სინტენიასა და კოლინარობას შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ სინტენია არის გენეტიკური ლოკების ფიზიკური თანალოკალიზაცია ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე სახეობებში, ხოლო კოლინარულობა არის გენეტიკური ადგილების ფიზიკური თანალოკალიზაცია იმავე ქრომოსომაზე სხვადასხვა სახეობებში, რომლებიც შენარჩუნებულია. იგივე ბრძანება.
Synteny და collinearity არის ორი ტერმინი, რომლებიც ურთიერთშემცვლელად გამოიყენება გენომიკაში. ორივე ტერმინი აღწერს გენის ლოკალიზაციის ნიმუშებს ქრომოსომებზე სხვადასხვა სახეობებში. ეს დაკავშირებული გენების მოწყობა ტაქსებს შორის არის ღირებული ინფორმაცია გენების საერთო წარმოშობის დასკვნებისას. სინტენია ეხება გენეტიკური ლოკების ფიზიკურ თანალოკალიზაციას იმავე ქრომოსომაზე სახეობებში.კოლინარულობა გულისხმობს გენეტიკური ლოკების ფიზიკურ თანალოკალიზაციას იმავე ქრომოსომაზე სხვადასხვა სახეობებში, რომლებიც ინარჩუნებენ იმავე წესრიგს. ამიტომ, ეს არის სინტენიის ფორმა.
რა არის Synteny?
სხვადასხვა სახეობებში არის გენების ნაკრები, რომელიც მდებარეობს იმავე ქრომოსომაზე. და გენების ეს ფიზიკური კოლოკალიზაცია ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე სხვადასხვა სახეობებში ცნობილია როგორც სინტენია. ასევე, ეს გენები ერთმანეთთან ძალიან ახლოს არის ერთ ქრომოსომაზე. გენების თანმიმდევრობა შეიძლება სულაც არ იყოს იგივე. მაგრამ გენების ლოკალიზაცია ერთმანეთთან ახლოს ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე ხდება სინტენიაში. ამიტომ სინტენია ძირითადად აღწერს გენების განაწილების ნიმუშს ქრომოსომაზე. გენის კოლოკალიზაციის ეს ნიმუშები მიუთითებს სხვადასხვა სახეობასა და მათ ევოლუციას შორის ურთიერთობაზე. თუმცა, სინტენია შეიძლება დაირღვეს ქრომოსომული გადაწყობების გამო, როგორიცაა ტრანსლოკაცია, ინვერსია და ქრომოსომების შერწყმა და ა.შ. დუბლირება, დაკარგვა და არათანაბარი ჰომოლოგიური რეკომბინაცია.
სურათი 01: Synteny
ითვლება, რომ ყველა დაკავშირებული გენი სინტენურია. თუმცა, ყველა სინტენური გენი აუცილებლად არ არის დაკავშირებული. მათ აქვთ საერთო ქრომოსომული თანმიმდევრობა. ადამიანებს აქვთ მრავალი სინტენური გენი სხვა ძუძუმწოვრებთან. გარდა ამისა, ბევრ მარცვლეულს აქვს სინტენური გენი.
რა არის კოლინარულობა?
კოლინარულობა არის სინტენიის უფრო სპეციფიკური ფორმა, რომელშიც გენების ნაკრები განლაგებულია სხვადასხვა სახეობის ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე იმავე თანმიმდევრობით, როგორც წინაპართა სახეობებში. მაშასადამე, თუ არსებობს გადახრა კოლინარობიდან, ეს უფრო საიმედო ფილოგენეტიკური ხასიათი იქნება, რადგან კოლინარულობა ხსნის გენების საერთო წარმომავლობას.
სურათი 02: კოლინარულობა
მრავალმხრივი კოლინარობის ანალიზი იძლევა ბევრად უფრო სანდო ინფორმაციას მონათესავე სახეობებზე და მათ ფილოგენეზზე.
რა მსგავსებაა Synteny-სა და Colinearity-ს შორის?
- როგორც სინტენიაში, ასევე კოლინარობაში, ლოკების ნაკრები ორ სხვადასხვა სახეობაში განლაგებულია ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე.
- ეს ტერმინები აღწერს გენეტიკური ლოკების ფიზიკურ თანალოკალიზაციას იმავე ქრომოსომაზე.
- კოლინარულობა სინტენიის უფრო სპეციფიკური ფორმაა.
- ზოგჯერ ორივე ტერმინი ურთიერთშემცვლელად გამოიყენება გენომიკაში.
- თუ ორ რეგიონს აქვს კოლინარულობა, ისინი აშკარად სინტენურია.
- ისინი სასარგებლოა ფილოგენიის დასკვნებისთვის.
რა განსხვავებაა Synteny-სა და Colinearity-ს შორის?
Synteny და collinearity არის ორი ტერმინი, რომლებიც ურთიერთშემცვლელად გამოიყენება გენომიკაში. სინტენია გულისხმობს გენების ნაკრების ფიზიკურ თანალოკალიზაციას იმავე ქრომოსომაში სხვადასხვა სახეობებში. კოლინარულობა არის სინტენიის ფორმა, რომელშიც გენების ნაკრები თანალოკალიზებულია იმავე თანმიმდევრობით სხვადასხვა სახეობებს შორის. ამიტომ, ეს არის მთავარი განსხვავება სინტენიასა და კოლინარობას შორის.
რეზიუმე – Synteny vs კოლინარულობა
ტერმინები synteny და collinearity ეხება გენების ერთობლიობას, რომლებიც განლაგებულია იმავე ქრომოსომაზე სხვადასხვა სახეობებში. სინამდვილეში, ეს გენები თანალოკალიზებულია იმავე ქრომოსომაში სხვადასხვა სახეობებში. სინტენია აღწერს კომპლექტის გენების ფიზიკურ თანალოკალიზაციას ერთსა და იმავე ქრომოსომაზე სხვადასხვა სახეობებში, ხოლო კოლინარულობა არის სინტენიის უფრო სპეციფიკური ფორმა, რომელშიც გენების ნაკრები თანალოკალიზებულია იმავე თანმიმდევრობით.ამრიგად, ეს აჯამებს განსხვავებას სინტენიასა და კოლინარობას შორის.
