MLVA-სა და MLST-ს შორის მთავარი განსხვავება ისაა, რომ MLVA იყენებს თანმიმდევრულად განმეორებადი დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად, ხოლო MLST იყენებს მრავალი სახლის ფრაგმენტების დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად.
მიკრობული ტიპირება ჩვეულებრივ გამოიყენება ინფექციის წყაროსა და მარშრუტების დასადგენად. ის ადასტურებს ან გამორიცხავს ეპიდემიის გავრცელებას. მიკრობული ტიპაჟი ასევე ასახავს ჯანდაცვასთან დაკავშირებული პათოგენების ჯვარედინი გადაცემას და ცნობს ვირუსულ შტამებს. გარდა ამისა, მიკრობული ტიპირება აფასებს პათოგენური მიკრობული სახეობების კონტროლის ღონისძიებების ეფექტურობას. MLVA და MLST არის ორი მოლეკულური ბიოლოგიური ტექნიკა, რომლებიც გამოიყენება მიკრობული ტიპების დროს.
რა არის MLVA?
Multiple Loci VNTR ანალიზი (MLVA) არის მოლეკულური ბიოლოგიური მეთოდი, რომელიც იყენებს თანმიმდევრულად განმეორებადი დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად. ეს არის მეთოდი, რომელიც გამოიყენება კონკრეტული მიკრობული სახეობების გენეტიკური ანალიზისთვის.
MLVA-ს პირველი საფეხურის დროს, თითოეული მიზნობრივი VNTR ლოკუსი გაძლიერებულია PCR-ით ფლანგური რეგიონისთვის სპეციფიკური პრაიმერებით. შემდეგ მიღებული ფრაგმენტები ზომით გამოყოფილია ელექტროფორეზით კაპილარულ სეკვენსერზე. თითოეული ლოკუსის გენოტიპირება და თითოეული ნიმუშიდან შედგენილი შედეგები იძლევა მიკროორგანიზმის დახასიათებას, რომლის სახეობაც ცნობილია. ის ასევე იძლევა ქვესახეობის იდენტიფიცირების საშუალებას ალელის აკრეფისა და MLVA მონაცემთა ბაზებთან შედარების გზით.
სურათი 01: MLVA
ეს MLVA მეთოდი უფრო შერჩევითია, ვიდრე MLST მეთოდი. გარდა ამისა, MLVA მეთოდი არ საჭიროებს დნმ-ის თანმიმდევრობის საფეხურს. ამრიგად, შესაძლებელი ხდება ახლო ქვესახეობების ან კლონური სახეობების დიფერენცირება.
რა არის MLST?
Multilocus sequence typeping (MLST) არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს მრავალი დიასახლისი გენის შიდა ფრაგმენტების დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად. MLST არის ტექნიკა გენეტიკურ ანალიზში მრავლობითი ლოკების ტიპიზაციისთვის.
სურათი 02: MLST
ეს არის თანმიმდევრობის აკრეფის ტიპი, რომელიც გამოიყენება როგორც საცნობარო ტექნიკა მიკრობული სახეობების სხვადასხვა შტამების გამოსაყოფად. ეს მეთოდი ეფუძნება საყოფაცხოვრებო გენების თანმიმდევრობას.დიასახლისი გენები ჩვეულებრივ კოდირებს მიკრობული აგენტების აუცილებელ ცილებს, როგორიცაა ბაქტერია. საყოფაცხოვრებო გენების ამ თანმიმდევრობებს აქვთ დროთა განმავლობაში სტაბილური პოლიმორფიზმის წარმოჩენის თავისებურება. აქედან გამომდინარე, განსხვავებები საყოფაცხოვრებო გენების თანმიმდევრობაში საკმარისად საკმარისია შტამების ერთმანეთისგან განასხვავებისთვის. გარდა ამისა, პირველი MLST სქემა, რომელიც შემუშავდა იყო Neisseria meningitidis, მენინგოკოკური მენინგიტისა და სეპტიცემიის გამომწვევი აგენტი. მისი დანერგვის დღიდან MLST გამოიყენებოდა არა მხოლოდ ადამიანის პათოგენებისთვის, არამედ მცენარეების პათოგენებისთვისაც.
რა მსგავსებაა MLVA-სა და MLST-ს შორის?
- MLVA და MLST არის ორი მოლეკულური ბიოლოგიური ტექნიკა, რომლებიც გამოიყენება მიკრობული ტიპების დროს.
- ორივე ტექნიკა შეიძლება გამოყენებულ იქნას მიკრობული ფილოგენეტიკური ანალიზისთვის.
- ორივე ტექნიკა დაფუძნებულია გენეტიკურ პოლიმორფიზმზე.
- ისინი შეიძლება გამოყენებულ იქნას ადამიანის დაავადებების გამომწვევი მიკრობული პათოგენების გამოსავლენად.
- ორივე ტექნიკა უნდა შესრულდეს გამოცდილი მოლეკულური ბიოლოგების მიერ.
რა განსხვავებაა MLVA-სა და MLST-ს შორის?
MLVA არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს დნმ-ის თანმიმდევრულად განმეორებადი თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად. იმავდროულად, MLST არის ტექნიკა, რომელიც იყენებს მრავალი საყოფაცხოვრებო გენის შიდა ფრაგმენტების დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად. ამრიგად, ეს არის მთავარი განსხვავება MLVA და MLST-ს შორის. გარდა ამისა, MLVA მეთოდი უფრო შერჩევითია, ვიდრე MLST მეთოდი.
ქვემოთ მოცემული ინფოგრაფიკა წარმოგიდგენთ განსხვავებებს MLVA-სა და MLST-ს შორის გვერდიგვერდ შედარებისთვის ცხრილის სახით.
რეზიუმე – MLVA vs MLST
MLVA და MLST არის ორი მოლეკულური ბიოლოგიური ტექნიკა, რომლებიც გამოიყენება მიკრობული ტიპების დროს. MLVA იყენებს თანმიმდევრულად განმეორებადი დნმ-ის თანმიმდევრობის პოლიმორფიზმს მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად, ხოლო MLST იყენებს დნმ-ის თანმიმდევრობების პოლიმორფიზმს მრავალი დიასახლისი გენის შიდა ფრაგმენტების მიკრობული სახეობების დასახასიათებლად.ასე რომ, ეს არის მთავარი განსხვავება MLVA-სა და MLST-ს შორის.
