ზე, როგორც TATAAT (Pribnow box) E. coli პრომოტორებში, რომლებიც უაღრესად შენახული თანმიმდევრობებია. ანალოგიურად, არსებობს კიდევ ერთი კონსენსუსის თანმიმდევრობა: TTGACA E. coli პრომოტორებში -35-ზეც. კონსენსუსის თანმიმდევრობები ასევე ცნობილია როგორც "ყუთები".
სურათი 02: კონსენსუსის თანმიმდევრობა
გარდა დნმ-ისა და რნმ-ისა, ცილებს ასევე აქვთ ამინომჟავების თანმიმდევრობა. ცილებთან შეკავშირების ადგილები ხშირად წარმოდგენილია კონსენსუსის თანმიმდევრობით. შეზღუდვის ფერმენტებს ასევე აქვთ კონსენსუსის თანმიმდევრობა. უფრო მეტიც, შერწყმის ადგილები ასევე კონსენსუსის თანმიმდევრობაა. შენახული თანმიმდევრობების მსგავსად, კონსენსუსის თანმიმდევრობები შეიძლება გამოითვალოს და ვიზუალურად გამოიყურებოდეს ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოებით.
რა მსგავსებაა შენახულ და კონსენსუსის მიმდევრობას შორის?
- კონსერვირებული და კონსენსუსის თანმიმდევრობები არის ნუკლეინის მჟავების ან ამინომჟავების თანმიმდევრობები, რომლებიც გავრცელებულია სახეობებში.
- კონსერვირებული და კონსენსუსის თანმიმდევრობების ვიზუალიზაცია შესაძლებელია ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოებით.
- ისინი ფართოდ გამოიყენება მოლეკულურ ბიოლოგიაში.
რა განსხვავებაა კონსერვაციასა და კონსენსუსს შორის?
კონსერვირებული თანმიმდევრობა არის ნუკლეინის მჟავა ან ამინომჟავის თანმიმდევრობა, რომელიც თანმიმდევრულია სახეობებს შორის, ხოლო კონსენსუსის თანმიმდევრობები არის ძალიან სპეციფიკური და ხშირად ნაპოვნი ფუძეები ან ამინომჟავები მოცემულ კონსერვაციულ რეგიონში. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება შენახულ და კონსენსუსის თანმიმდევრობას შორის. გარდა ამისა, კიდევ ერთი განსხვავება შენახულ და კონსენსუს თანმიმდევრობას შორის არის ის, რომ კონსერვირებული თანმიმდევრობები ფილოგენეტიკურად მნიშვნელოვანია, ხოლო კონსენსუსის თანმიმდევრობები ხშირად არის ცილებთან შეკავშირების ადგილები, შერწყმის ადგილები, შეზღუდვის ფერმენტების ჭრის ადგილები და ა.შ.
შეჯამება – შენახული და კონსენსუსის თანმიმდევრობა
კონსერვირებული თანმიმდევრობები არის ნუკლეინის მჟავების ან ცილების თანმიმდევრობები, რომლებიც მსგავსია ცოცხალ სახეობებს შორის. პრომოტორი, რიბოსომების დამაკავშირებელი ადგილი, რეპლიკაციის საწყისი და ჰისტონის ცილის ამინომჟავის თანმიმდევრობა არის შენახული თანმიმდევრობების რამდენიმე მაგალითი. ამის საპირისპიროდ, კონსენსუსის თანმიმდევრობები არის სპეციფიკური ფუძეები ან ამინომჟავები, რომლებიც უფრო ხშირად გვხვდება მოცემულ შენახულ თანმიმდევრობაში. -10 ყუთი, -35 E. coli პრომოტორის ყუთი, ცილებთან შეკავშირების ადგილები, შეჯვარების ადგილები და რესტრიქციული ფერმენტების ამომცნობი ადგილები კონსენსუსის თანმიმდევრობის რამდენიმე მაგალითია. ამრიგად, ეს არის განსხვავების შეჯამება კონსერვაციასა და კონსენსუსს შორის.
