CGH-სა და მასივის CGH-ს შორის მთავარი განსხვავებაა ის, რომ CGH არის ტრადიციული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად, რომელსაც აქვს დაბალი გარჩევადობა, ხოლო CGH მასივი არის სრულად ავტომატიზირებული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი. ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლის რაოდენობის ვარიაციის ანალიზი, რომელსაც აქვს უფრო მაღალი გარჩევადობა.
CGH და მასივის CGH არის ორი ტექნიკა ინდივიდებში ასლის რიცხვის ვარიაციების გამოსავლენად. ასლის რიცხვის ვარიაცია ეხება გენომის იმ მონაკვეთებს, რომლებიც მეორდება. ასლების რაოდენობა ინდივიდუალურად განსხვავდება. ასლის რიცხვის ვარიაცია ზოგადად იყოფა ორ ჯგუფად: მოკლე გამეორებები და გრძელი გამეორებები.მოკლე ასლის რიცხვის ვარიაციის ერთ-ერთი ყველაზე ცნობილი მაგალითია ჰანტინგტინის გენში CAG ტრინუკლეოტიდის გამეორება. ეს იწვევს ნევროლოგიურ აშლილობას, რომელსაც ჰანტინგტინს უწოდებენ. გრძელი გამეორებების ასლების რიცხვის ცვალებადობის საუკეთესო მაგალითია ალფა ამილაზას გენი, რომელიც იწვევს ინსულინის წინააღმდეგობას. ასლის რიცხვის ცვალებადობის აღმოჩენა შესაძლებელია ისეთი ტექნიკით, როგორიცაა FISH, CGH და მასივი CGH.
რა არის CGH?
CGH არის ტრადიციული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი საცდელი ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ვარიაციის გასაანალიზებლად საცნობარო ნიმუშთან შედარებით. მას აქვს უფრო დაბალი გარჩევადობა ავტომატურ ტექნიკასთან შედარებით. ამ ტექნიკის მიზანია სწრაფად და ეფექტურად შეადაროს ორი გენომიური დნმ-ის ნიმუში, რომლებიც წარმოიქმნება სხვადასხვა წყაროდან.
სურათი 01: CGH
პროცედურა მოიცავს დნმ-ის გამოყოფას ორი წყაროდან: ტესტიდან და მითითებით. შემდეგ შემდეგი ნაბიჯი არის ტესტი და საცნობარო დნმ-ის ნიმუშების დამოუკიდებელი მარკირება სხვადასხვა ფერის ფტორფორებით. მოგვიანებით, დნმ-ის ორი ნიმუში დენატურირებული იყო, რათა მიეღოთ ერთჯაჭვიანი დნმ-ის ნიმუშები. დაბოლოს, განხორციელდა ორი შედეგიანი დნმ-ის ნიმუშის ჰიბრიდიზაცია 1:1 თანაფარდობით ქრომოსომების ნორმალური მეტაფაზის გავრცელებასთან. ქრომოსომული განსხვავებების იდენტიფიცირება შესაძლებელია ორ წყაროს შორის ფლუორესცენტული მიკროსკოპისა და კომპიუტერული პროგრამული უზრუნველყოფის გამოყენებით. გარდა ამისა, CGH ტექნიკას შეუძლია გამოავლინოს მხოლოდ გაუწონასწორებელი ქრომოსომული ანომალიები.
რა არის Array CGH?
Array CGH არის სრულად ავტომატიზირებული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად საცნობარო ნიმუშთან შედარებით. მას აქვს უფრო მაღალი გარჩევადობა და ის შეიქმნა ტრადიციული CGH-ის შეზღუდვების შესამცირებლად. მასივი CGH აერთიანებს CGH-ის პრინციპებს მიკრო მასივების გამოყენებასთან.მეტაფაზური ქრომოსომების გავრცელების გამოყენების ნაცვლად, ეს მეთოდი სამიზნედ იყენებს სლაიდებს, რომლებიც დალაგებულია დნმ-ის მცირე სეგმენტებით. ეს მიკრომასივები გაკეთდა დნმ-ის (ზონდების) მცირე რაოდენობის დეპონირებისა და იმობილიზაციის გზით მყარ შუშის საყრდენზე. ზონდების ზომა შეიძლება განსხვავდებოდეს ოლიგონუკლეოტიდიდან ბაქტერიულ ხელოვნურ ქრომოსომამდე.
სურათი 02: მასივი CGH
მიუხედავად ზონდებისა, CGH მასივის ძირითადი მეთოდი CGH-ის მსგავსია. მიკრო მასივის შემცველი ზონდების მომზადების შემდეგ, დნმ-ის ორი ნიმუში (ტესტი და მითითება) სხვადასხვა ფერის ფტორფორებით ეტიკეტირებულია შერეული და დაემატება მიკრომასიას. ვინაიდან ნიმუშებში დნმ არის ერთჯაჭვიანი დენატურაციის გამო, ეს დნმ ჰიბრიდდება დაწყობილ ერთჯაჭვიან ზონდებთან. ციფრული გამოსახულების სისტემის გამოყენებით, შესაძლებელია ორ წყაროს შორის ქრომოსომული განსხვავებების იდენტიფიცირება.
რა მსგავსებაა CGH-სა და Array CGH-ს შორის?
- CGH და მასივის CGH არის ორი ტექნიკა ასლის რიცხვის ვარიაციების გამოსავლენად.
- ეს არის მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდები.
- ორივე მეთოდი დიაგნოზირებს დაუბალანსებელ ქრომოსომულ ანომალიებს.
- ფტორფორები ჩართულია ორივე მეთოდში.
- ორივე მეთოდი შეიძლება გამოყენებულ იქნას გენეტიკური დარღვევების გამოსავლენად ასლების რიცხვის ვარიაციების გამო.
- ისინი ფართოდ გამოიყენება შედარებით გენომურ ანალიზში.
რა განსხვავებაა CGH და მასივის CGH-ს შორის?
CGH არის ტრადიციული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად, რომელსაც აქვს უფრო დაბალი გარჩევადობა, ხოლო მასივი CGH არის სრულად ავტომატიზირებული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად. რომელსაც აქვს უფრო მაღალი გარჩევადობა. ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება CGH და მასივის CGH-ს შორის.გარდა ამისა, CGH-ში ტესტირებადი და საცნობარო დნმ-ის ნიმუშები ჰიბრიდირებულია ქრომოსომების ნორმალურ მეტაფაზურ გავრცელებასთან, მაგრამ CGH მასივში ტესტირება და საცნობარო დნმ-ის ნიმუშები ჰიბრიდირებულია იმობილიზებულ დნმ-ის ზონდებთან, რომლებიც შეიცავს მიკრორაივს..
ქვემოთ მოცემულ ინფოგრაფიკაში ჩამოთვლილია განსხვავებები CGH-სა და CGH მასივის შორის ცხრილის სახით გვერდიგვერდ შედარებისთვის.
შეჯამება – CGH vs მასივი CGH
CGH და მასივის CGH არის ორი მოლეკულური ციტოგენეტიკური ტექნიკა დაუბალანსებელი ქრომოსომული ანომალიების გამოსავლენად. ისინი ფართოდ გამოიყენება შედარებით გენომურ ანალიზში. CGH არის ტრადიციული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად, რომელსაც აქვს დაბალი გარჩევადობა. ამის საპირისპიროდ, მასივი CGH არის სრულად ავტომატიზირებული მოლეკულური ციტოგენეტიკური მეთოდი ტესტის ნიმუშის დნმ-ში ასლების რაოდენობის ცვალებადობის გასაანალიზებლად, რომელსაც აქვს უფრო მაღალი გარჩევადობა. ამრიგად, ეს აჯამებს განსხვავებას CGH და მასივის CGH-ს შორის.
